13529 7PMD C v1-0
Structure title Cryo-EM structure of the actomyosin-V complex in the post-rigor transition state (AppNHp, central 1er)
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 2.9 Å
Source organism Oryctolagus cuniculus

Sequence of
4    ​E​​T​​T​​A​​L​​V​​C​​D​​N​​G​14   ​S​​G​​L​​V​​K​​A​​G​​F​​A​​G​24   ​D​​D​​A​​P​​R​​A​​V​​F​​P​​S​34   ​I​​V​​G​​R​​P​​R​​H​​Q​​G​​V​44   ​M​​V​​G​​M​​G​​Q​​K​​D​​S​​Y​54   ​V​​G​​D​​E​​A​​Q​​S​​K​​R​​G​64   ​I​​L​​T​​L​​K​​Y​​P​​I​​E​​G​75   ​I​​I​​T​​N​​W​​D​​D​​M​​E​​K​85   ​I​​W​​H​​H​​T​​F​​Y​​N​​E​​L​95   ​R​​V​​A​​P​​E​​E​​H​​P​​T​​L​105  ​L​​T​​E​​A​​P​​L​​N​​P​​K​​A​115  ​N​​R​​E​​K​​M​​T​​Q​​I​​M​​F​125  ​E​​T​​F​​N​​V​​P​​A​​M​​Y​​V​135  ​A​​I​​Q​​A​​V​​L​​S​​L​​Y​​A​145  ​S​​G​​R​​T​​T​​G​​I​​V​​L​​D​155  ​S​​G​​D​​G​​V​​T​​H​​N​​V​​P​165  ​I​​Y​​E​​G​​Y​​A​​L​​P​​H​​A​175  ​I​​M​​R​​L​​D​​L​​A​​G​​R​​D​185  ​L​​T​​D​​Y​​L​​M​​K​​I​​L​​T​195  ​E​​R​​G​​Y​​S​​F​​V​​T​​T​​A​205  ​E​​R​​E​​I​​V​​R​​D​​I​​K​​E​215  ​K​​L​​C​​Y​​V​​A​​L​​D​​F​​E​225  ​N​​E​​M​​A​​T​​A​​A​​S​​S​​S​235  ​S​​L​​E​​K​​S​​Y​​E​​L​​P​​D​245  ​G​​Q​​V​​I​​T​​I​​G​​N​​E​​R​255  ​F​​R​​C​​P​​E​​T​​L​​F​​Q​​P​265  ​S​​F​​I​​G​​M​​E​​S​​A​​G​​I​275  ​H​​E​​T​​T​​Y​​N​​S​​I​​M​​K​285  ​C​​D​​I​​D​​I​​R​​K​​D​​L​​Y​295  ​A​​N​​N​​V​​M​​S​​G​​G​​T​​T​305  ​M​​Y​​P​​G​​I​​A​​D​​R​​M​​Q​315  ​K​​E​​I​​T​​A​​L​​A​​P​​S​​T​325  ​M​​K​​I​​K​​I​​I​​A​​P​​P​​E​335  ​R​​K​​Y​​S​​V​​W​​I​​G​​G​​S​345  ​I​​L​​A​​S​​L​​S​​T​​F​​Q​​Q​355  ​M​​W​​I​​T​​K​​Q​​E​​Y​​D​​E​365  ​A​​G​​P​​S​​I​​V​​H​​R​​K​​C​375  ​F​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.32 .. 1.60
0.32
1.60
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
4
GLU
1.24
2
5
THR
1.23
3
6
THR
1.14
4
7
ALA
1.06
5
8
LEU
1.12
6
9
VAL
1.08
7
10
CYS
1.07
8
11
ASP
1.09
9
12
ASN
1.11
10
13
GLY
1.14
11
14
SER
1.24
12
15
GLY
1.31
13
16
LEU
1.37
14
17
VAL
1.27
15
18
LYS
1.27
16
19
ALA
1.25
17
20
GLY
1.28
18
21
PHE
1.34
19
22
ALA
1.39
20
23
GLY
1.37
21
