20621 6U2K B v1-2
Structure title EM structure of MPEG-1 (L425K, alpha conformation) soluble pre-pore complex
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 2.93 Å
Source organism Homo sapiens

Sequence of
11   ​E​​V​​G​​V​​Q​​K​​C​​K​​N​​A​21   ​L​​K​​L​​P​​V​​L​​E​​V​​L​​P​31   ​G​​G​​G​​W​​D​​N​​L​​R​​N​​V​41   ​D​​M​​G​​R​​V​​M​​E​​L​​T​​Y​51   ​S​​N​​C​​R​​T​​T​​E​​D​​G​​Q​61   ​Y​​I​​I​​P​​D​​E​​I​​F​​T​​I​71   ​P​​Q​​K​​Q​​S​​N​​L​​E​​M​​N​81   ​S​​E​​I​​L​​E​​S​​W​​A​​N​​Y​91   ​Q​​S​​S​​T​​S​​Y​​S​​I​​N​​T​101  ​E​​L​​S​​L​​F​​S​​K​​V​​N​​G​111  ​K​​F​​S​​T​​E​​F​​Q​​R​​M​​K​121  ​T​​L​​Q​​V​​K​​D​​Q​​A​​I​​T​131  ​T​​R​​V​​Q​​V​​R​​N​​L​​V​​Y​141  ​T​​V​​K​​I​​N​​P​​T​​L​​E​​L​151  ​S​​S​​G​​F​​R​​K​​E​​L​​L​​D​161  ​I​​S​​D​​R​​L​​E​​N​​N​​Q​​T​171  ​R​​M​​A​​T​​Y​​L​​A​​E​​L​​L​181  ​V​​L​​N​​Y​​G​​T​​H​​V​​T​​T​191  ​S​​V​​D​​A​​G​​A​​A​​L​​I​​Q​201  ​E​​D​​H​​L​​R​​A​​S​​F​​L​​Q​211  ​D​​S​​Q​​S​​S​​R​​S​​A​​V​​T​221  ​A​​S​​A​​G​​L​​A​​F​​Q​​N​​T​231  ​V​​N​​F​​K​​F​​E​​E​​N​​Y​​T​241  ​S​​Q​​N​​V​​L​​T​​K​​S​​Y​​L​251  ​S​​N​​R​​T​​N​​S​​R​​V​​Q​​S​261  ​I​​G​​G​​V​​P​​F​​Y​​P​​G​​I​271  ​T​​L​​Q​​A​​W​​Q​​Q​​G​​I​​T​281  ​N​​H​​L​​V​​A​​I​​D​​R​​S​​G​291  ​L​​P​​L​​H​​F​​F​​I​​N​​P​​N​301  ​M​​L​​P​​D​​L​​P​​G​​P​​L​​V​311  ​K​​K​​V​​S​​K​​T​​V​​E​​T​​A​321  ​V​​K​​R​​Y​​Y​​T​​F​​N​​T​​Y​331  ​P​​G​​C​​T​​D​​L​​N​​S​​P​​N​341  ​F​​N​​F​​Q​​A​​N​​T​​D​​D​​G​351  ​S​​C​​E​​G​​K​​M​​T​​N​​F​​S​361  ​F​​G​​G​​V​​Y​​Q​​E​​C​​T​​Q​371  ​L​​S​​G​​N​​R​​D​​V​​L​​L​​C​381  ​Q​​K​​L​​E​​Q​​K​​N​​P​​L​​T​391  ​G​​D​​F​​S​​C​​P​​S​​G​​Y​​S​401  ​P​​V​​H​​L​​L​​S​​Q​​I​​H​​E​411  ​E​​G​​Y​​N​​H​​L​​E​​C​​H​​T​421  ​V​​C​​E​​D​​V​​F​​Q​​V​​A​​K​431  ​A​​E​​F​​R​​A​​F​​W​​C​​V​​A​441  ​S​​S​​Q​​V​​P​​E​​N​​S​​G​​L​451  ​L​​F​​G​​G​​L​​F​​S​​S​​K​​S​461  ​I​​N​​P​​M​​T​​N​​A​​Q​​S​​C​471  ​P​​A​​G​​Y​​F​​P​​L​​R​​L​​F​481  ​E​​N​​L​​K​​V​​C​​V​​S​​Q​​D​491  ​Y​​E​​L​​G​​S​​R​​F​​A​​V​​P​501  ​F​​G​​G​​F​​F​​S​​C​​T​​V​​G​511  ​N​​P​​L​​V​​D​​P​​A​​I​​A​​P​521  ​S​​L​​K​​K​​C​​P​​G​​G​​F​​S​531  ​Q​​H​​P​​A​​L​​I​​S​​D​​G​​C​541  ​Q​​V​​S​​Y​​C​​V​​K​​S​​G​​L​551  ​F​​T​​G​​G​​S​​L​​P​​P​​A​​R​561  ​L​​P​​P​​F​​T​​R​​P​​P​​L​​M​571  ​S​​Q​​A​​A​​T​​N​​T​​V​​I​​V​581  ​T​​N​​S​​E​​N​​A​​R​​S​​W​​I​591  ​K​​D​​S​​Q​​T​​H​​Q​​W​​R​​L​601  ​G​​E​​P​​I​​E​​L​​R​​R​​A​​M​611  ​N​​V​​I​​H​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.08 .. 1.56
-0.08
1.56
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
11
GLU
0.54
2
12
VAL
0.63
3
13
GLY
0.68
4
14
VAL
0.65
5
15
GLN
0.73
6
16
LYS
0.77
7
17
CYS
0.85
8
18
LYS
0.84
9
19
ASN
0.86
10
20
ALA
0.85
11
21
LEU
0.97
12
22
LYS
1.14
13
23
LEU
1.20
14
24
PRO
1.25
15
25
VAL
1.33
16
26
LEU
1.12
17
27
GLU
0.99
18
28
VAL
0.99
19
29
LEU
0.94
20
30
PRO
0.79
21
31
GLY
0.80
22
32
GLY
0.74
23
33
GLY
0.79
24
34
TRP
0.77
25
35
ASP
0.70
26
36
ASN
0.69
27
37
LEU
0.65
28
38
ARG
0.61
29
39
ASN
0.63
30
40
VAL
0.52
31
41
ASP
0.51
32
42
MET
0.44
Sequence of
11   ​E​​V​​G​​V​​Q​​K​​C​​K​​N​​A​21   ​L​​K​​L​​P​​V​​L​​E​​V​​L​​P​31   ​G​​G​​G​​W​​D​​N​​L​​R​​N​​V​41   ​D​​M​​G​​R​​V​​M​​E​​L​​T​​Y​51   ​S​​N​​C​​R​​T​​T​​E​​D​​G​​Q​61   ​Y​​I​​I​​P​​D​​E​​I​​F​​T​​I​71   ​P​​Q​​K​​Q​​S​​N​​L​​E​​M​​N​81   ​S​​E​​I​​L​​E​​S​​W​​A​​N​​Y​91   ​Q​​S​​S​​T​​S​​Y​​S​​I​​N​​T​101  ​E​​L​​S​​L​​F​​S​​K​​V​​N​​G​111  ​K​​F​​S​​T​​E​​F​​Q​​R​​M​​K​121  ​T​​L​​Q​​V​​K​​D​​Q​​A​​I​​T​131  ​T​​R​​V​​Q​​V​​R​​N​​L​​V​​Y​141  ​T​​V​​K​​I​​N​​P​​T​​L​​E​​L​151  ​S​​S​​G​​F​​R​​K​​E​​L​​L​​D​161  ​I​​S​​D​​R​​L​​E​​N​​N​​Q​​T​171  ​R​​M​​A​​T​​Y​​L​​A​​E​​L​​L​181  ​V​​L​​N​​Y​​G​​T​​H​​V​​T​​T​191  ​S​​V​​D​​A​​G​​A​​A​​L​​I​​Q​201  ​E​​D​​H​​L​​R​​A​​S​​F​​L​​Q​211  ​D​​S​​Q​​S​​S​​R​​S​​A​​V​​T​221  ​A​​S​​A​​G​​L​​A​​F​​Q​​N​​T​231  ​V​​N​​F​​K​​F​​E​​E​​N​​Y​​T​241  ​S​​Q​​N​​V​​L​​T​​K​​S​​Y​​L​251  ​S​​N​​R​​T​​N​​S​​R​​V​​Q​​S​261  ​I​​G​​G​​V​​P​​F​​Y​​P​​G​​I​271  ​T​​L​​Q​​A​​W​​Q​​Q​​G​​I​​T​281  ​N​​H​​L​​V​​A​​I​​D​​R​​S​​G​291  ​L​​P​​L​​H​​F​​F​​I​​N​​P​​N​301  ​M​​L​​P​​D​​L​​P​​G​​P​​L​​V​311  ​K​​K​​V​​S​​K​​T​​V​​E​​T​​A​321  ​V​​K​​R​​Y​​Y​​T​​F​​N​​T​​Y​331  ​P​​G​​C​​T​​D​​L​​N​​S​​P​​N​341  ​F​​N​​F​​Q​​A​​N​​T​​D​​D​​G​351  ​S​​C​​E​​G​​K​​M​​T​​N​​F​​S​361  ​F​​G​​G​​V​​Y​​Q​​E​​C​​T​​Q​371  ​L​​S​​G​​N​​R​​D​​V​​L​​L​​C​381  ​Q​​K​​L​​E​​Q​​K​​N​​P​​L​​T​391  ​G​​D​​F​​S​​C​​P​​S​​G​​Y​​S​401  ​P​​V​​H​​L​​L​​S​​Q​​I​​H​​E​411  ​E​​G​​Y​​N​​H​​L​​E​​C​​H​​T​421  ​V​​C​​E​​D​​V​​F​​Q​​V​​A​​K​431  ​A​​E​​F​​R​​A​​F​​W​​C​​V​​A​441  ​S​​S​​Q​​V​​P​​E​​N​​S​​G​​L​451  ​L​​F​​G​​G​​L​​F​​S​​S​​K​​S​461  ​I​​N​​P​​M​​T​​N​​A​​Q​​S​​C​471  ​P​​A​​G​​Y​​F​​P​​L​​R​​L​​F​481  ​E​​N​​L​​K​​V​​C​​V​​S​​Q​​D​491  ​Y​​E​​L​​G​​S​​R​​F​​A​​V​​P​501  ​F​​G​​G​​F​​F​​S​​C​​T​​V​​G​511  ​N​​P​​L​​V​​D​​P​​A​​I​​A​​P​521  ​S​​L​​K​​K​​C​​P​​G​​G​​F​​S​531  ​Q​​H​​P​​A​​L​​I​​S​​D​​G​​C​541  ​Q​​V​​S​​Y​​C​​V​​K​​S​​G​​L​551  ​F​​T​​G​​G​​S​​L​​P​​P​​A​​R​561  ​L​​P​​P​​F​​T​​R​​P​​P​​L​​M​571  ​S​​Q​​A​​A​​T​​N​​T​​V​​I​​V​581  ​T​​N​​S​​E​​N​​A​​R​​S​​W​​I​591  ​K​​D​​S​​Q​​T​​H​​Q​​W​​R​​L​601  ​G​​E​​P​​I​​E​​L​​R​​R​​A​​M​611  ​N​​V​​I​​H​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.04 .. 1.14
0.04
1.14
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
11
GLU
0.56
2
12
VAL
0.44
3
13
GLY
0.53
4
14
VAL
0.58
5
15
GLN
0.55
6
16
LYS
0.61
7
17
CYS
0.64
8
18
LYS
0.66
9
19
ASN
0.66
10
20
ALA
0.68
11
21
LEU
0.75
12
22
LYS
0.80
13
23
LEU
0.88
14
24
PRO
0.81
15
25
VAL
0.88
16
26
LEU
0.88
17
27
GLU
0.86
18
28
VAL
0.81
19
29
LEU
0.83
20
30
PRO
0.70
21
31
GLY
0.73
22
32
GLY
0.60
23
33
GLY
0.58
24
34
TRP
0.63
25
35
ASP
0.64
26
36
ASN
0.67
