22377 7JLQ C v1-2
Structure title cryo-EM structure of human ATG9A in LMNG micelles
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 4.0 Å
Source organism Homo sapiens

Sequence of
36   ​P​​W​​H​​H​​I​​E​​N​​L​​D​​L​46   ​F​​F​​S​​R​​V​​Y​​N​​L​​H​​Q​56   ​K​​N​​G​​F​​T​​C​​M​​L​​I​​G​66   ​E​​I​​F​​E​​L​​M​​Q​​F​​L​​F​76   ​V​​V​​A​​F​​T​​T​​F​​L​​V​​S​86   ​C​​V​​D​​Y​​D​​I​​L​​F​​A​​N​108  ​V​​K​​V​​T​​L​​P​​D​​A​​F​​L​118  ​P​​A​​Q​​V​​C​​S​​A​​R​​I​​Q​128  ​E​​N​​G​​S​​L​​I​​T​​I​​L​​V​138  ​I​​A​​G​​V​​F​​W​​I​​H​​R​​L​148  ​I​​K​​F​​I​​Y​​N​​I​​C​​C​​Y​158  ​W​​E​​I​​H​​S​​F​​Y​​L​​H​​A​168  ​L​​R​​I​​P​​M​​S​​A​​L​​P​​Y​178  ​C​​T​​W​​Q​​E​​V​​Q​​A​​R​​I​188  ​V​​Q​​T​​Q​​K​​E​​H​​Q​​I​​C​198  ​I​​H​​K​​R​​E​​L​​T​​E​​L​​D​208  ​I​​Y​​H​​R​​I​​L​​R​​F​​Q​​N​218  ​Y​​M​​V​​A​​L​​V​​N​​K​​S​​L​228  ​L​​P​​L​​R​​F​​R​​L​​P​​G​​L​238  ​G​​E​​A​​V​​F​​F​​T​​R​​G​​L​248  ​K​​Y​​N​​F​​E​​L​​I​​L​​F​​W​258  ​G​​P​​G​​S​​L​​F​​L​​N​​E​​W​268  ​S​​L​​K​​A​​E​​Y​​K​​R​​G​​G​278  ​Q​​R​​L​​E​​L​​A​​Q​​R​​L​​S​288  ​N​​R​​I​​L​​W​​I​​G​​I​​A​​N​298  ​F​​L​​L​​C​​P​​L​​I​​L​​I​​W​308  ​Q​​I​​L​​Y​​A​​F​​F​​S​​Y​​A​318  ​E​​V​​L​​K​​R​​E​​P​​G​​A​​L​328  ​G​​A​​R​​C​​W​​S​​L​​Y​​G​​R​338  ​C​​Y​​L​​R​​H​​F​​N​​E​​L​​E​348  ​H​​E​​L​​Q​​S​​R​​L​​N​​R​​G​358  ​Y​​K​​P​​A​​S​​K​​Y​​M​​N​​C​368  ​F​​L​​S​​P​​L​​L​​T​​L​​L​​A​378  ​K​​N​​G​​A​​F​​F​​A​​G​​S​​I​388  ​L​​A​​V​​L​​I​​A​​L​​T​​I​​Y​398  ​D​​E​​D​​V​​L​​A​​V​​E​​H​​V​408  ​L​​T​​T​​V​​T​​L​​L​​G​​V​​T​418  ​V​​T​​V​​C​​R​​S​​F​​I​​P​​D​428  ​Q​​H​​M​​V​​F​​C​​P​​E​​Q​​L​438  ​L​​R​​V​​I​​L​​A​​H​​I​​H​​Y​448  ​M​​P​​D​​H​​W​​Q​​G​​N​​A​​H​458  ​R​​S​​Q​​T​​R​​D​​E​​F​​A​​Q​468  ​L​​F​​Q​​Y​​K​​A​​V​​F​​I​​L​478  ​E​​E​​L​​L​​S​​P​​I​​V​​T​​P​488  ​L​​I​​L​​I​​F​​C​​L​​R​​P​​R​498  ​A​​L​​E​​I​​I​​D​​F​​F​​R​​N​508  ​F​​T​​V​​E​​V​​V​​G​​V​​G​​D​518  ​T​​C​​S​​F​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.46 .. 0.47
-0.46
0.47
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
36
PRO
0.13
2
37
TRP
0.09
3
38
HIS
0.10
4
39
HIS
0.17
5
40
ILE
0.06
6
41
GLU
0.05
7
42
ASN
0.00
8
43
LEU
0.03
9
44
ASP
-0.07
10
45
LEU
-0.04
11
46
PHE
-0.07
12
47
PHE
-0.05
13
48
SER