24
ASP
1.32
22
25
ASP
1.37
23
26
ALA
1.47
24
27
PRO
1.44
25
28
ARG
1.51
26
29
ALA
1.55
27
30
VAL
1.36
28
31
PHE
1.27
29
32
PRO
1.22
30
33
SER
1.06
31
34
ILE
0.94
32
35
VAL
0.89
Sequence of
4    ​E​​T​​T​​A​​L​​V​​C​​D​​N​​G​14   ​S​​G​​L​​V​​K​​A​​G​​F​​A​​G​24   ​D​​D​​A​​P​​R​​A​​V​​F​​P​​S​34   ​I​​V​​G​​R​​P​​R​​H​​Q​​G​​V​44   ​M​​V​​G​​M​​G​​Q​​K​​D​​S​​Y​54   ​V​​G​​D​​E​​A​​Q​​S​​K​​R​​G​64   ​I​​L​​T​​L​​K​​Y​​P​​I​​E​​G​75   ​I​​I​​T​​N​​W​​D​​D​​M​​E​​K​85   ​I​​W​​H​​H​​T​​F​​Y​​N​​E​​L​95   ​R​​V​​A​​P​​E​​E​​H​​P​​T​​L​105  ​L​​T​​E​​A​​P​​L​​N​​P​​K​​A​115  ​N​​R​​E​​K​​M​​T​​Q​​I​​M​​F​125  ​E​​T​​F​​N​​V​​P​​A​​M​​Y​​V​135  ​A​​I​​Q​​A​​V​​L​​S​​L​​Y​​A​145  ​S​​G​​R​​T​​T​​G​​I​​V​​L​​D​155  ​S​​G​​D​​G​​V​​T​​H​​N​​V​​P​165  ​I​​Y​​E​​G​​Y​​A​​L​​P​​H​​A​175  ​I​​M​​R​​L​​D​​L​​A​​G​​R​​D​185  ​L​​T​​D​​Y​​L​​M​​K​​I​​L​​T​195  ​E​​R​​G​​Y​​S​​F​​V​​T​​T​​A​205  ​E​​R​​E​​I​​V​​R​​D​​I​​K​​E​215  ​K​​L​​C​​Y​​V​​A​​L​​D​​F​​E​225  ​N​​E​​M​​A​​T​​A​​A​​S​​S​​S​235  ​S​​L​​E​​K​​S​​Y​​E​​L​​P​​D​245  ​G​​Q​​V​​I​​T​​I​​G​​N​​E​​R​255  ​F​​R​​C​​P​​E​​T​​L​​F​​Q​​P​265  ​S​​F​​I​​G​​M​​E​​S​​A​​G​​I​275  ​H​​E​​T​​T​​Y​​N​​S​​I​​M​​K​285  ​C​​D​​I​​D​​I​​R​​K​​D​​L​​Y​295  ​A​​N​​N​​V​​M​​S​​G​​G​​T​​T​305  ​M​​Y​​P​​G​​I​​A​​D​​R​​M​​Q​315  ​K​​E​​I​​T​​A​​L​​A​​P​​S​​T​325  ​M​​K​​I​​K​​I​​I​​A​​P​​P​​E​335  ​R​​K​​Y​​S​​V​​W​​I​​G​​G​​S​345  ​I​​L​​A​​S​​L​​S​​T​​F​​Q​​Q​355  ​M​​W​​I​​T​​K​​Q​​E​​Y​​D​​E​365  ​A​​G​​P​​S​​I​​V​​H​​R​​K​​C​375  ​F​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.14 .. 1.26
0.14
1.26
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
4
GLU
0.78
2
5
THR
0.80
3
6
THR
0.79
4
7
ALA
0.70
5
8
LEU
0.78
6
9
VAL
0.83
7
10
CYS
0.83
8
11
ASP
0.80
9
12
ASN
0.82
10
13
GLY
0.82
11
14
SER
0.86
12
15
GLY
0.84
13
16
LEU
0.81
14
17
VAL
0.76
15
18
LYS
0.72
16
19
ALA
0.77
17
20
GLY
0.76
18
21
PHE
0.78
19
22
ALA
0.75
20
23
GLY
0.79
21
24
ASP
0.81
22
25
ASP
0.86
23
26
ALA
0.94
24
27
PRO
0.90
25
