13579 7PP4 d v1-1
Structure title Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase holoenzyme comprising sigma factor SigB
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 3.84 Å
Source organism Mycobacterium tuberculosis H37Rv

Sequence of
4    ​V​​N​​F​​F​​D​​E​​L​​R​​I​​G​14   ​L​​A​​T​​A​​E​​D​​I​​R​​Q​​W​24   ​S​​Y​​G​​E​​V​​K​​K​​P​​E​​T​34   ​I​​N​​Y​​R​​T​​L​​K​​P​​E​​K​44   ​D​​G​​L​​F​​C​​E​​K​​I​​F​​G​54   ​P​​T​​R​​D​​W​​E​​C​​Y​​C​​G​64   ​K​​Y​​K​​R​​V​​R​​F​​K​​G​​I​74   ​I​​C​​E​​R​​C​​G​​V​​E​​V​​T​84   ​R​​A​​K​​V​​R​​R​​E​​R​​M​​G​94   ​H​​I​​E​​L​​A​​A​​P​​V​​T​​H​104  ​I​​W​​Y​​F​​K​​G​​V​​P​​S​​R​114  ​L​​G​​Y​​L​​L​​D​​L​​A​​P​​K​124  ​D​​L​​E​​K​​I​​I​​Y​​F​​A​​A​134  ​Y​​V​​I​​T​​S​​V​​D​​E​​E​​M​144  ​R​​H​​N​​E​​L​​S​​T​​L​​E​​A​154  ​E​​M​​A​​V​​E​​R​​K​​A​​V​​E​164  ​D​​Q​​R​​D​​G​​E​​L​​E​​A​​R​174  ​A​​Q​​K​​L​​E​​A​​D​​L​​A​​E​184  ​L​​E​​A​​E​​G​​A​​K​​A​​D​​A​194  ​R​​R​​K​​V​​R​​D​​G​​G​​E​​R​204  ​E​​M​​R​​Q​​I​​R​​D​​R​​A​​Q​214  ​R​​E​​L​​D​​R​​L​​E​​D​​I​​W​224  ​S​​T​​F​​T​​K​​L​​A​​P​​K​​Q​234  ​L​​I​​V​​D​​E​​N​​L​​Y​​R​​E​244  ​L​​V​​D​​R​​Y​​G​​E​​Y​​F​​T​254  ​G​​A​​M​​G​​A​​E​​S​​I​​Q​​K​264  ​L​​I​​E​​N​​F​​D​​I​​D​​A​​E​274  ​A​​E​​S​​L​​R​​D​​V​​I​​R​​N​284  ​G​​K​​G​​Q​​K​​K​​L​​R​​A​​L​294  ​K​​R​​L​​K​​V​​V​​A​​A​​F​​Q​304  ​Q​​S​​G​​N​​S​​P​​M​​G​​M​​V​314  ​L​​D​​A​​V​​P​​V​​I​​P​​P​​E​324  ​L​​R​​P​​M​​V​​Q​​L​​D​​G​​G​334  ​R​​F​​A​​T​​S​​D​​L​​N​​D​​L​344  ​Y​​R​​R​​V​​I​​N​​R​​N​​N​​R​354  ​L​​K​​R​​L​​I​​D​​L​​G​​A​​P​364  ​E​​I​​I​​V​​N​​N​​E​​K​​R​​M​374  ​L​​Q​​E​​S​​V​​D​​A​​L​​F​​D​384  ​N​​G​​R​​R​​G​​R​​P​​V​​T​​G​394  ​P​​G​​N​​R​​P​​L​​K​​S​​L​​S​404  ​D​​L​​L​​K​​G​​K​​Q​​G​​R​​F​414  ​R​​Q​​N​​L​​L​​G​​K​​R​​V​​D​424  ​Y​​S​​G​​R​​S​​V​​I​​V​​V​​G​434  ​P​​Q​​L​​K​​L​​H​​Q​​C​​G​​L​444  ​P​​K​​L​​M​​A​​L​​E​​L​​F​​K​454  ​P​​F​​V​​M​​K​​R​​L​​V​​D​​L​464  ​N​​H​​A​​Q​​N​​I​​K​​S​​A​​K​474  ​R​​M​​V​​E​​R​​Q​​R​​P​​Q​​V​484  ​W​​D​​V​​L​​E​​E​​V​​I​​A​​E​494  ​H​​P​​V​​L​​L​​N​​R​​A​​P​​T​504  ​L​​H​​R​​L​​G​​I​​Q​​A​​F​​E​514  ​P​​M​​L​​V​​E​​G​​K​​A​​I​​Q​524  ​L​​H​​P​​L​​V​​C​​E​​A​​F​​N​534  ​A​​D​​F​​D​​G​​D​​Q​​M​​A​​V​544  ​H​​L​​P​​L​​S​​A​​E​​A​​Q​​A​554  ​E​​A​​R​​I​​L​​M​​L​​S​​S​​N​564  ​N​​I​​L​​S​​P​​A​​S​​G​​R​​P​574  ​L​​A​​M​​P​​R​​L​​D​​M​​V​​T​584  ​G​​L​​Y​​Y​​L​​T​​T​​E​​V​​P​594  ​G​​D​​T​​G​​E​​Y​​Q​​P​​A​​S​604  ​G​​D​​H​​P​​E​​T​​G​​V​​Y​​S​614  ​S​​P​​A​​E​​A​​I​​M​​A​​A​​D​624  ​R​​G​​V​​L​​S​​V​​R​​A​​K​​I​634  ​K​​V​​R​​L​​T​​Q​​L​​R​​P​​P​644  ​V​​E​​I​​E​​A​​E​​L​​F​​G​​H​654  ​S​​G​​W​​Q​​P​​G​​D​​A​​W​​M​664  ​A​​E​​T​​T​​L​​G​​R​​V​​M​​F​674  ​N​​E​​L​​L​​P​​L​​G​​Y​​P​​F​684  ​V​​N​​K​​Q​​M​​H​​K​​K​​V​​Q​694  ​A​​A​​I​​I​​N​​D​​L​​A​​E​​R​704  ​Y​​P​​M​​I​​V​​V​​A​​Q​​T​​V​714  ​D​​K​​L​​K​​D​​A​​G​​F​​Y​​W​724  ​A​​T​​R​​S​​G​​V​​T​​V​​S​​M​734  ​A​​D​​V​​L​​V​​P​​P​​R​​K​​K​744  ​E​​I​​L​​D​​H​​Y​​E​​E​​R​​A​754  ​D​​K​​V​​E​​K​​Q​​F​​Q​​R​​G​764  ​A​​L​​N​​H​​D​​E​​R​​N​​E​​A​774  ​L​​V​​E​​I​​W​​K​​E​​A​​T​​D​784  ​E​​V​​G​​Q​​A​​L​​R​​E​​H​​Y​794  ​P​​D​​D​​N​​P​​I​​I​​T​​I​​V​804  ​D​​S​​G​​A​​T​​G​​N​​F​​T​​Q​814  ​T​​R​​T​​L​​A​​G​​M​​K​​G​​L​824  ​V​​T​​N​​P​​K​​G​​E​​F​​I​​P​834  ​R​​P​​V​​K​​S​​S​​F​​R​​E​​G​844  ​L​​T​​V​​L​​E​​Y​​F​​I​​N​​T​854  ​H​​G​​A​​R​​K​​G​​L​​A​​D​​T​864  ​A​​L​​R​​T​​A​​D​​S​​G​​Y​​L​874  ​T​​R​​R​​L​​V​​D​​V​​S​​Q​​D​884  ​V​​I​​V​​R​​E​​H​​D​​C​​Q​​T​894  ​E​​R​​G​​I​​V​​V​​E​​L​​A​​E​904  ​R​​A​​P​​D​​G​​T​​L​​I​​R​​D​914  ​P​​Y​​I​​E​​T​​S​​A​​Y​​A​​R​924  ​T​​L​​G​​T​​D​​A​​V​​D​​E​​A​934  ​G​​N​​V​​I​​V​​E​​R​​G​​Q​​D​944  ​L​​G​​D​​P​​E​​I​​D​​A​​L​​L​954  ​A​​A​​G​​I​​T​​Q​​V​​K​​V​​R​964  ​S​​V​​L​​T​​C​​A​​T​​S​​T​​G​974  ​V​​C​​A​​T​​C​​Y​​G​​R​​S​​M​984  ​A​​T​​G​​K​​L​​V​​D​​I​​G​​E​994  ​A​​V​​G​​I​​V​​A​​A​​Q​​S​​I​1004 ​G​​E​​P​​G​​T​​Q​​L​​T​​M​​I​1025 ​T​​G​​G​​L​​P​​R​​V​​Q​​E​​L​1035 ​F​​E​​A​​R​​V​​P​​R​​G​​K​​A​1045 ​P​​I​​A​​D​​V​​T​​G​​R​​V​​R​1055 ​L​​E​​D​​G​​E​​R​​F​​Y​​K​​I​1065 ​T​​I​​V​​P​​D​​D​​G​​G​​E​​E​1075 ​V​​V​​Y​​D​​K​​I​​S​​K​​R​​Q​1085 ​R​​L​​R​​V​​F​​K​​H​​E​​D​​G​1095 ​S​​E​​R​​V​​L​​S​​D​​G​​D​​H​1105 ​V​​E​​V​​G​​Q​​Q​​L​​M​​E​​G​1115 ​S​​A​​D​​P​​H​​E​​V​​L​​R​​V​1125 ​Q​​G​​P​​R​​E​​V​​Q​​I​​H​​L​1135 ​V​​R​​E​​V​​Q​​E​​V​​Y​​R​​A​1145 ​Q​​G​​V​​S​​I​​H​​D​​K​​H​​I​1155 ​E​​V​​I​​V​​R​​Q​​M​​L​​R​​R​1165 ​V​​T​​I​​I​​D​​S​​G​​S​​T​​E​1175 ​F​​L​​P​​G​​S​​L​​I​​D​​R​​A​1185 ​E​​F​​E​​A​​E​​N​​R​​R​​V​​V​1195 ​A​​E​​G​​G​​E​​P​​A​​A​​G​​R​1205 ​P​​V​​L​​M​​G​​I​​T​​K​​A​​S​1215 ​L​​A​​T​​D​​S​​W​​L​​S​​A​​A​1225 ​S​​F​​Q​​E​​T​​T​​R​​V​​L​​T​1235 ​D​​A​​A​​I​​N​​C​​R​​S​​D​​K​1245 ​L​​N​​G​​L​​K​​E​​N​​V​​I​​I​1255 ​G​​K​​L​​I​​P​​A​​G​​T​​G​​I​1265 ​N​​R​​Y​​R​​N​​I​​A​​V​​Q​​P​1275 ​T​​E​​E​​A​​R​​A​​A​​A​​Y​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.43 .. 1.43
-0.43
1.43
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
4
VAL
0.73
2
5
ASN
0.78
3
6
PHE
0.71
4
7
PHE
0.70
5
8
ASP
0.64
6
9
GLU
0.66
7
10
LEU
0.66
8
11
ARG
0.68
9
12
ILE
0.67
10
13
GLY
0.67
11
14
LEU
0.70
12
15
ALA
0.76
13
16
THR
0.84
14
17
ALA
0.90
15
18
GLU
0.88
16
19
ASP
0.83
17
20
ILE
0.76
18
21
ARG
0.59
19
22
GLN
0.46
20
23
TRP
0.39
