10370 6T2V C v1-2
10370_6t2v_C_v1-2
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RCSB PDB: 6T2V
EMDB: 10370
Structure title Cryo-EM structure of the RecBCD in complex with Chi-plus2 substrate
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 3.8 Å
Source organism Escherichia coli
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Sequence of
1    ​M​​L​​R​​V​​Y​​H​​S​​N​​R​​L​11   ​D​​V​​L​​E​​A​​L​​M​​E​​F​​I​21   ​V​​E​​R​​E​​R​​L​​D​​D​​P​​F​31   ​E​​P​​E​​M​​I​​L​​V​​Q​​S​​T​41   ​G​​M​​A​​Q​​W​​L​​Q​​M​​T​​L​51   ​S​​Q​​K​​F​​G​​I​​A​​A​​N​​I​61   ​D​​F​​P​​L​​P​​A​​S​​F​​I​​W​71   ​D​​M​​F​​V​​R​​V​​L​​P​​E​​I​81   ​P​​K​​E​​S​​A​​F​​N​​K​​Q​​S​91   ​M​​S​​W​​K​​L​​M​​T​​L​​L​​P​101  ​Q​​L​​L​​E​​R​​E​​D​​F​​T​​L​111  ​L​​R​​H​​Y​​L​​T​​D​​D​​S​​D​121  ​K​​R​​K​​L​​F​​Q​​L​​S​​S​​K​131  ​A​​A​​D​​L​​F​​D​​Q​​Y​​L​​V​141  ​Y​​R​​P​​D​​W​​L​​A​​Q​​W​​E​151  ​T​​G​​H​​L​​V​​E​​G​​L​​G​​E​161  ​A​​Q​​A​​W​​Q​​A​​P​​L​​W​​K​171  ​A​​L​​V​​E​​Y​​T​​H​​Q​​L​​G​181  ​Q​​P​​R​​W​​H​​R​​A​​N​​L​​Y​191  ​Q​​R​​F​​I​​E​​T​​L​​E​​S​​A​201  ​T​​T​​C​​P​​P​​G​​L​​P​​S​​R​211  ​V​​F​​I​​C​​G​​I​​S​​A​​L​​P​221  ​P​​V​​Y​​L​​Q​​A​​L​​Q​​A​​L​231  ​G​​K​​H​​I​​E​​I​​H​​L​​L​​F​241  ​T​​N​​P​​C​​R​​Y​​Y​​W​​G​​D​251  ​I​​K​​D​​P​​A​​Y​​L​​A​​K​​L​261  ​L​​T​​R​​Q​​R​​R​​H​​S​​F​​E​271  ​D​​R​​E​​L​​P​​L​​F​​R​​D​​S​281  ​E​​N​​A​​G​​Q​​L​​F​​N​​S​​D​291  ​G​​E​​Q​​D​​V​​G​​N​​P​​L​​L​301  ​A​​S​​W​​G​​K​​L​​G​​R​​D​​Y​311  ​I​​Y​​L​​L​​S​​D​​L​​E​​S​​S​321  ​Q​​E​​L​​D​​A​​F​​V​​D​​V​​T​331  ​P​​D​​N​​L​​L​​H​​N​​I​​Q​​S​341  ​D​​I​​L​​E​​L​​E​​N​​R​​A​​V​351  ​A​​G​​V​​N​​I​​E​​E​​F​​S​​R​361  ​S​​D​​N​​K​​R​​P​​L​​D​​P​​L​371  ​D​​S​​S​​I​​T​​F​​H​​V​​C​​H​381  ​S​​P​​Q​​R​​E​​V​​E​​V​​L​​H​391  ​D​​R​​L​​L​​A​​M​​L​​E​​E​​D​401  ​P​​T​​L​​T​​P​​R​​D​​I​​I​​V​411  ​M​​V​​A​​D​​I​​D​​S​​Y​​S​​P​421  ​F​​I​​Q​​A​​V​​F​​G​​S​​A​​P​431  ​A​​D​​R​​Y​​L​​P​​Y​​A​​I​​S​441  ​D​​R​​R​​A​​R​​Q​​S​​H​​P​​V​451  ​L​​E​​A​​F​​I​​S​​L​​L​​S​​L​461  ​P​​D​​S​​R​​F​​V​​S​​E​​D​​V​471  ​L​​A​​L​​L​​D​​V​​P​​V​​L​​A​481  ​A​​R​​F​​D​​I​​T​​E​​E​​G​​L​491  ​R​​Y​​L​​R​​Q​​W​​V​​N​​E​​S​501  ​G​​I​​R​​W​​G​​I​​D​​D​​D​​N​511  ​V​​R​​E​​L​​E​​L​​P​​A​​T​​G​521  ​Q​​H​​T​​W​​R​​F​​G​​L​​T​​R​531  ​M​​L​​L​​G​​Y​​A​​M​​E​​S​​A​541  ​Q​​G​​E​​W​​Q​​S​​V​​L​​P​​Y​551  ​D​​E​​S​​S​​G​​L​​I​​A​​E​​L​561  ​V​​G​​H​​L​​A​​S​​L​​L​​M​​Q​571  ​L​​N​​I​​W​​R​​R​​G​​L​​A​​Q​581  ​E​​R​​P​​L​​E​​E​​W​​L​​P​​V​591  ​C​​R​​D​​M​​L​​N​​A​​F​​F​​L​601  ​P​​D​​A​​E​​T​​E​​A​​A​​M​​T​611  ​L​​I​​E​​Q​​Q​​W​​Q​​A​​I​​I​621  ​A​​E​​G​​L​​G​​A​​Q​​Y​​G​​D​631  ​A​​V​​P​​L​​S​​L​​L​​R​​D​​E​641  ​L​​A​​Q​​R​​L​​D​​Q​​E​​R​​I​651  ​S​​Q​​R​​F​​L​​A​​G​​P​​V​​N​661  ​I​​C​​T​​L​​M​​P​​M​​R​​S​​I​671  ​P​​F​​K​​V​​V​​C​​L​​L​​G​​M​681  ​N​​D​​G​​V​​Y​​P​​R​​Q​​L​​A​691  ​P​​L​​G​​F​​D​​L​​M​​S​​Q​​K​701  ​P​​K​​R​​G​​D​​R​​S​​R​​R​​D​711  ​D​​D​​R​​Y​​L​​F​​L​​E​​A​​L​721  ​I​​S​​A​​Q​​Q​​K​​L​​Y​​I​​S​731  ​Y​​I​​G​​R​​S​​I​​Q​​D​​N​​S​741  ​E​​R​​F​​P​​S​​V​​L​​V​​Q​​E​751  ​L​​I​​D​​Y​​I​​G​​Q​​S​​H​​Y​761  ​L​​P​​G​​D​​E​​A​​L​​N​​C​​D​771  ​E​​S​​E​​A​​R​​V​​K​​A​​H​​L​781  ​T​​C​​L​​H​​T​​R​​M​​P​​F​​D​791  ​P​​Q​​N​​Y​​Q​​P​​G​​E​​R​​Q​801  ​S​​Y​​A​​R​​E​​W​​L​​P​​A​​A​811  ​S​​Q​​A​​G​​K​​A​​H​​S​​E​​F​821  ​V​​Q​​P​​L​​P​​F​​T​​L​​P​​E​831  ​T​​V​​P​​L​​E​​T​​L​​Q​​R​​F​841  ​W​​A​​H​​P​​V​​R​​A​​F​​F​​Q​851  ​M​​R​​L​​Q​​V​​N​​F​​R​​T​​E​861  ​D​​S​​E​​I​​P​​D​​T​​E​​P​​F​871  ​I​​L​​E​​G​​L​​S​​R​​Y​​Q​​I​881  ​N​​Q​​Q​​L​​L​​N​​A​​L​​V​​E​891  ​Q​​D​​D​​A​​E​​R​​L​​F​​R​​R​901  ​F​​R​​A​​A​​G​​D​​L​​P​​Y​​G​911  ​A​​F​​G​​E​​I​​F​​W​​E​​T​​Q​921  ​C​​Q​​E​​M​​Q​​Q​​L​​A​​D​​R​931  ​V​​I​​A​​C​​R​​Q​​P​​G​​Q​​S​941  ​M​​E​​I​​D​​L​​A​​C​​N​​G​​V​951  ​Q​​I​​T​​G​​W​​L​​P​​Q​​V​​Q​961  ​P​​D​​G​​L​​L​​R​​W​​R​​P​​S​971  ​L​​L​​S​​V​​A​​Q​​G​​M​​Q​​L​981  ​W​​L​​E​​H​​L​​V​​Y​​C​​A​​S​991  ​G​​G​​N​​G​​E​​S​​R​​L​​F​​L​1001 ​R​​K​​D​​G​​E​​W​​R​​F​​P​​P​1011 ​L​​A​​A​​E​​Q​​A​​L​​H​​Y​​L​1021 ​S​​Q​​L​​I​​E​​G​​Y​​R​​E​​G​1031 ​M​​S​​A​​P​​L​​L​​V​​L​​P​​E​1041 ​S​​G​​G​​A​​W​​L​​K​​T​​C​​Y​1051 ​D​​A​​Q​​N​​D​​A​​M​​L​​D​​D​1061 ​D​​S​​T​​L​​Q​​K​​A​​R​​T​​K​1071 ​F​​L​​Q​​A​​Y​​E​​G​​N​​M​​M​1081 ​V​​R​​G​​E​​G​​D​​D​​I​​W​​Y​1091 ​Q​​R​​L​​W​​R​​Q​​L​​T​​P​​E​1101 ​T​​M​​E​​A​​I​​V​​E​​Q​​S​​Q​1111 ​R​​F​​L​​L​​P​​L​​F​​R​​F​​N​1121 ​Q​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.06 .. 0.97
-0.06
0.97
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
1
MET
0.13
2
2
LEU
0.20
3
3
ARG
0.20
4
4
VAL
0.27
5
5
TYR
0.28
6
6
HIS
0.35
7
7
SER
0.42
8
8
ASN
0.35
9
9
ARG
0.36
10
10
LEU
0.31
11
11
ASP
0.36
12
12
VAL
0.31
13
13
LEU
0.34
14
14
GLU
0.28
15
15
ALA
0.25
16
16
LEU
0.22
17
17
MET
0.22
18
18
GLU
0.33
19
19
PHE
0.39
20
20
ILE
0.41
21
21
VAL
0.38
22
22
GLU
0.38
23
23
ARG
0.40
24
24
GLU
0.35
25
25
ARG
0.31
26
26
LEU
0.29
27
27
ASP
0.40
28
28
ASP
0.43
29
29
PRO
0.47
30
30
PHE
0.52
31
31
GLU
0.53
32
32
PRO
0.54
3D View
Download PDB file DAQ[Cα]
Render Map
Sequence of
1    ​M​​L​​R​​V​​Y​​H​​S​​N​​R​​L​11   ​D​​V​​L​​E​​A​​L​​M​​E​​F​​I​21   ​V​​E​​R​​E​​R​​L​​D​​D​​P​​F​31   ​E​​P​​E​​M​​I​​L​​V​​Q​​S​​T​41   ​G​​M​​A​​Q​​W​​L​​Q​​M​​T​​L​51   ​S​​Q​​K​​F​​G​​I​​A​​A​​N​​I​61   ​D​​F​​P​​L​​P​​A​​S​​F​​I​​W​71   ​D​​M​​F​​V​​R​​V​​L​​P​​E​​I​81   ​P​​K​​E​​S​​A​​F​​N​​K​​Q​​S​91   ​M​​S​​W​​K​​L​​M​​T​​L​​L​​P​101  ​Q​​L​​L​​E​​R​​E​​D​​F​​T​​L​111  ​L​​R​​H​​Y​​L​​T​​D​​D​​S​​D​121  ​K​​R​​K​​L​​F​​Q​​L​​S​​S​​K​131  ​A​​A​​D​​L​​F​​D​​Q​​Y​​L​​V​141  ​Y​​R​​P​​D​​W​​L​​A​​Q​​W​​E​151  ​T​​G​​H​​L​​V​​E​​G​​L​​G​​E​161  ​A​​Q​​A​​W​​Q​​A​​P​​L​​W​​K​171  ​A​​L​​V​​E​​Y​​T​​H​​Q​​L​​G​181  ​Q​​P​​R​​W​​H​​R​​A​​N​​L​​Y​191  ​Q​​R​​F​​I​​E​​T​​L​​E​​S​​A​201  ​T​​T​​C​​P​​P​​G​​L​​P​​S​​R​211  ​V​​F​​I​​C​​G​​I​​S​​A​​L​​P​221  ​P​​V​​Y​​L​​Q​​A​​L​​Q​​A​​L​231  ​G​​K​​H​​I​​E​​I​​H​​L​​L​​F​241  ​T​​N​​P​​C​​R​​Y​​Y​​W​​G​​D​251  ​I​​K​​D​​P​​A​​Y​​L​​A​​K​​L​261  ​L​​T​​R​​Q​​R​​R​​H​​S​​F​​E​271  ​D​​R​​E​​L​​P​​L​​F​​R​​D​​S​281  ​E​​N​​A​​G​​Q​​L​​F​​N​​S​​D​291  ​G​​E​​Q​​D​​V​​G​​N​​P​​L​​L​301  ​A​​S​​W​​G​​K​​L​​G​​R​​D​​Y​311  ​I​​Y​​L​​L​​S​​D​​L​​E​​S​​S​321  ​Q​​E​​L​​D​​A​​F​​V​​D​​V​​T​331  ​P​​D​​N​​L​​L​​H​​N​​I​​Q​​S​341  ​D​​I​​L​​E​​L​​E​​N​​R​​A​​V​351  ​A​​G​​V​​N​​I​​E​​E​​F​​S​​R​361  ​S​​D​​N​​K​​R​​P​​L​​D​​P​​L​371  ​D​​S​​S​​I​​T​​F​​H​​V​​C​​H​381  ​S​​P​​Q​​R​​E​​V​​E​​V​​L​​H​391  ​D​​R​​L​​L​​A​​M​​L​​E​​E​​D​401  ​P​​T​​L​​T​​P​​R​​D​​I​​I​​V​411  ​M​​V​​A​​D​​I​​D​​S​​Y​​S​​P​421  ​F​​I​​Q​​A​​V​​F​​G​​S​​A​​P​431  ​A​​D​​R​​Y​​L​​P​​Y​​A​​I​​S​441  ​D​​R​​R​​A​​R​​Q​​S​​H​​P​​V​451  ​L​​E​​A​​F​​I​​S​​L​​L​​S​​L​461  ​P​​D​​S​​R​​F​​V​​S​​E​​D​​V​471  ​L​​A​​L​​L​​D​​V​​P​​V​​L​​A​481  ​A​​R​​F​​D​​I​​T​​E​​E​​G​​L​491  ​R​​Y​​L​​R​​Q​​W​​V​​N​​E​​S​501  ​G​​I​​R​​W​​G​​I​​D​​D​​D​​N​511  ​V​​R​​E​​L​​E​​L​​P​​A​​T​​G​521  ​Q​​H​​T​​W​​R​​F​​G​​L​​T​​R​531  ​M​​L​​L​​G​​Y​​A​​M​​E​​S​​A​541  ​Q​​G​​E​​W​​Q​​S​​V​​L​​P​​Y​551  ​D​​E​​S​​S​​G​​L​​I​​A​​E​​L​561  ​V​​G​​H​​L​​A​​S​​L​​L​​M​​Q​571  ​L​​N​​I​​W​​R​​R​​G​​L​​A​​Q​581  ​E​​R​​P​​L​​E​​E​​W​​L​​P​​V​591  ​C​​R​​D​​M​​L​​N​​A​​F​​F​​L​601  ​P​​D​​A​​E​​T​​E​​A​​A​​M​​T​611  ​L​​I​​E​​Q​​Q​​W​​Q​​A​​I​​I​621  ​A​​E​​G​​L​​G​​A​​Q​​Y​​G​​D​631  ​A​​V​​P​​L​​S​​L​​L​​R​​D​​E​641  ​L​​A​​Q​​R​​L​​D​​Q​​E​​R​​I​651  ​S​​Q​​R​​F​​L​​A​​G​​P​​V​​N​661  ​I​​C​​T​​L​​M​​P​​M​​R​​S​​I​671  ​P​​F​​K​​V​​V​​C​​L​​L​​G​​M​681  ​N​​D​​G​​V​​Y​​P​​R​​Q​​L​​A​691  ​P​​L​​G​​F​​D​​L​​M​​S​​Q​​K​701  ​P​​K​​R​​G​​D​​R​​S​​R​​R​​D​711  ​D​​D​​R​​Y​​L​​F​​L​​E​​A​​L​721  ​I​​S​​A​​Q​​Q​​K​​L​​Y​​I​​S​731  ​Y​​I​​G​​R​​S​​I​​Q​​D​​N​​S​741  ​E​​R​​F​​P​​S​​V​​L​​V​​Q​​E​751  ​L​​I​​D​​Y​​I​​G​​Q​​S​​H​​Y​761  ​L​​P​​G​​D​​E​​A​​L​​N​​C​​D​771  ​E​​S​​E​​A​​R​​V​​K​​A​​H​​L​781  ​T​​C​​L​​H​​T​​R​​M​​P​​F​​D​791  ​P​​Q​​N​​Y​​Q​​P​​G​​E​​R​​Q​801  ​S​​Y​​A​​R​​E​​W​​L​​P​​A​​A​811  ​S​​Q​​A​​G​​K​​A​​H​​S​​E​​F​821  ​V​​Q​​P​​L​​P​​F​​T​​L​​P​​E​831  ​T​​V​​P​​L​​E​​T​​L​​Q​​R​​F​841  ​W​​A​​H​​P​​V​​R​​A​​F​​F​​Q​851  ​M​​R​​L​​Q​​V​​N​​F​​R​​T​​E​861  ​D​​S​​E​​I​​P​​D​​T​​E​​P​​F​871  ​I​​L​​E​​G​​L​​S​​R​​Y​​Q​​I​881  ​N​​Q​​Q​​L​​L​​N​​A​​L​​V​​E​891  ​Q​​D​​D​​A​​E​​R​​L​​F​​R​​R​901  ​F​​R​​A​​A​​G​​D​​L​​P​​Y​​G​911  ​A​​F​​G​​E​​I​​F​​W​​E​​T​​Q​921  ​C​​Q​​E​​M​​Q​​Q​​L​​A​​D​​R​931  ​V​​I​​A​​C​​R​​Q​​P​​G​​Q​​S​941  ​M​​E​​I​​D​​L​​A​​C​​N​​G​​V​951  ​Q​​I​​T​​G​​W​​L​​P​​Q​​V​​Q​961  ​P​​D​​G​​L​​L​​R​​W​​R​​P​​S​971  ​L​​L​​S​​V​​A​​Q​​G​​M​​Q​​L​981  ​W​​L​​E​​H​​L​​V​​Y​​C​​A​​S​991  ​G​​G​​N​​G​​E​​S​​R​​L​​F​​L​1001 ​R​​K​​D​​G​​E​​W​​R​​F​​P​​P​1011 ​L​​A​​A​​E​​Q​​A​​L​​H​​Y​​L​1021 ​S​​Q​​L​​I​​E​​G​​Y​​R​​E​​G​1031 ​M​​S​​A​​P​​L​​L​​V​​L​​P​​E​1041 ​S​​G​​G​​A​​W​​L​​K​​T​​C​​Y​1051 ​D​​A​​Q​​N​​D​​A​​M​​L​​D​​D​1061 ​D​​S​​T​​L​​Q​​K​​A​​R​​T​​K​1071 ​F​​L​​Q​​A​​Y​​E​​G​​N​​M​​M​1081 ​V​​R​​G​​E​​G​​D​​D​​I​​W​​Y​1091 ​Q​​R​​L​​W​​R​​Q​​L​​T​​P​​E​1101 ​T​​M​​E​​A​​I​​V​​E​​Q​​S​​Q​1111 ​R​​F​​L​​L​​P​​L​​F​​R​​F​​N​1121 ​Q​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.58 .. 0.95
-0.58
0.95
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
1
MET
0.24
2
2
LEU
0.25
3
3
ARG
0.33
4
4
VAL
0.21
5
5
TYR
0.30
6
6
HIS
0.30
7
7
SER
0.30
8
8
ASN
0.35
9
9
ARG
0.39
10
10
LEU
0.39
11
11
ASP
0.50
12
12
VAL
0.55
13
13
LEU
0.56
14
14
GLU
0.53
15
15
ALA
0.50
16
16
LEU
0.50
17
17
MET
0.48
18
18
GLU
0.55
19
19
PHE
0.52
