18496 8QMA A v1-2
18496_8qma_A_v1-2
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RCSB PDB: 8QMA
EMDB: 18496
Structure title Structure of the plastid-encoded RNA polymerase complex (PEP) from Sinapis alba
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 3.5 Å
Source organism Sinapis alba
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Sequence of
9    ​T​​S​​T​​I​​P​​G​​F​​N​​Q​​I​19   ​Q​​F​​E​​G​​F​​Y​​R​​F​​I​​D​29   ​Q​​G​​L​​I​​E​​E​​L​​S​​K​​F​39   ​P​​K​​I​​E​​D​​I​​D​​H​​E​​I​49   ​E​​F​​Q​​L​​F​​V​​E​​T​​Y​​Q​59   ​L​​V​​E​​P​​L​​I​​K​​E​​R​​D​69   ​A​​V​​Y​​E​​S​​L​​T​​Y​​S​​S​79   ​E​​L​​Y​​V​​S​​A​​G​​L​​I​​W​89   ​K​​T​​N​​R​​N​​M​​Q​​E​​Q​​R​99   ​I​​F​​I​​G​​N​​I​​P​​L​​M​​N​109  ​S​​L​​G​​T​​S​​I​​V​​N​​G​​I​119  ​Y​​R​​V​​V​​I​​N​​Q​​I​​L​​Q​129  ​S​​P​​G​​I​​Y​​Y​​Q​​S​​E​​L​144  ​S​​V​​Y​​T​​G​​T​​I​​I​​S​​D​154  ​W​​G​​G​​R​​L​​E​​L​​E​​I​​D​164  ​K​​K​​A​​R​​I​​W​​A​​R​​V​​S​174  ​R​​K​​Q​​K​​I​​S​​I​​L​​V​​L​184  ​S​​S​​A​​M​​G​​S​​N​​L​​R​​E​194  ​I​​L​​E​​N​​V​​C​​Y​​P​​E​​I​204  ​F​​L​​S​​F​​L​​L​​G​​R​​I​​G​263  ​R​​R​​N​​I​​N​​W​​R​​L​​N​​L​273  ​N​​I​​P​​Q​​N​​N​​I​​F​​L​​L​283  ​P​​R​​D​​I​​L​​A​​A​​A​​D​​H​293  ​L​​I​​G​​M​​K​​F​​G​​M​​G​​T​303  ​L​​D​​D​​M​​N​​H​​L​​K​​N​​K​313  ​R​​I​​R​​S​​V​​A​​D​​L​​L​​Q​323  ​D​​Q​​L​​G​​L​​A​​L​​A​​R​​L​333  ​E​​N​​V​​V​​K​​G​​T​​I​​G​​G​343  ​A​​I​​R​​H​​K​​L​​I​​P​​T​​P​353  ​Q​​N​​L​​V​​T​​S​​T​​P​​L​​T​363  ​T​​T​​Y​​E​​S​​F​​F​​G​​L​​H​373  ​P​​L​​S​​Q​​V​​L​​D​​R​​T​​N​383  ​P​​L​​T​​Q​​I​​V​​H​​G​​R​​K​393  ​L​​S​​Y​​L​​G​​I​​G​​S​​L​​S​440  ​I​​H​​A​​R​​I​​G​​D​​W​​G​​S​450  ​L​​E​​S​​P​​F​​Y​​E​​L​​V​​E​460  ​K​​S​​K​​K​​A​​Q​​I​​R​​M​​L​470  ​F​​L​​S​​P​​S​​Q​​D​​E​​Y​​Y​480  ​M​​I​​A​​A​​G​​N​​S​​L​​A​​L​490  ​N​​R​​G​​I​​Q​​E​​E​​Q​​V​​V​500  ​P​​A​​R​​Y​​R​​Q​​E​​F​​L​​T​510  ​I​​A​​W​​E​​E​​V​​H​​L​​R​​S​520  ​I​​F​​P​​F​​Q​​Y​​F​​S​​I​​G​530  ​A​​S​​L​​I​​P​​F​​I​​E​​H​​N​540  ​D​​A​​N​​R​​A​​L​​M​​S​​S​​N​550  ​M​​Q​​R​​Q​​A​​V​​P​​L​​S​​R​560  ​S​​E​​K​​C​​I​​V​​G​​T​​G​​L​570  ​E​​R​​Q​​V​​A​​L​​D​​S​​G​​V​580  ​P​​A​​I​​A​​E​​H​​E​​G​​K​​I​590  ​L​​Y​​T​​D​​T​​E​​K​​I​​I​​L​600  ​S​​G​​N​​E​​N​​T​​L​​S​​I​​P​610  ​L​​I​​Q​​K​​P​​Q​​V​​R​​R​​G​632  ​K​​C​​I​​K​​K​​G​​Q​​I​​L​​A​642  ​D​​G​​A​​A​​T​​V​​G​​G​​E​​L​652  ​A​​L​​G​​K​​N​​I​​L​​V​​A​​Y​662  ​M​​P​​W​​E​​G​​Y​​N​​F​​E​​D​672  ​A​​V​​L​​I​​S​​E​​C​​L​​V​​Y​682  ​G​​D​​I​​Y​​T​​S​​F​​H​​I​​R​810  ​I​​S​​Q​​K​​R​​E​​I​​K​​V​​G​820  ​D​​K​​V​​A​​G​​R​​H​​G​​N​​K​830  ​G​​I​​I​​S​​K​​I​​L​​P​​R​​Q​840  ​D​​M​​P​​Y​​L​​Q​​D​​G​​R​​P​850  ​V​​D​​M​​V​​F​​N​​P​​L​​G​​V​860  ​P​​S​​R​​M​​N​​V​​G​​Q​​I​​F​870  ​E​​C​​S​​L​​G​​L​​A​​G​​S​​L​880  ​L​​D​​R​​H​​Y​​R​​I​​A​​P​​F​890  ​D​​E​​R​​Y​​E​​Q​​E​​A​​S​​R​900  ​K​​L​​V​​F​​S​​E​​L​​Y​​E​​A​910  ​S​​K​​Q​​T​​A​​N​​P​​W​​V​​F​920  ​E​​P​​E​​Y​​P​​G​​K​​S​​R​​I​930  ​F​​D​​G​​R​​T​​G​​D​​P​​F​​E​940  ​Q​​P​​V​​I​​I​​G​​K​​P​​Y​​I​950  ​L​​K​​L​​I​​H​​Q​​R​​V​​G​​E​990  ​M​​E​​V​​W​​A​​L​​E​​G​​F​​G​1000 ​V​​A​​H​​I​​L​​Q​​E​​M​​L​​T​1010 ​Y​​K​​S​​A​​P​​E​​S​​F​​R​​L​1044 ​L​​V​​R​​E​​L​​R​​S​​L​​A​​L​1054 ​E​​L​​N​​H​​F​​L​​V​​S​​E​​K​1064 ​N​​F​​Q​​I​​N​​R​​K​​E​​V​
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DAQ Score Table

Score range in the table: -0.28 .. 1.29
-0.28
1.29
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
9
THR
1.02
2
10
SER
1.03
3
11
THR
1.00
4
12
ILE
1.03
5
13
PRO
1.05
6
14
GLY
1.06
7
15
PHE
0.96
8
16
ASN
0.95
9
17
GLN
0.99
10
18
ILE
1.01
11
19
GLN
1.04
12
20
PHE
1.04
13
21
GLU
1.16
14
22
GLY
1.18
15
23
PHE
1.08
16
24
TYR
1.11
17
25
ARG
1.10
18
26
PHE
1.16
19
27
ILE
1.16
20
28
ASP
1.09
21
29
GLN
1.11
22
30
GLY
1.01
23
31
LEU
0.96
24
32
ILE
0.95
25
33
GLU
0.88
26
34
GLU
0.90
27
35
LEU
0.86
28
36
SER
0.77
29
37
LYS
0.72
30
38
PHE
0.67
31
39
PRO
0.62
32
40
LYS
0.46
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