28
ARG
0.90
26
29
ALA
0.90
27
30
VAL
0.93
28
31
PHE
0.85
29
32
PRO
0.85
30
33
SER
0.86
31
34
ILE
0.93
32
35
VAL
1.00
Sequence of
4    ​E​​T​​T​​A​​L​​V​​C​​D​​N​​G​14   ​S​​G​​L​​V​​K​​A​​G​​F​​A​​G​24   ​D​​D​​A​​P​​R​​A​​V​​F​​P​​S​34   ​I​​V​​G​​R​​P​​R​​H​​Q​​G​​V​44   ​M​​V​​G​​M​​G​​Q​​K​​D​​S​​Y​54   ​V​​G​​D​​E​​A​​Q​​S​​K​​R​​G​64   ​I​​L​​T​​L​​K​​Y​​P​​I​​E​​G​75   ​I​​I​​T​​N​​W​​D​​D​​M​​E​​K​85   ​I​​W​​H​​H​​T​​F​​Y​​N​​E​​L​95   ​R​​V​​A​​P​​E​​E​​H​​P​​T​​L​105  ​L​​T​​E​​A​​P​​L​​N​​P​​K​​A​115  ​N​​R​​E​​K​​M​​T​​Q​​I​​M​​F​125  ​E​​T​​F​​N​​V​​P​​A​​M​​Y​​V​135  ​A​​I​​Q​​A​​V​​L​​S​​L​​Y​​A​145  ​S​​G​​R​​T​​T​​G​​I​​V​​L​​D​155  ​S​​G​​D​​G​​V​​T​​H​​N​​V​​P​165  ​I​​Y​​E​​G​​Y​​A​​L​​P​​H​​A​175  ​I​​M​​R​​L​​D​​L​​A​​G​​R​​D​185  ​L​​T​​D​​Y​​L​​M​​K​​I​​L​​T​195  ​E​​R​​G​​Y​​S​​F​​V​​T​​T​​A​205  ​E​​R​​E​​I​​V​​R​​D​​I​​K​​E​215  ​K​​L​​C​​Y​​V​​A​​L​​D​​F​​E​225  ​N​​E​​M​​A​​T​​A​​A​​S​​S​​S​235  ​S​​L​​E​​K​​S​​Y​​E​​L​​P​​D​245  ​G​​Q​​V​​I​​T​​I​​G​​N​​E​​R​255  ​F​​R​​C​​P​​E​​T​​L​​F​​Q​​P​265  ​S​​F​​I​​G​​M​​E​​S​​A​​G​​I​275  ​H​​E​​T​​T​​Y​​N​​S​​I​​M​​K​285  ​C​​D​​I​​D​​I​​R​​K​​D​​L​​Y​295  ​A​​N​​N​​V​​M​​S​​G​​G​​T​​T​305  ​M​​Y​​P​​G​​I​​A​​D​​R​​M​​Q​315  ​K​​E​​I​​T​​A​​L​​A​​P​​S​​T​325  ​M​​K​​I​​K​​I​​I​​A​​P​​P​​E​335  ​R​​K​​Y​​S​​V​​W​​I​​G​​G​​S​345  ​I​​L​​A​​S​​L​​S​​T​​F​​Q​​Q​355  ​M​​W​​I​​T​​K​​Q​​E​​Y​​D​​E​365  ​A​​G​​P​​S​​I​​V​​H​​R​​K​​C​375  ​F​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.48 .. 1.02
-0.48
1.02
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
4
GLU
0.62
2
5
THR
0.63
3
6
THR
0.57
4
7
ALA
0.59
5
8
LEU
0.65
6
9
VAL
0.70
7
10
CYS
0.74
8
11
ASP
0.77
9
12
ASN
0.78
10
13
GLY
0.76
11
14
SER
0.80
12
15
GLY
0.84
13
16
LEU
0.87
14
17
VAL
0.88
15
18
LYS
0.84
16
19
ALA
0.79
17
20
GLY
0.77
18
21
PHE
0.79
19
22
ALA
0.82
20
23
GLY
0.80
21
24
ASP
0.78
22
25
ASP
0.79
23
26
ALA
0.74
24
27
PRO
0.65
25
28
ARG
0.58
26
29
ALA
0.48
27
30
VAL
0.42
28
31
PHE
0.37