21
24
SER
0.31
22
25
TYR
0.33
23
26
GLY
0.32
24
27
GLU
0.31
25
28
VAL
0.23
26
29
LYS
0.21
27
30
LYS
0.13
28
31
PRO
0.12
29
32
GLU
0.05
30
33
THR
0.05
31
34
ILE
0.09
32
35
ASN
-0.03
Sequence of
4    ​V​​N​​F​​F​​D​​E​​L​​R​​I​​G​14   ​L​​A​​T​​A​​E​​D​​I​​R​​Q​​W​24   ​S​​Y​​G​​E​​V​​K​​K​​P​​E​​T​34   ​I​​N​​Y​​R​​T​​L​​K​​P​​E​​K​44   ​D​​G​​L​​F​​C​​E​​K​​I​​F​​G​54   ​P​​T​​R​​D​​W​​E​​C​​Y​​C​​G​64   ​K​​Y​​K​​R​​V​​R​​F​​K​​G​​I​74   ​I​​C​​E​​R​​C​​G​​V​​E​​V​​T​84   ​R​​A​​K​​V​​R​​R​​E​​R​​M​​G​94   ​H​​I​​E​​L​​A​​A​​P​​V​​T​​H​104  ​I​​W​​Y​​F​​K​​G​​V​​P​​S​​R​114  ​L​​G​​Y​​L​​L​​D​​L​​A​​P​​K​124  ​D​​L​​E​​K​​I​​I​​Y​​F​​A​​A​134  ​Y​​V​​I​​T​​S​​V​​D​​E​​E​​M​144  ​R​​H​​N​​E​​L​​S​​T​​L​​E​​A​154  ​E​​M​​A​​V​​E​​R​​K​​A​​V​​E​164  ​D​​Q​​R​​D​​G​​E​​L​​E​​A​​R​174  ​A​​Q​​K​​L​​E​​A​​D​​L​​A​​E​184  ​L​​E​​A​​E​​G​​A​​K​​A​​D​​A​194  ​R​​R​​K​​V​​R​​D​​G​​G​​E​​R​204  ​E​​M​​R​​Q​​I​​R​​D​​R​​A​​Q​214  ​R​​E​​L​​D​​R​​L​​E​​D​​I​​W​224  ​S​​T​​F​​T​​K​​L​​A​​P​​K​​Q​234  ​L​​I​​V​​D​​E​​N​​L​​Y​​R​​E​244  ​L​​V​​D​​R​​Y​​G​​E​​Y​​F​​T​254  ​G​​A​​M​​G​​A​​E​​S​​I​​Q​​K​264  ​L​​I​​E​​N​​F​​D​​I​​D​​A​​E​274  ​A​​E​​S​​L​​R​​D​​V​​I​​R​​N​284  ​G​​K​​G​​Q​​K​​K​​L​​R​​A​​L​294  ​K​​R​​L​​K​​V​​V​​A​​A​​F​​Q​304  ​Q​​S​​G​​N​​S​​P​​M​​G​​M​​V​314  ​L​​D​​A​​V​​P​​V​​I​​P​​P​​E​324  ​L​​R​​P​​M​​V​​Q​​L​​D​​G​​G​334  ​R​​F​​A​​T​​S​​D​​L​​N​​D​​L​344  ​Y​​R​​R​​V​​I​​N​​R​​N​​N​​R​354  ​L​​K​​R​​L​​I​​D​​L​​G​​A​​P​364  ​E​​I​​I​​V​​N​​N​​E​​K​​R​​M​374  ​L​​Q​​E​​S​​V​​D​​A​​L​​F​​D​384  ​N​​G​​R​​R​​G​​R​​P​​V​​T​​G​394  ​P​​G​​N​​R​​P​​L​​K​​S​​L​​S​404  ​D​​L​​L​​K​​G​​K​​Q​​G​​R​​F​414  ​R​​Q​​N​​L​​L​​G​​K​​R​​V​​D​424  ​Y​​S​​G​​R​​S​​V​​I​​V​​V​​G​434  ​P​​Q​​L​​K​​L​​H​​Q​​C​​G​​L​444  ​P​​K​​L​​M​​A​​L​​E​​L​​F​​K​454  ​P​​F​​V​​M​​K​​R​​L​​V​​D​​L​464  ​N​​H​​A​​Q​​N​​I​​K​​S​​A​​K​474  ​R​​M​​V​​E​​R​​Q​​R​​P​​Q​​V​484  ​W​​D​​V​​L​​E​​E​​V​​I​​A​​E​494  ​H​​P​​V​​L​​L​​N​​R​​A​​P​​T​504  ​L​​H​​R​​L​​G​​I​​Q​​A​​F​​E​514  ​P​​M​​L​​V​​E​​G​​K​​A​​I​​Q​524  ​L​​H​​P​​L​​V​​C​​E​​A​​F​​N​534  ​A​​D​​F​​D​​G​​D​​Q​​M​​A​​V​544  ​H​​L​​P​​L​​S​​A​​E​​A​​Q​​A​554  ​E​​A​​R​​I​​L​​M​​L​​S​​S​​N​564  ​N​​I​​L​​S​​P​​A​​S​​G​​R​​P​574  ​L​​A​​M​​P​​R​​L​​D​​M​​V​​T​584  ​G​​L​​Y​​Y​​L​​T​​T​​E​​V​​P​594  ​G​​D​​T​​G​​E​​Y​​Q​​P​​A​​S​604  ​G​​D​​H​​P​​E​​T​​G​​V​​Y​​S​614  ​S​​P​​A​​E​​A​​I​​M​​A​​A​​D​624  ​R​​G​​V​​L​​S​​V​​R​​A​​K​​I​634  ​K​​V​​R​​L​​T​​Q​​L​​R​​P​​P​644  ​V​​E​​I​​E​​A​​E​​L​​F​​G​​H​654  ​S​​G​​W​​Q​​P​​G​​D​​A​​W​​M​664  ​A​​E​​T​​T​​L​​G​​R​​V​​M​​F​674  ​N​​E​​L​​L​​P​​L​​G​​Y​​P​​F​684  ​V​​N​​K​​Q​​M​​H​​K​​K​​V​​Q​694  ​A​​A​​I​​I​​N​​D​​L​​A​​E​​R​704  ​Y​​P​​M​​I​​V​​V​​A​​Q​​T​​V​714  ​D​​K​​L​​K​​D​​A​​G​​F​​Y​​W​724  ​A​​T​​R​​S​​G​​V​​T​​V​​S​​M​734  ​A​​D​​V​​L​​V​​P​​P​​R​​K​​K​744  ​E​​I​​L​​D​​H​​Y​​E​​E​​R​​A​754  ​D​​K​​V​​E​​K​​Q​​F​​Q​​R​​G​764  ​A​​L​​N​​H​​D​​E​​R​​N​​E​​A​774  ​L​​V​​E​​I​​W​​K​​E​​A​​T​​D​784  ​E​​V​​G​​Q​​A​​L​​R​​E​​H​​Y​794  ​P​​D​​D​​N​​P​​I​​I​​T​​I​​V​804  ​D​​S​​G​​A​​T​​G​​N​​F​​T​​Q​814  ​T​​R​​T​​L​​A​​G​​M​​K​​G​​L​824  ​V​​T​​N​​P​​K​​G​​E​​F​​I​​P​834  ​R​​P​​V​​K​​S​​S​​F​​R​​E​​G​844  ​L​​T​​V​​L​​E​​Y​​F​​I​​N​​T​854  ​H​​G​​A​​R​​K​​G​​L​​A​​D​​T​864  ​A​​L​​R​​T​​A​​D​​S​​G​​Y​​L​874  ​T​​R​​R​​L​​V​​D​​V​​S​​Q​​D​884  ​V​​I​​V​​R​​E​​H​​D​​C​​Q​​T​894  ​E​​R​​G​​I​​V​​V​​E​​L​​A​​E​904  ​R​​A​​P​​D​​G​​T​​L​​I​​R​​D​914  ​P​​Y​​I​​E​​T​​S​​A​​Y​​A​​R​924  ​T​​L​​G​​T​​D​​A​​V​​D​​E​​A​934  ​G​​N​​V​​I​​V​​E​​R​​G​​Q​​D​944  ​L​​G​​D​​P​​E​​I​​D​​A​​L​​L​954  ​A​​A​​G​​I​​T​​Q​​V​​K​​V​​R​964  ​S​​V​​L​​T​​C​​A​​T​​S​​T​​G​974  ​V​​C​​A​​T​​C​​Y​​G​​R​​S​​M​984  ​A​​T​​G​​K​​L​​V​​D​​I​​G​​E​994  ​A​​V​​G​​I​​V​​A​​A​​Q​​S​​I​1004 ​G​​E​​P​​G​​T​​Q​​L​​T​​M​​I​1025 ​T​​G​​G​​L​​P​​R​​V​​Q​​E​​L​1035 ​F​​E​​A​​R​​V​​P​​R​​G​​K​​A​1045 ​P​​I​​A​​D​​V​​T​​G​​R​​V​​R​1055 ​L​​E​​D​​G​​E​​R​​F​​Y​​K​​I​1065 ​T​​I​​V​​P​​D​​D​​G​​G​​E​​E​1075 ​V​​V​​Y​​D​​K​​I​​S​​K​​R​​Q​1085 ​R​​L​​R​​V​​F​​K​​H​​E​​D​​G​1095 ​S​​E​​R​​V​​L​​S​​D​​G​​D​​H​1105 ​V​​E​​V​​G​​Q​​Q​​L​​M​​E​​G​1115 ​S​​A​​D​​P​​H​​E​​V​​L​​R​​V​1125 ​Q​​G​​P​​R​​E​​V​​Q​​I​​H​​L​1135 ​V​​R​​E​​V​​Q​​E​​V​​Y​​R​​A​1145 ​Q​​G​​V​​S​​I​​H​​D​​K​​H​​I​1155 ​E​​V​​I​​V​​R​​Q​​M​​L​​R​​R​1165 ​V​​T​​I​​I​​D​​S​​G​​S​​T​​E​1175 ​F​​L​​P​​G​​S​​L​​I​​D​​R​​A​1185 ​E​​F​​E​​A​​E​​N​​R​​R​​V​​V​1195 ​A​​E​​G​​G​​E​​P​​A​​A​​G​​R​1205 ​P​​V​​L​​M​​G​​I​​T​​K​​A​​S​1215 ​L​​A​​T​​D​​S​​W​​L​​S​​A​​A​1225 ​S​​F​​Q​​E​​T​​T​​R​​V​​L​​T​1235 ​D​​A​​A​​I​​N​​C​​R​​S​​D​​K​1245 ​L​​N​​G​​L​​K​​E​​N​​V​​I​​I​1255 ​G​​K​​L​​I​​P​​A​​G​​T​​G​​I​1265 ​N​​R​​Y​​R​​N​​I​​A​​V​​Q​​P​1275 ​T​​E​​E​​A​​R​​A​​A​​A​​Y​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.52 .. 1.26
-0.52
1.26
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
4
VAL
0.72
2
5
ASN
0.69
3
6
PHE
0.68
4
7
PHE
0.67
5
8
ASP
0.49
6
9
GLU
0.43
7
10
LEU
0.42
8
11
ARG
0.46
9
12
ILE
0.52
10
13
GLY
0.58
11
14
LEU
0.59
12
15
ALA
0.67
13
16
THR
0.70
14
17
ALA
0.71
15
18
GLU
0.71
16
19
ASP
0.74
17
20
ILE
0.65
18
21
ARG
0.66
19
22
GLN
0.59
20
23
TRP
0.52
21
24
SER
0.46
22
25
TYR
0.39
23
26
GLY
0.36
24
27
GLU
0.47