-0.03
14
49
ARG
-0.04
15
50
VAL
-0.02
16
51
TYR
-0.04
17
52
ASN
-0.06
18
53
LEU
-0.04
19
54
HIS
0.00
20
55
GLN
0.00
21
56
LYS
0.08
22
57
ASN
0.10
23
58
GLY
0.03
24
59
PHE
0.05
25
60
THR
0.07
26
61
CYS
0.13
27
62
MET
0.13
28
63
LEU
0.20
29
64
ILE
0.19
30
65
GLY
0.18
31
66
GLU
0.11
32
67
ILE
0.14
Sequence of
36   ​P​​W​​H​​H​​I​​E​​N​​L​​D​​L​46   ​F​​F​​S​​R​​V​​Y​​N​​L​​H​​Q​56   ​K​​N​​G​​F​​T​​C​​M​​L​​I​​G​66   ​E​​I​​F​​E​​L​​M​​Q​​F​​L​​F​76   ​V​​V​​A​​F​​T​​T​​F​​L​​V​​S​86   ​C​​V​​D​​Y​​D​​I​​L​​F​​A​​N​108  ​V​​K​​V​​T​​L​​P​​D​​A​​F​​L​118  ​P​​A​​Q​​V​​C​​S​​A​​R​​I​​Q​128  ​E​​N​​G​​S​​L​​I​​T​​I​​L​​V​138  ​I​​A​​G​​V​​F​​W​​I​​H​​R​​L​148  ​I​​K​​F​​I​​Y​​N​​I​​C​​C​​Y​158  ​W​​E​​I​​H​​S​​F​​Y​​L​​H​​A​168  ​L​​R​​I​​P​​M​​S​​A​​L​​P​​Y​178  ​C​​T​​W​​Q​​E​​V​​Q​​A​​R​​I​188  ​V​​Q​​T​​Q​​K​​E​​H​​Q​​I​​C​198  ​I​​H​​K​​R​​E​​L​​T​​E​​L​​D​208  ​I​​Y​​H​​R​​I​​L​​R​​F​​Q​​N​218  ​Y​​M​​V​​A​​L​​V​​N​​K​​S​​L​228  ​L​​P​​L​​R​​F​​R​​L​​P​​G​​L​238  ​G​​E​​A​​V​​F​​F​​T​​R​​G​​L​248  ​K​​Y​​N​​F​​E​​L​​I​​L​​F​​W​258  ​G​​P​​G​​S​​L​​F​​L​​N​​E​​W​268  ​S​​L​​K​​A​​E​​Y​​K​​R​​G​​G​278  ​Q​​R​​L​​E​​L​​A​​Q​​R​​L​​S​288  ​N​​R​​I​​L​​W​​I​​G​​I​​A​​N​298  ​F​​L​​L​​C​​P​​L​​I​​L​​I​​W​308  ​Q​​I​​L​​Y​​A​​F​​F​​S​​Y​​A​318  ​E​​V​​L​​K​​R​​E​​P​​G​​A​​L​328  ​G​​A​​R​​C​​W​​S​​L​​Y​​G​​R​338  ​C​​Y​​L​​R​​H​​F​​N​​E​​L​​E​348  ​H​​E​​L​​Q​​S​​R​​L​​N​​R​​G​358  ​Y​​K​​P​​A​​S​​K​​Y​​M​​N​​C​368  ​F​​L​​S​​P​​L​​L​​T​​L​​L​​A​378  ​K​​N​​G​​A​​F​​F​​A​​G​​S​​I​388  ​L​​A​​V​​L​​I​​A​​L​​T​​I​​Y​398  ​D​​E​​D​​V​​L​​A​​V​​E​​H​​V​408  ​L​​T​​T​​V​​T​​L​​L​​G​​V​​T​418  ​V​​T​​V​​C​​R​​S​​F​​I​​P​​D​428  ​Q​​H​​M​​V​​F​​C​​P​​E​​Q​​L​438  ​L​​R​​V​​I​​L​​A​​H​​I​​H​​Y​448  ​M​​P​​D​​H​​W​​Q​​G​​N​​A​​H​458  ​R​​S​​Q​​T​​R​​D​​E​​F​​A​​Q​468  ​L​​F​​Q​​Y​​K​​A​​V​​F​​I​​L​478  ​E​​E​​L​​L​​S​​P​​I​​V​​T​​P​488  ​L​​I​​L​​I​​F​​C​​L​​R​​P​​R​498  ​A​​L​​E​​I​​I​​D​​F​​F​​R​​N​508  ​F​​T​​V​​E​​V​​V​​G​​V​​G​​D​518  ​T​​C​​S​​F​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.43 .. 0.67
-0.43
0.67
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
36
PRO
0.47
2
37
TRP
0.49
3
38
HIS
0.47
4
39
HIS
0.39
5
40
ILE
0.35