29
32
PRO
0.33
30
33
SER
0.27
31
34
ILE
0.17
32
35
VAL
0.03
Sequence of
4    ​E​​T​​T​​A​​L​​V​​C​​D​​N​​G​14   ​S​​G​​L​​V​​K​​A​​G​​F​​A​​G​24   ​D​​D​​A​​P​​R​​A​​V​​F​​P​​S​34   ​I​​V​​G​​R​​P​​R​​H​​Q​​G​​V​44   ​M​​V​​G​​M​​G​​Q​​K​​D​​S​​Y​54   ​V​​G​​D​​E​​A​​Q​​S​​K​​R​​G​64   ​I​​L​​T​​L​​K​​Y​​P​​I​​E​​G​75   ​I​​I​​T​​N​​W​​D​​D​​M​​E​​K​85   ​I​​W​​H​​H​​T​​F​​Y​​N​​E​​L​95   ​R​​V​​A​​P​​E​​E​​H​​P​​T​​L​105  ​L​​T​​E​​A​​P​​L​​N​​P​​K​​A​115  ​N​​R​​E​​K​​M​​T​​Q​​I​​M​​F​125  ​E​​T​​F​​N​​V​​P​​A​​M​​Y​​V​135  ​A​​I​​Q​​A​​V​​L​​S​​L​​Y​​A​145  ​S​​G​​R​​T​​T​​G​​I​​V​​L​​D​155  ​S​​G​​D​​G​​V​​T​​H​​N​​V​​P​165  ​I​​Y​​E​​G​​Y​​A​​L​​P​​H​​A​175  ​I​​M​​R​​L​​D​​L​​A​​G​​R​​D​185  ​L​​T​​D​​Y​​L​​M​​K​​I​​L​​T​195  ​E​​R​​G​​Y​​S​​F​​V​​T​​T​​A​205  ​E​​R​​E​​I​​V​​R​​D​​I​​K​​E​215  ​K​​L​​C​​Y​​V​​A​​L​​D​​F​​E​225  ​N​​E​​M​​A​​T​​A​​A​​S​​S​​S​235  ​S​​L​​E​​K​​S​​Y​​E​​L​​P​​D​245  ​G​​Q​​V​​I​​T​​I​​G​​N​​E​​R​255  ​F​​R​​C​​P​​E​​T​​L​​F​​Q​​P​265  ​S​​F​​I​​G​​M​​E​​S​​A​​G​​I​275  ​H​​E​​T​​T​​Y​​N​​S​​I​​M​​K​285  ​C​​D​​I​​D​​I​​R​​K​​D​​L​​Y​295  ​A​​N​​N​​V​​M​​S​​G​​G​​T​​T​305  ​M​​Y​​P​​G​​I​​A​​D​​R​​M​​Q​315  ​K​​E​​I​​T​​A​​L​​A​​P​​S​​T​325  ​M​​K​​I​​K​​I​​I​​A​​P​​P​​E​335  ​R​​K​​Y​​S​​V​​W​​I​​G​​G​​S​345  ​I​​L​​A​​S​​L​​S​​T​​F​​Q​​Q​355  ​M​​W​​I​​T​​K​​Q​​E​​Y​​D​​E​365  ​A​​G​​P​​S​​I​​V​​H​​R​​K​​C​375  ​F​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.76 .. 3.32
0.76
3.32
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
4
GLU
2.65
2
5
THR
2.65
3
6
THR
2.50
4
7
ALA
2.35
5
8
LEU
2.55
6
9
VAL
2.61
7
10
CYS
2.64
8
11
ASP
2.67
9
12
ASN
2.71
10
13
GLY
2.73
11
14
SER
2.90
12
15
GLY
2.99
13
16
LEU
3.05
14
17
VAL
2.91
15
18
LYS
2.83
16
19
ALA
2.81
17
20
GLY
2.80
18
21
PHE
2.92
19
22
ALA
2.96
20
23
GLY
2.97
21
24
ASP
2.91
22
25
ASP
3.02
23
26
ALA
3.15
24
27
PRO
2.99
25
28
ARG
2.99
26
29
ALA
2.93
27
30
VAL
2.72
28
31
PHE
2.49
29
32
PRO
2.39
30
33
SER
2.18
31
34
ILE
2.05
32
35
VAL
1.92