25
28
VAL
0.50
26
29
LYS
0.51
27
30
LYS
0.47
28
31
PRO
0.41
29
32
GLU
0.37
30
33
THR
0.35
31
34
ILE
0.26
32
35
ASN
0.12
Sequence of
4    ​V​​N​​F​​F​​D​​E​​L​​R​​I​​G​14   ​L​​A​​T​​A​​E​​D​​I​​R​​Q​​W​24   ​S​​Y​​G​​E​​V​​K​​K​​P​​E​​T​34   ​I​​N​​Y​​R​​T​​L​​K​​P​​E​​K​44   ​D​​G​​L​​F​​C​​E​​K​​I​​F​​G​54   ​P​​T​​R​​D​​W​​E​​C​​Y​​C​​G​64   ​K​​Y​​K​​R​​V​​R​​F​​K​​G​​I​74   ​I​​C​​E​​R​​C​​G​​V​​E​​V​​T​84   ​R​​A​​K​​V​​R​​R​​E​​R​​M​​G​94   ​H​​I​​E​​L​​A​​A​​P​​V​​T​​H​104  ​I​​W​​Y​​F​​K​​G​​V​​P​​S​​R​114  ​L​​G​​Y​​L​​L​​D​​L​​A​​P​​K​124  ​D​​L​​E​​K​​I​​I​​Y​​F​​A​​A​134  ​Y​​V​​I​​T​​S​​V​​D​​E​​E​​M​144  ​R​​H​​N​​E​​L​​S​​T​​L​​E​​A​154  ​E​​M​​A​​V​​E​​R​​K​​A​​V​​E​164  ​D​​Q​​R​​D​​G​​E​​L​​E​​A​​R​174  ​A​​Q​​K​​L​​E​​A​​D​​L​​A​​E​184  ​L​​E​​A​​E​​G​​A​​K​​A​​D​​A​194  ​R​​R​​K​​V​​R​​D​​G​​G​​E​​R​204  ​E​​M​​R​​Q​​I​​R​​D​​R​​A​​Q​214  ​R​​E​​L​​D​​R​​L​​E​​D​​I​​W​224  ​S​​T​​F​​T​​K​​L​​A​​P​​K​​Q​234  ​L​​I​​V​​D​​E​​N​​L​​Y​​R​​E​244  ​L​​V​​D​​R​​Y​​G​​E​​Y​​F​​T​254  ​G​​A​​M​​G​​A​​E​​S​​I​​Q​​K​264  ​L​​I​​E​​N​​F​​D​​I​​D​​A​​E​274  ​A​​E​​S​​L​​R​​D​​V​​I​​R​​N​284  ​G​​K​​G​​Q​​K​​K​​L​​R​​A​​L​294  ​K​​R​​L​​K​​V​​V​​A​​A​​F​​Q​304  ​Q​​S​​G​​N​​S​​P​​M​​G​​M​​V​314  ​L​​D​​A​​V​​P​​V​​I​​P​​P​​E​324  ​L​​R​​P​​M​​V​​Q​​L​​D​​G​​G​334  ​R​​F​​A​​T​​S​​D​​L​​N​​D​​L​344  ​Y​​R​​R​​V​​I​​N​​R​​N​​N​​R​354  ​L​​K​​R​​L​​I​​D​​L​​G​​A​​P​364  ​E​​I​​I​​V​​N​​N​​E​​K​​R​​M​374  ​L​​Q​​E​​S​​V​​D​​A​​L​​F​​D​384  ​N​​G​​R​​R​​G​​R​​P​​V​​T​​G​394  ​P​​G​​N​​R​​P​​L​​K​​S​​L​​S​404  ​D​​L​​L​​K​​G​​K​​Q​​G​​R​​F​414  ​R​​Q​​N​​L​​L​​G​​K​​R​​V​​D​424  ​Y​​S​​G​​R​​S​​V​​I​​V​​V​​G​434  ​P​​Q​​L​​K​​L​​H​​Q​​C​​G​​L​444  ​P​​K​​L​​M​​A​​L​​E​​L​​F​​K​454  ​P​​F​​V​​M​​K​​R​​L​​V​​D​​L​464  ​N​​H​​A​​Q​​N​​I​​K​​S​​A​​K​474  ​R​​M​​V​​E​​R​​Q​​R​​P​​Q​​V​484  ​W​​D​​V​​L​​E​​E​​V​​I​​A​​E​494  ​H​​P​​V​​L​​L​​N​​R​​A​​P​​T​504  ​L​​H​​R​​L​​G​​I​​Q​​A​​F​​E​514  ​P​​M​​L​​V​​E​​G​​K​​A​​I​​Q​524  ​L​​H​​P​​L​​V​​C​​E​​A​​F​​N​534  ​A​​D​​F​​D​​G​​D​​Q​​M​​A​​V​544  ​H​​L​​P​​L​​S​​A​​E​​A​​Q​​A​554  ​E​​A​​R​​I​​L​​M​​L​​S​​S​​N​564  ​N​​I​​L​​S​​P​​A​​S​​G​​R​​P​574  ​L​​A​​M​​P​​R​​L​​D​​M​​V​​T​584  ​G​​L​​Y​​Y​​L​​T​​T​​E​​V​​P​594  ​G​​D​​T​​G​​E​​Y​​Q​​P​​A​​S​604  ​G​​D​​H​​P​​E​​T​​G​​V​​Y​​S​614  ​S​​P​​A​​E​​A​​I​​M​​A​​A​​D​624  ​R​​G​​V​​L​​S​​V​​R​​A​​K​​I​634  ​K​​V​​R​​L​​T​​Q​​L​​R​​P​​P​644  ​V​​E​​I​​E​​A​​E​​L​​F​​G​​H​654  ​S​​G​​W​​Q​​P​​G​​D​​A​​W​​M​664  ​A​​E​​T​​T​​L​​G​​R​​V​​M​​F​674  ​N​​E​​L​​L​​P​​L​​G​​Y​​P​​F​684  ​V​​N​​K​​Q​​M​​H​​K​​K​​V​​Q​694  ​A​​A​​I​​I​​N​​D​​L​​A​​E​​R​704  ​Y​​P​​M​​I​​V​​V​​A​​Q​​T​​V​714  ​D​​K​​L​​K​​D​​A​​G​​F​​Y​​W​724  ​A​​T​​R​​S​​G​​V​​T​​V​​S​​M​734  ​A​​D​​V​​L​​V​​P​​P​​R​​K​​K​744  ​E​​I​​L​​D​​H​​Y​​E​​E​​R​​A​754  ​D​​K​​V​​E​​K​​Q​​F​​Q​​R​​G​764  ​A​​L​​N​​H​​D​​E​​R​​N​​E​​A​774  ​L​​V​​E​​I​​W​​K​​E​​A​​T​​D​784  ​E​​V​​G​​Q​​A​​L​​R​​E​​H​​Y​794  ​P​​D​​D​​N​​P​​I​​I​​T​​I​​V​804  ​D​​S​​G​​A​​T​​G​​N​​F​​T​​Q​814  ​T​​R​​T​​L​​A​​G​​M​​K​​G​​L​824  ​V​​T​​N​​P​​K​​G​​E​​F​​I​​P​834  ​R​​P​​V​​K​​S​​S​​F​​R​​E​​G​844  ​L​​T​​V​​L​​E​​Y​​F​​I​​N​​T​854  ​H​​G​​A​​R​​K​​G​​L​​A​​D​​T​864  ​A​​L​​R​​T​​A​​D​​S​​G​​Y​​L​874  ​T​​R​​R​​L​​V​​D​​V​​S​​Q​​D​884  ​V​​I​​V​​R​​E​​H​​D​​C​​Q​​T​894  ​E​​R​​G​​I​​V​​V​​E​​L​​A​​E​904  ​R​​A​​P​​D​​G​​T​​L​​I​​R​​D​914  ​P​​Y​​I​​E​​T​​S​​A​​Y​​A​​R​924  ​T​​L​​G​​T​​D​​A​​V​​D​​E​​A​934  ​G​​N​​V​​I​​V​​E​​R​​G​​Q​​D​944  ​L​​G​​D​​P​​E​​I​​D​​A​​L​​L​954  ​A​​A​​G​​I​​T​​Q​​V​​K​​V​​R​964  ​S​​V​​L​​T​​C​​A​​T​​S​​T​​G​974  ​V​​C​​A​​T​​C​​Y​​G​​R​​S​​M​984  ​A​​T​​G​​K​​L​​V​​D​​I​​G​​E​994  ​A​​V​​G​​I​​V​​A​​A​​Q​​S​​I​1004 ​G​​E​​P​​G​​T​​Q​​L​​T​​M​​I​1025 ​T​​G​​G​​L​​P​​R​​V​​Q​​E​​L​1035 ​F​​E​​A​​R​​V​​P​​R​​G​​K​​A​1045 ​P​​I​​A​​D​​V​​T​​G​​R​​V​​R​1055 ​L​​E​​D​​G​​E​​R​​F​​Y​​K​​I​1065 ​T​​I​​V​​P​​D​​D​​G​​G​​E​​E​1075 ​V​​V​​Y​​D​​K​​I​​S​​K​​R​​Q​1085 ​R​​L​​R​​V​​F​​K​​H​​E​​D​​G​1095 ​S​​E​​R​​V​​L​​S​​D​​G​​D​​H​1105 ​V​​E​​V​​G​​Q​​Q​​L​​M​​E​​G​1115 ​S​​A​​D​​P​​H​​E​​V​​L​​R​​V​1125 ​Q​​G​​P​​R​​E​​V​​Q​​I​​H​​L​1135 ​V​​R​​E​​V​​Q​​E​​V​​Y​​R​​A​1145 ​Q​​G​​V​​S​​I​​H​​D​​K​​H​​I​1155 ​E​​V​​I​​V​​R​​Q​​M​​L​​R​​R​1165 ​V​​T​​I​​I​​D​​S​​G​​S​​T​​E​1175 ​F​​L​​P​​G​​S​​L​​I​​D​​R​​A​1185 ​E​​F​​E​​A​​E​​N​​R​​R​​V​​V​1195 ​A​​E​​G​​G​​E​​P​​A​​A​​G​​R​1205 ​P​​V​​L​​M​​G​​I​​T​​K​​A​​S​1215 ​L​​A​​T​​D​​S​​W​​L​​S​​A​​A​1225 ​S​​F​​Q​​E​​T​​T​​R​​V​​L​​T​1235 ​D​​A​​A​​I​​N​​C​​R​​S​​D​​K​1245 ​L​​N​​G​​L​​K​​E​​N​​V​​I​​I​1255 ​G​​K​​L​​I​​P​​A​​G​​T​​G​​I​1265 ​N​​R​​Y​​R​​N​​I​​A​​V​​Q​​P​1275 ​T​​E​​E​​A​​R​​A​​A​​A​​Y​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -2.01 .. 0.89
-2.01
0.89
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
4
VAL
0.73
2
5
ASN
0.72
3
6
PHE
0.66
4
7
PHE
0.64
5
8
ASP
0.62
6
9
GLU
0.60
7
10
LEU
0.58
8
11
ARG
0.59
9
12
ILE
0.60
10
13
GLY
0.58
11
14
LEU
0.54
12
15
ALA
0.54
13
16
THR
0.54
14
17
ALA
0.60
15
18
GLU
0.62
16
19
ASP
0.60
17
20
ILE
0.53
18
21
ARG
0.46
19
22
GLN
0.39
20
23
TRP
0.35
21
24
SER
0.33
22
25
TYR
0.37
23
26
GLY
0.37
24
27
GLU
0.38
25
28
VAL
0.34
26
29
LYS
0.36
27
30
LYS
0.35
28
31
PRO
0.34