27
37
LEU
0.64
28
38
ARG
0.65
29
39
ASN
0.67
30
40
VAL
0.62
31
41
ASP
0.62
32
42
MET
0.66
Sequence of
11   ​E​​V​​G​​V​​Q​​K​​C​​K​​N​​A​21   ​L​​K​​L​​P​​V​​L​​E​​V​​L​​P​31   ​G​​G​​G​​W​​D​​N​​L​​R​​N​​V​41   ​D​​M​​G​​R​​V​​M​​E​​L​​T​​Y​51   ​S​​N​​C​​R​​T​​T​​E​​D​​G​​Q​61   ​Y​​I​​I​​P​​D​​E​​I​​F​​T​​I​71   ​P​​Q​​K​​Q​​S​​N​​L​​E​​M​​N​81   ​S​​E​​I​​L​​E​​S​​W​​A​​N​​Y​91   ​Q​​S​​S​​T​​S​​Y​​S​​I​​N​​T​101  ​E​​L​​S​​L​​F​​S​​K​​V​​N​​G​111  ​K​​F​​S​​T​​E​​F​​Q​​R​​M​​K​121  ​T​​L​​Q​​V​​K​​D​​Q​​A​​I​​T​131  ​T​​R​​V​​Q​​V​​R​​N​​L​​V​​Y​141  ​T​​V​​K​​I​​N​​P​​T​​L​​E​​L​151  ​S​​S​​G​​F​​R​​K​​E​​L​​L​​D​161  ​I​​S​​D​​R​​L​​E​​N​​N​​Q​​T​171  ​R​​M​​A​​T​​Y​​L​​A​​E​​L​​L​181  ​V​​L​​N​​Y​​G​​T​​H​​V​​T​​T​191  ​S​​V​​D​​A​​G​​A​​A​​L​​I​​Q​201  ​E​​D​​H​​L​​R​​A​​S​​F​​L​​Q​211  ​D​​S​​Q​​S​​S​​R​​S​​A​​V​​T​221  ​A​​S​​A​​G​​L​​A​​F​​Q​​N​​T​231  ​V​​N​​F​​K​​F​​E​​E​​N​​Y​​T​241  ​S​​Q​​N​​V​​L​​T​​K​​S​​Y​​L​251  ​S​​N​​R​​T​​N​​S​​R​​V​​Q​​S​261  ​I​​G​​G​​V​​P​​F​​Y​​P​​G​​I​271  ​T​​L​​Q​​A​​W​​Q​​Q​​G​​I​​T​281  ​N​​H​​L​​V​​A​​I​​D​​R​​S​​G​291  ​L​​P​​L​​H​​F​​F​​I​​N​​P​​N​301  ​M​​L​​P​​D​​L​​P​​G​​P​​L​​V​311  ​K​​K​​V​​S​​K​​T​​V​​E​​T​​A​321  ​V​​K​​R​​Y​​Y​​T​​F​​N​​T​​Y​331  ​P​​G​​C​​T​​D​​L​​N​​S​​P​​N​341  ​F​​N​​F​​Q​​A​​N​​T​​D​​D​​G​351  ​S​​C​​E​​G​​K​​M​​T​​N​​F​​S​361  ​F​​G​​G​​V​​Y​​Q​​E​​C​​T​​Q​371  ​L​​S​​G​​N​​R​​D​​V​​L​​L​​C​381  ​Q​​K​​L​​E​​Q​​K​​N​​P​​L​​T​391  ​G​​D​​F​​S​​C​​P​​S​​G​​Y​​S​401  ​P​​V​​H​​L​​L​​S​​Q​​I​​H​​E​411  ​E​​G​​Y​​N​​H​​L​​E​​C​​H​​T​421  ​V​​C​​E​​D​​V​​F​​Q​​V​​A​​K​431  ​A​​E​​F​​R​​A​​F​​W​​C​​V​​A​441  ​S​​S​​Q​​V​​P​​E​​N​​S​​G​​L​451  ​L​​F​​G​​G​​L​​F​​S​​S​​K​​S​461  ​I​​N​​P​​M​​T​​N​​A​​Q​​S​​C​471  ​P​​A​​G​​Y​​F​​P​​L​​R​​L​​F​481  ​E​​N​​L​​K​​V​​C​​V​​S​​Q​​D​491  ​Y​​E​​L​​G​​S​​R​​F​​A​​V​​P​501  ​F​​G​​G​​F​​F​​S​​C​​T​​V​​G​511  ​N​​P​​L​​V​​D​​P​​A​​I​​A​​P​521  ​S​​L​​K​​K​​C​​P​​G​​G​​F​​S​531  ​Q​​H​​P​​A​​L​​I​​S​​D​​G​​C​541  ​Q​​V​​S​​Y​​C​​V​​K​​S​​G​​L​551  ​F​​T​​G​​G​​S​​L​​P​​P​​A​​R​561  ​L​​P​​P​​F​​T​​R​​P​​P​​L​​M​571  ​S​​Q​​A​​A​​T​​N​​T​​V​​I​​V​581  ​T​​N​​S​​E​​N​​A​​R​​S​​W​​I​591  ​K​​D​​S​​Q​​T​​H​​Q​​W​​R​​L​601  ​G​​E​​P​​I​​E​​L​​R​​R​​A​​M​611  ​N​​V​​I​​H​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -1.13 .. 1.35
-1.13
1.35
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
11
GLU
0.53
2
12
VAL
0.49
3
13
GLY
0.48
4
14
VAL
0.48
5
15
GLN
0.45
6
16
LYS
0.42
7
17
CYS
0.37
8
18
LYS
0.24
9
19
ASN
0.24
10
20
ALA
0.23
11
21
LEU
0.22
12
22
LYS
0.20
13
23
LEU
0.17
14
24
PRO
0.16
15
25
VAL
0.13
16
26
LEU
0.09
17
27
GLU
-0.06
18
28
VAL
-0.14
19
29
LEU
-0.21
20
30
PRO
-0.27
21
31
GLY
-0.24
22
32
GLY
-0.22
23
33
GLY
-0.27
24
34
TRP
-0.28
25
35
ASP
-0.28
26
36
ASN
-0.26
27
37
LEU
-0.16
28
38
ARG
-0.16
29
39
ASN
-0.15
30
40
VAL
-0.15
31
41
ASP
-0.20
32
42
MET
-0.30
Sequence of
11   ​E​​V​​G​​V​​Q​​K​​C​​K​​N​​A​21   ​L​​K​​L​​P​​V​​L​​E​​V​​L​​P​31   ​G​​G​​G​​W​​D​​N​​L​​R​​N​​V​41   ​D​​M​​G​​R​​V​​M​​E​​L​​T​​Y​51   ​S​​N​​C​​R​​T​​T​​E​​D​​G​​Q​61   ​Y​​I​​I​​P​​D​​E​​I​​F​​T​​I​71   ​P​​Q​​K​​Q​​S​​N​​L​​E​​M​​N​81   ​S​​E​​I​​L​​E​​S​​W​​A​​N​​Y​91   ​Q​​S​​S​​T​​S​​Y​​S​​I​​N​​T​101  ​E​​L​​S​​L​​F​​S​​K​​V​​N​​G​111  ​K​​F​​S​​T​​E​​F​​Q​​R​​M​​K​121  ​T​​L​​Q​​V​​K​​D​​Q​​A​​I​​T​131  ​T​​R​​V​​Q​​V​​R​​N​​L​​V​​Y​141  ​T​​V​​K​​I​​N​​P​​T​​L​​E​​L​151  ​S​​S​​G​​F​​R​​K​​E​​L​​L​​D​161  ​I​​S​​D​​R​​L​​E​​N​​N​​Q​​T​171  ​R​​M​​A​​T​​Y​​L​​A​​E​​L​​L​181  ​V​​L​​N​​Y​​G​​T​​H​​V​​T​​T​191  ​S​​V​​D​​A​​G​​A​​A​​L​​I​​Q​201  ​E​​D​​H​​L​​R​​A​​S​​F​​L​​Q​211  ​D​​S​​Q​​S​​S​​R​​S​​A​​V​​T​221  ​A​​S​​A​​G​​L​​A​​F​​Q​​N​​T​231  ​V​​N​​F​​K​​F​​E​​E​​N​​Y​​T​241  ​S​​Q​​N​​V​​L​​T​​K​​S​​Y​​L​251  ​S​​N​​R​​T​​N​​S​​R​​V​​Q​​S​261  ​I​​G​​G​​V​​P​​F​​Y​​P​​G​​I​271  ​T​​L​​Q​​A​​W​​Q​​Q​​G​​I​​T​281  ​N​​H​​L​​V​​A​​I​​D​​R​​S​​G​291  ​L​​P​​L​​H​​F​​F​​I​​N​​P​​N​301  ​M​​L​​P​​D​​L​​P​​G​​P​​L​​V​311  ​K​​K​​V​​S​​K​​T​​V​​E​​T​​A​321  ​V​​K​​R​​Y​​Y​​T​​F​​N​​T​​Y​331  ​P​​G​​C​​T​​D​​L​​N​​S​​P​​N​341  ​F​​N​​F​​Q​​A​​N​​T​​D​​D​​G​351  ​S​​C​​E​​G​​K​​M​​T​​N​​F​​S​361  ​F​​G​​G​​V​​Y​​Q​​E​​C​​T​​Q​371  ​L​​S​​G​​N​​R​​D​​V​​L​​L​​C​381  ​Q​​K​​L​​E​​Q​​K​​N​​P​​L​​T​391  ​G​​D​​F​​S​​C​​P​​S​​G​​Y​​S​401  ​P​​V​​H​​L​​L​​S​​Q​​I​​H​​E​411  ​E​​G​​Y​​N​​H​​L​​E​​C​​H​​T​421  ​V​​C​​E​​D​​V​​F​​Q​​V​​A​​K​431  ​A​​E​​F​​R​​A​​F​​W​​C​​V​​A​441  ​S​​S​​Q​​V​​P​​E​​N​​S​​G​​L​451  ​L​​F​​G​​G​​L​​F​​S​​S​​K​​S​461  ​I​​N​​P​​M​​T​​N​​A​​Q​​S​​C​471  ​P​​A​​G​​Y​​F​​P​​L​​R​​L​​F​481  ​E​​N​​L​​K​​V​​C​​V​​S​​Q​​D​491  ​Y​​E​​L​​G​​S​​R​​F​​A​​V​​P​501  ​F​​G​​G​​F​​F​​S​​C​​T​​V​​G​511  ​N​​P​​L​​V​​D​​P​​A​​I​​A​​P​521  ​S​​L​​K​​K​​C​​P​​G​​G​​F​​S​531  ​Q​​H​​P​​A​​L​​I​​S​​D​​G​​C​541  ​Q​​V​​S​​Y​​C​​V​​K​​S​​G​​L​551  ​F​​T​​G​​G​​S​​L​​P​​P​​A​​R​561  ​L​​P​​P​​F​​T​​R​​P​​P​​L​​M​571  ​S​​Q​​A​​A​​T​​N​​T​​V​​I​​V​581  ​T​​N​​S​​E​​N​​A​​R​​S​​W​​I​591  ​K​​D​​S​​Q​​T​​H​​Q​​W​​R​​L​601  ​G​​E​​P​​I​​E​​L​​R​​R​​A​​M​611  ​N​​V​​I​​H​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.29 .. 3.48
-0.29
3.48
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
11
GLU
1.63
2
12
VAL
1.56
3
13
GLY
1.68
4
14
VAL
1.71
5
15
GLN
1.73
6
16
LYS
1.80
7
17
CYS
1.86
8
18
LYS
1.74
9
19
ASN
1.76
10
20
ALA
1.75
11
21
LEU
1.94
12
22
LYS
2.15
13
23
LEU
2.25
14
24
PRO
2.22
15
25
VAL
2.34
16
26
LEU
2.09
17
27
GLU
1.79
18
28
VAL
1.66
19
29
LEU
1.56
20
30
PRO
1.21
21
31
GLY
1.28
22
32
GLY
1.12
23
33
GLY
1.10
24
34
TRP
1.13
25
35
ASP
1.07
26
36
ASN
1.10
27
37
LEU
1.14
28
38
ARG
1.11
29
39
ASN
1.15
30
40
VAL
1.00
31
41
ASP
0.93
32
42
MET
0.80