6
41
GLU
0.27
7
42
ASN
0.31
8
43
LEU
0.36
9
44
ASP
0.32
10
45
LEU
0.36
11
46
PHE
0.33
12
47
PHE
0.29
13
48
SER
0.24
14
49
ARG
0.14
15
50
VAL
0.06
16
51
TYR
0.04
17
52
ASN
0.04
18
53
LEU
0.02
19
54
HIS
-0.02
20
55
GLN
0.02
21
56
LYS
-0.01
22
57
ASN
0.01
23
58
GLY
0.11
24
59
PHE
0.13
25
60
THR
0.17
26
61
CYS
0.18
27
62
MET
0.11
28
63
LEU
0.11
29
64
ILE
0.10
30
65
GLY
0.15
31
66
GLU
0.24
32
67
ILE
0.26
Sequence of
36   ​P​​W​​H​​H​​I​​E​​N​​L​​D​​L​46   ​F​​F​​S​​R​​V​​Y​​N​​L​​H​​Q​56   ​K​​N​​G​​F​​T​​C​​M​​L​​I​​G​66   ​E​​I​​F​​E​​L​​M​​Q​​F​​L​​F​76   ​V​​V​​A​​F​​T​​T​​F​​L​​V​​S​86   ​C​​V​​D​​Y​​D​​I​​L​​F​​A​​N​108  ​V​​K​​V​​T​​L​​P​​D​​A​​F​​L​118  ​P​​A​​Q​​V​​C​​S​​A​​R​​I​​Q​128  ​E​​N​​G​​S​​L​​I​​T​​I​​L​​V​138  ​I​​A​​G​​V​​F​​W​​I​​H​​R​​L​148  ​I​​K​​F​​I​​Y​​N​​I​​C​​C​​Y​158  ​W​​E​​I​​H​​S​​F​​Y​​L​​H​​A​168  ​L​​R​​I​​P​​M​​S​​A​​L​​P​​Y​178  ​C​​T​​W​​Q​​E​​V​​Q​​A​​R​​I​188  ​V​​Q​​T​​Q​​K​​E​​H​​Q​​I​​C​198  ​I​​H​​K​​R​​E​​L​​T​​E​​L​​D​208  ​I​​Y​​H​​R​​I​​L​​R​​F​​Q​​N​218  ​Y​​M​​V​​A​​L​​V​​N​​K​​S​​L​228  ​L​​P​​L​​R​​F​​R​​L​​P​​G​​L​238  ​G​​E​​A​​V​​F​​F​​T​​R​​G​​L​248  ​K​​Y​​N​​F​​E​​L​​I​​L​​F​​W​258  ​G​​P​​G​​S​​L​​F​​L​​N​​E​​W​268  ​S​​L​​K​​A​​E​​Y​​K​​R​​G​​G​278  ​Q​​R​​L​​E​​L​​A​​Q​​R​​L​​S​288  ​N​​R​​I​​L​​W​​I​​G​​I​​A​​N​298  ​F​​L​​L​​C​​P​​L​​I​​L​​I​​W​308  ​Q​​I​​L​​Y​​A​​F​​F​​S​​Y​​A​318  ​E​​V​​L​​K​​R​​E​​P​​G​​A​​L​328  ​G​​A​​R​​C​​W​​S​​L​​Y​​G​​R​338  ​C​​Y​​L​​R​​H​​F​​N​​E​​L​​E​348  ​H​​E​​L​​Q​​S​​R​​L​​N​​R​​G​358  ​Y​​K​​P​​A​​S​​K​​Y​​M​​N​​C​368  ​F​​L​​S​​P​​L​​L​​T​​L​​L​​A​378  ​K​​N​​G​​A​​F​​F​​A​​G​​S​​I​388  ​L​​A​​V​​L​​I​​A​​L​​T​​I​​Y​398  ​D​​E​​D​​V​​L​​A​​V​​E​​H​​V​408  ​L​​T​​T​​V​​T​​L​​L​​G​​V​​T​418  ​V​​T​​V​​C​​R​​S​​F​​I​​P​​D​428  ​Q​​H​​M​​V​​F​​C​​P​​E​​Q​​L​438  ​L​​R​​V​​I​​L​​A​​H​​I​​H​​Y​448  ​M​​P​​D​​H​​W​​Q​​G​​N​​A​​H​458  ​R​​S​​Q​​T​​R​​D​​E​​F​​A​​Q​468  ​L​​F​​Q​​Y​​K​​A​​V​​F​​I​​L​478  ​E​​E​​L​​L​​S​​P​​I​​V​​T​​P​488  ​L​​I​​L​​I​​F​​C​​L​​R​​P​​R​498  ​A​​L​​E​​I​​I​​D​​F​​F​​R​​N​508  ​F​​T​​V​​E​​V​​V​​G​​V​​G​​D​518  ​T​​C​​S​​F​
colorbar

DAQ Score Table

SequenceNo structure available
colorbar

DAQ Score Table