20
20
ILE
0.53
21
21
VAL
0.54
22
22
GLU
0.51
23
23
ARG
0.61
24
24
GLU
0.59
25
25
ARG
0.65
26
26
LEU
0.70
27
27
ASP
0.69
28
28
ASP
0.67
29
29
PRO
0.69
30
30
PHE
0.72
31
31
GLU
0.71
32
32
PRO
0.68
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Sequence of
1    ​M​​L​​R​​V​​Y​​H​​S​​N​​R​​L​11   ​D​​V​​L​​E​​A​​L​​M​​E​​F​​I​21   ​V​​E​​R​​E​​R​​L​​D​​D​​P​​F​31   ​E​​P​​E​​M​​I​​L​​V​​Q​​S​​T​41   ​G​​M​​A​​Q​​W​​L​​Q​​M​​T​​L​51   ​S​​Q​​K​​F​​G​​I​​A​​A​​N​​I​61   ​D​​F​​P​​L​​P​​A​​S​​F​​I​​W​71   ​D​​M​​F​​V​​R​​V​​L​​P​​E​​I​81   ​P​​K​​E​​S​​A​​F​​N​​K​​Q​​S​91   ​M​​S​​W​​K​​L​​M​​T​​L​​L​​P​101  ​Q​​L​​L​​E​​R​​E​​D​​F​​T​​L​111  ​L​​R​​H​​Y​​L​​T​​D​​D​​S​​D​121  ​K​​R​​K​​L​​F​​Q​​L​​S​​S​​K​131  ​A​​A​​D​​L​​F​​D​​Q​​Y​​L​​V​141  ​Y​​R​​P​​D​​W​​L​​A​​Q​​W​​E​151  ​T​​G​​H​​L​​V​​E​​G​​L​​G​​E​161  ​A​​Q​​A​​W​​Q​​A​​P​​L​​W​​K​171  ​A​​L​​V​​E​​Y​​T​​H​​Q​​L​​G​181  ​Q​​P​​R​​W​​H​​R​​A​​N​​L​​Y​191  ​Q​​R​​F​​I​​E​​T​​L​​E​​S​​A​201  ​T​​T​​C​​P​​P​​G​​L​​P​​S​​R​211  ​V​​F​​I​​C​​G​​I​​S​​A​​L​​P​221  ​P​​V​​Y​​L​​Q​​A​​L​​Q​​A​​L​231  ​G​​K​​H​​I​​E​​I​​H​​L​​L​​F​241  ​T​​N​​P​​C​​R​​Y​​Y​​W​​G​​D​251  ​I​​K​​D​​P​​A​​Y​​L​​A​​K​​L​261  ​L​​T​​R​​Q​​R​​R​​H​​S​​F​​E​271  ​D​​R​​E​​L​​P​​L​​F​​R​​D​​S​281  ​E​​N​​A​​G​​Q​​L​​F​​N​​S​​D​291  ​G​​E​​Q​​D​​V​​G​​N​​P​​L​​L​301  ​A​​S​​W​​G​​K​​L​​G​​R​​D​​Y​311  ​I​​Y​​L​​L​​S​​D​​L​​E​​S​​S​321  ​Q​​E​​L​​D​​A​​F​​V​​D​​V​​T​331  ​P​​D​​N​​L​​L​​H​​N​​I​​Q​​S​341  ​D​​I​​L​​E​​L​​E​​N​​R​​A​​V​351  ​A​​G​​V​​N​​I​​E​​E​​F​​S​​R​361  ​S​​D​​N​​K​​R​​P​​L​​D​​P​​L​371  ​D​​S​​S​​I​​T​​F​​H​​V​​C​​H​381  ​S​​P​​Q​​R​​E​​V​​E​​V​​L​​H​391  ​D​​R​​L​​L​​A​​M​​L​​E​​E​​D​401  ​P​​T​​L​​T​​P​​R​​D​​I​​I​​V​411  ​M​​V​​A​​D​​I​​D​​S​​Y​​S​​P​421  ​F​​I​​Q​​A​​V​​F​​G​​S​​A​​P​431  ​A​​D​​R​​Y​​L​​P​​Y​​A​​I​​S​441  ​D​​R​​R​​A​​R​​Q​​S​​H​​P​​V​451  ​L​​E​​A​​F​​I​​S​​L​​L​​S​​L​461  ​P​​D​​S​​R​​F​​V​​S​​E​​D​​V​471  ​L​​A​​L​​L​​D​​V​​P​​V​​L​​A​481  ​A​​R​​F​​D​​I​​T​​E​​E​​G​​L​491  ​R​​Y​​L​​R​​Q​​W​​V​​N​​E​​S​501  ​G​​I​​R​​W​​G​​I​​D​​D​​D​​N​511  ​V​​R​​E​​L​​E​​L​​P​​A​​T​​G​521  ​Q​​H​​T​​W​​R​​F​​G​​L​​T​​R​531  ​M​​L​​L​​G​​Y​​A​​M​​E​​S​​A​541  ​Q​​G​​E​​W​​Q​​S​​V​​L​​P​​Y​551  ​D​​E​​S​​S​​G​​L​​I​​A​​E​​L​561  ​V​​G​​H​​L​​A​​S​​L​​L​​M​​Q​571  ​L​​N​​I​​W​​R​​R​​G​​L​​A​​Q​581  ​E​​R​​P​​L​​E​​E​​W​​L​​P​​V​591  ​C​​R​​D​​M​​L​​N​​A​​F​​F​​L​601  ​P​​D​​A​​E​​T​​E​​A​​A​​M​​T​611  ​L​​I​​E​​Q​​Q​​W​​Q​​A​​I​​I​621  ​A​​E​​G​​L​​G​​A​​Q​​Y​​G​​D​631  ​A​​V​​P​​L​​S​​L​​L​​R​​D​​E​641  ​L​​A​​Q​​R​​L​​D​​Q​​E​​R​​I​651  ​S​​Q​​R​​F​​L​​A​​G​​P​​V​​N​661  ​I​​C​​T​​L​​M​​P​​M​​R​​S​​I​671  ​P​​F​​K​​V​​V​​C​​L​​L​​G​​M​681  ​N​​D​​G​​V​​Y​​P​​R​​Q​​L​​A​691  ​P​​L​​G​​F​​D​​L​​M​​S​​Q​​K​701  ​P​​K​​R​​G​​D​​R​​S​​R​​R​​D​711  ​D​​D​​R​​Y​​L​​F​​L​​E​​A​​L​721  ​I​​S​​A​​Q​​Q​​K​​L​​Y​​I​​S​731  ​Y​​I​​G​​R​​S​​I​​Q​​D​​N​​S​741  ​E​​R​​F​​P​​S​​V​​L​​V​​Q​​E​751  ​L​​I​​D​​Y​​I​​G​​Q​​S​​H​​Y​761  ​L​​P​​G​​D​​E​​A​​L​​N​​C​​D​771  ​E​​S​​E​​A​​R​​V​​K​​A​​H​​L​781  ​T​​C​​L​​H​​T​​R​​M​​P​​F​​D​791  ​P​​Q​​N​​Y​​Q​​P​​G​​E​​R​​Q​801  ​S​​Y​​A​​R​​E​​W​​L​​P​​A​​A​811  ​S​​Q​​A​​G​​K​​A​​H​​S​​E​​F​821  ​V​​Q​​P​​L​​P​​F​​T​​L​​P​​E​831  ​T​​V​​P​​L​​E​​T​​L​​Q​​R​​F​841  ​W​​A​​H​​P​​V​​R​​A​​F​​F​​Q​851  ​M​​R​​L​​Q​​V​​N​​F​​R​​T​​E​861  ​D​​S​​E​​I​​P​​D​​T​​E​​P​​F​871  ​I​​L​​E​​G​​L​​S​​R​​Y​​Q​​I​881  ​N​​Q​​Q​​L​​L​​N​​A​​L​​V​​E​891  ​Q​​D​​D​​A​​E​​R​​L​​F​​R​​R​901  ​F​​R​​A​​A​​G​​D​​L​​P​​Y​​G​911  ​A​​F​​G​​E​​I​​F​​W​​E​​T​​Q​921  ​C​​Q​​E​​M​​Q​​Q​​L​​A​​D​​R​931  ​V​​I​​A​​C​​R​​Q​​P​​G​​Q​​S​941  ​M​​E​​I​​D​​L​​A​​C​​N​​G​​V​951  ​Q​​I​​T​​G​​W​​L​​P​​Q​​V​​Q​961  ​P​​D​​G​​L​​L​​R​​W​​R​​P​​S​971  ​L​​L​​S​​V​​A​​Q​​G​​M​​Q​​L​981  ​W​​L​​E​​H​​L​​V​​Y​​C​​A​​S​991  ​G​​G​​N​​G​​E​​S​​R​​L​​F​​L​1001 ​R​​K​​D​​G​​E​​W​​R​​F​​P​​P​1011 ​L​​A​​A​​E​​Q​​A​​L​​H​​Y​​L​1021 ​S​​Q​​L​​I​​E​​G​​Y​​R​​E​​G​1031 ​M​​S​​A​​P​​L​​L​​V​​L​​P​​E​1041 ​S​​G​​G​​A​​W​​L​​K​​T​​C​​Y​1051 ​D​​A​​Q​​N​​D​​A​​M​​L​​D​​D​1061 ​D​​S​​T​​L​​Q​​K​​A​​R​​T​​K​1071 ​F​​L​​Q​​A​​Y​​E​​G​​N​​M​​M​1081 ​V​​R​​G​​E​​G​​D​​D​​I​​W​​Y​1091 ​Q​​R​​L​​W​​R​​Q​​L​​T​​P​​E​1101 ​T​​M​​E​​A​​I​​V​​E​​Q​​S​​Q​1111 ​R​​F​​L​​L​​P​​L​​F​​R​​F​​N​1121 ​Q​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.75 .. 0.91
-0.75
0.91
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
1
MET
0.76
2
2
LEU
0.73
3
3
ARG
0.73
4
4
VAL
0.73
5
5
TYR
0.73
6
6
HIS
0.74
7
7
SER
0.74
8
8
ASN
0.75
9
9
ARG
0.75
10
10
LEU
0.74
11
11
ASP
0.78
12
12
VAL
0.78
13
13
LEU
0.72
14
14
GLU
0.63
15
15
ALA
0.54
16
16
LEU
0.48
17
17
MET
0.47
18
18
GLU
0.48
19
19
PHE
0.50
20
20
ILE
0.51
21
21
VAL
0.51
22
22
GLU
0.51
23
23
ARG
0.50
24
24
GLU
0.52
25
25
ARG
0.57
26
26
LEU
0.64
27
27
ASP
0.70
28
28
ASP
0.75
29
29
PRO
0.75
30
30
PHE
0.74
31
31
GLU
0.72
32
32
PRO
0.70
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Download PDB file DAQ[Total]
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Converting to mmCIF
SequenceNo structure available
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.82 .. 2.66
-0.82
2.66
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
1
MET
1.12
2
2
LEU
1.19
3
3
ARG
1.26
4
4
VAL
1.21
5
5
TYR
1.32
6
6
HIS
1.39
7
7
SER
1.46
8
8
ASN
1.45
9
9
ARG
1.50
10
10
LEU
1.43
11
11
ASP
1.65
12
12
VAL
1.64
13
13
LEU
1.62
14
14
GLU
1.44
15
15
ALA
1.29
16
16
LEU
1.20
17
17
MET
1.16
18
18
GLU
1.36
19
19
PHE
1.42
20
20
ILE
1.45
21
21
VAL
1.42
22
22
GLU
1.40
23
23
ARG
1.51
24
24
GLU
1.46
25
25
ARG
1.53
26
26
LEU
1.63
27
27
ASP
1.79
28
28
ASP
1.85
29
29
PRO
1.92
30
30
PHE
1.98
31
31
GLU
1.97
32
32
PRO
1.93