29
32
GLU
0.34
30
33
THR
0.38
31
34
ILE
0.39
32
35
ASN
0.42
Sequence of
4    ​V​​N​​F​​F​​D​​E​​L​​R​​I​​G​14   ​L​​A​​T​​A​​E​​D​​I​​R​​Q​​W​24   ​S​​Y​​G​​E​​V​​K​​K​​P​​E​​T​34   ​I​​N​​Y​​R​​T​​L​​K​​P​​E​​K​44   ​D​​G​​L​​F​​C​​E​​K​​I​​F​​G​54   ​P​​T​​R​​D​​W​​E​​C​​Y​​C​​G​64   ​K​​Y​​K​​R​​V​​R​​F​​K​​G​​I​74   ​I​​C​​E​​R​​C​​G​​V​​E​​V​​T​84   ​R​​A​​K​​V​​R​​R​​E​​R​​M​​G​94   ​H​​I​​E​​L​​A​​A​​P​​V​​T​​H​104  ​I​​W​​Y​​F​​K​​G​​V​​P​​S​​R​114  ​L​​G​​Y​​L​​L​​D​​L​​A​​P​​K​124  ​D​​L​​E​​K​​I​​I​​Y​​F​​A​​A​134  ​Y​​V​​I​​T​​S​​V​​D​​E​​E​​M​144  ​R​​H​​N​​E​​L​​S​​T​​L​​E​​A​154  ​E​​M​​A​​V​​E​​R​​K​​A​​V​​E​164  ​D​​Q​​R​​D​​G​​E​​L​​E​​A​​R​174  ​A​​Q​​K​​L​​E​​A​​D​​L​​A​​E​184  ​L​​E​​A​​E​​G​​A​​K​​A​​D​​A​194  ​R​​R​​K​​V​​R​​D​​G​​G​​E​​R​204  ​E​​M​​R​​Q​​I​​R​​D​​R​​A​​Q​214  ​R​​E​​L​​D​​R​​L​​E​​D​​I​​W​224  ​S​​T​​F​​T​​K​​L​​A​​P​​K​​Q​234  ​L​​I​​V​​D​​E​​N​​L​​Y​​R​​E​244  ​L​​V​​D​​R​​Y​​G​​E​​Y​​F​​T​254  ​G​​A​​M​​G​​A​​E​​S​​I​​Q​​K​264  ​L​​I​​E​​N​​F​​D​​I​​D​​A​​E​274  ​A​​E​​S​​L​​R​​D​​V​​I​​R​​N​284  ​G​​K​​G​​Q​​K​​K​​L​​R​​A​​L​294  ​K​​R​​L​​K​​V​​V​​A​​A​​F​​Q​304  ​Q​​S​​G​​N​​S​​P​​M​​G​​M​​V​314  ​L​​D​​A​​V​​P​​V​​I​​P​​P​​E​324  ​L​​R​​P​​M​​V​​Q​​L​​D​​G​​G​334  ​R​​F​​A​​T​​S​​D​​L​​N​​D​​L​344  ​Y​​R​​R​​V​​I​​N​​R​​N​​N​​R​354  ​L​​K​​R​​L​​I​​D​​L​​G​​A​​P​364  ​E​​I​​I​​V​​N​​N​​E​​K​​R​​M​374  ​L​​Q​​E​​S​​V​​D​​A​​L​​F​​D​384  ​N​​G​​R​​R​​G​​R​​P​​V​​T​​G​394  ​P​​G​​N​​R​​P​​L​​K​​S​​L​​S​404  ​D​​L​​L​​K​​G​​K​​Q​​G​​R​​F​414  ​R​​Q​​N​​L​​L​​G​​K​​R​​V​​D​424  ​Y​​S​​G​​R​​S​​V​​I​​V​​V​​G​434  ​P​​Q​​L​​K​​L​​H​​Q​​C​​G​​L​444  ​P​​K​​L​​M​​A​​L​​E​​L​​F​​K​454  ​P​​F​​V​​M​​K​​R​​L​​V​​D​​L​464  ​N​​H​​A​​Q​​N​​I​​K​​S​​A​​K​474  ​R​​M​​V​​E​​R​​Q​​R​​P​​Q​​V​484  ​W​​D​​V​​L​​E​​E​​V​​I​​A​​E​494  ​H​​P​​V​​L​​L​​N​​R​​A​​P​​T​504  ​L​​H​​R​​L​​G​​I​​Q​​A​​F​​E​514  ​P​​M​​L​​V​​E​​G​​K​​A​​I​​Q​524  ​L​​H​​P​​L​​V​​C​​E​​A​​F​​N​534  ​A​​D​​F​​D​​G​​D​​Q​​M​​A​​V​544  ​H​​L​​P​​L​​S​​A​​E​​A​​Q​​A​554  ​E​​A​​R​​I​​L​​M​​L​​S​​S​​N​564  ​N​​I​​L​​S​​P​​A​​S​​G​​R​​P​574  ​L​​A​​M​​P​​R​​L​​D​​M​​V​​T​584  ​G​​L​​Y​​Y​​L​​T​​T​​E​​V​​P​594  ​G​​D​​T​​G​​E​​Y​​Q​​P​​A​​S​604  ​G​​D​​H​​P​​E​​T​​G​​V​​Y​​S​614  ​S​​P​​A​​E​​A​​I​​M​​A​​A​​D​624  ​R​​G​​V​​L​​S​​V​​R​​A​​K​​I​634  ​K​​V​​R​​L​​T​​Q​​L​​R​​P​​P​644  ​V​​E​​I​​E​​A​​E​​L​​F​​G​​H​654  ​S​​G​​W​​Q​​P​​G​​D​​A​​W​​M​664  ​A​​E​​T​​T​​L​​G​​R​​V​​M​​F​674  ​N​​E​​L​​L​​P​​L​​G​​Y​​P​​F​684  ​V​​N​​K​​Q​​M​​H​​K​​K​​V​​Q​694  ​A​​A​​I​​I​​N​​D​​L​​A​​E​​R​704  ​Y​​P​​M​​I​​V​​V​​A​​Q​​T​​V​714  ​D​​K​​L​​K​​D​​A​​G​​F​​Y​​W​724  ​A​​T​​R​​S​​G​​V​​T​​V​​S​​M​734  ​A​​D​​V​​L​​V​​P​​P​​R​​K​​K​744  ​E​​I​​L​​D​​H​​Y​​E​​E​​R​​A​754  ​D​​K​​V​​E​​K​​Q​​F​​Q​​R​​G​764  ​A​​L​​N​​H​​D​​E​​R​​N​​E​​A​774  ​L​​V​​E​​I​​W​​K​​E​​A​​T​​D​784  ​E​​V​​G​​Q​​A​​L​​R​​E​​H​​Y​794  ​P​​D​​D​​N​​P​​I​​I​​T​​I​​V​804  ​D​​S​​G​​A​​T​​G​​N​​F​​T​​Q​814  ​T​​R​​T​​L​​A​​G​​M​​K​​G​​L​824  ​V​​T​​N​​P​​K​​G​​E​​F​​I​​P​834  ​R​​P​​V​​K​​S​​S​​F​​R​​E​​G​844  ​L​​T​​V​​L​​E​​Y​​F​​I​​N​​T​854  ​H​​G​​A​​R​​K​​G​​L​​A​​D​​T​864  ​A​​L​​R​​T​​A​​D​​S​​G​​Y​​L​874  ​T​​R​​R​​L​​V​​D​​V​​S​​Q​​D​884  ​V​​I​​V​​R​​E​​H​​D​​C​​Q​​T​894  ​E​​R​​G​​I​​V​​V​​E​​L​​A​​E​904  ​R​​A​​P​​D​​G​​T​​L​​I​​R​​D​914  ​P​​Y​​I​​E​​T​​S​​A​​Y​​A​​R​924  ​T​​L​​G​​T​​D​​A​​V​​D​​E​​A​934  ​G​​N​​V​​I​​V​​E​​R​​G​​Q​​D​944  ​L​​G​​D​​P​​E​​I​​D​​A​​L​​L​954  ​A​​A​​G​​I​​T​​Q​​V​​K​​V​​R​964  ​S​​V​​L​​T​​C​​A​​T​​S​​T​​G​974  ​V​​C​​A​​T​​C​​Y​​G​​R​​S​​M​984  ​A​​T​​G​​K​​L​​V​​D​​I​​G​​E​994  ​A​​V​​G​​I​​V​​A​​A​​Q​​S​​I​1004 ​G​​E​​P​​G​​T​​Q​​L​​T​​M​​I​1025 ​T​​G​​G​​L​​P​​R​​V​​Q​​E​​L​1035 ​F​​E​​A​​R​​V​​P​​R​​G​​K​​A​1045 ​P​​I​​A​​D​​V​​T​​G​​R​​V​​R​1055 ​L​​E​​D​​G​​E​​R​​F​​Y​​K​​I​1065 ​T​​I​​V​​P​​D​​D​​G​​G​​E​​E​1075 ​V​​V​​Y​​D​​K​​I​​S​​K​​R​​Q​1085 ​R​​L​​R​​V​​F​​K​​H​​E​​D​​G​1095 ​S​​E​​R​​V​​L​​S​​D​​G​​D​​H​1105 ​V​​E​​V​​G​​Q​​Q​​L​​M​​E​​G​1115 ​S​​A​​D​​P​​H​​E​​V​​L​​R​​V​1125 ​Q​​G​​P​​R​​E​​V​​Q​​I​​H​​L​1135 ​V​​R​​E​​V​​Q​​E​​V​​Y​​R​​A​1145 ​Q​​G​​V​​S​​I​​H​​D​​K​​H​​I​1155 ​E​​V​​I​​V​​R​​Q​​M​​L​​R​​R​1165 ​V​​T​​I​​I​​D​​S​​G​​S​​T​​E​1175 ​F​​L​​P​​G​​S​​L​​I​​D​​R​​A​1185 ​E​​F​​E​​A​​E​​N​​R​​R​​V​​V​1195 ​A​​E​​G​​G​​E​​P​​A​​A​​G​​R​1205 ​P​​V​​L​​M​​G​​I​​T​​K​​A​​S​1215 ​L​​A​​T​​D​​S​​W​​L​​S​​A​​A​1225 ​S​​F​​Q​​E​​T​​T​​R​​V​​L​​T​1235 ​D​​A​​A​​I​​N​​C​​R​​S​​D​​K​1245 ​L​​N​​G​​L​​K​​E​​N​​V​​I​​I​1255 ​G​​K​​L​​I​​P​​A​​G​​T​​G​​I​1265 ​N​​R​​Y​​R​​N​​I​​A​​V​​Q​​P​1275 ​T​​E​​E​​A​​R​​A​​A​​A​​Y​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -1.45 .. 3.26
-1.45
3.26
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
4
VAL
2.17
2
5
ASN
2.19
3
6
PHE
2.05
4
7
PHE
2.00
5
8
ASP
1.74
6
9
GLU
1.70
7
10
LEU
1.66
8
11
ARG
1.74
9
12
ILE
1.79
10
13
GLY
1.83
11
14
LEU
1.83
12
15
ALA
1.97
13
16
THR
2.08
14
17
ALA
2.21
15
18
GLU
2.21
16
19
ASP
2.16
17
20
ILE
1.93
18
21
ARG
1.71
19
22
GLN
1.45
20
23
TRP
1.26
21
24
SER
1.10
22
25
TYR
1.09
23
26
GLY
1.05
24
27
GLU
1.16
25
28
VAL
1.07
26
29
LYS
1.08
27
30
LYS
0.95
28
31
PRO
0.87
29
32
GLU
0.76
30
33
THR
0.78
31
34
ILE
0.74
32
35
ASN
0.51