25106 7SG7 U v1-2
Structure title In situ cryo-EM structure of bacteriophage Sf6 gp8:gp14N complex at 2.8 A resolution
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 2.83 Å
Source organism Lederbergvirus Sf6

Sequence of
2    ​P​​I​​Q​​Q​​L​​P​​L​​M​​K​​G​12   ​V​​G​​K​​D​​F​​R​​N​​A​​D​​Y​22   ​I​​D​​Y​​L​​P​​V​​N​​M​​L​​A​32   ​T​​P​​K​​E​​I​​L​​N​​S​​S​​G​42   ​Y​​L​​R​​S​​F​​P​​G​​I​​A​​K​52   ​R​​S​​D​​V​​N​​G​​V​​S​​R​​G​62   ​V​​E​​Y​​N​​M​​A​​Q​​N​​A​​V​72   ​Y​​R​​V​​C​​G​​G​​K​​L​​Y​​K​82   ​G​​E​​S​​E​​V​​G​​D​​V​​A​​G​92   ​S​​G​​R​​V​​S​​M​​A​​H​​G​​R​102  ​T​​S​​Q​​A​​V​​G​​V​​N​​G​​Q​112  ​L​​V​​E​​Y​​R​​Y​​D​​G​​T​​V​122  ​K​​T​​V​​S​​N​​W​​P​​T​​D​​S​132  ​G​​F​​T​​Q​​Y​​E​​L​​G​​S​​V​142  ​R​​D​​I​​T​​R​​L​​R​​G​​R​​Y​152  ​A​​W​​S​​K​​D​​G​​T​​D​​S​​W​162  ​F​​I​​T​​D​​L​​E​​D​​E​​S​​H​172  ​P​​D​​R​​Y​​S​​A​​Q​​Y​​R​​A​182  ​E​​S​​Q​​P​​D​​G​​I​​I​​G​​I​192  ​G​​T​​W​​R​​D​​F​​I​​V​​C​​F​202  ​G​​S​​S​​T​​I​​E​​Y​​F​​S​​L​212  ​T​​G​​A​​T​​T​​A​​G​​A​​A​​L​222  ​Y​​V​​A​​Q​​P​​S​​L​​M​​V​​Q​232  ​K​​G​​I​​A​​G​​T​​Y​​C​​K​​T​242  ​P​​F​​A​​D​​S​​Y​​A​​F​​I​​S​252  ​N​​P​​A​​T​​G​​A​​P​​S​​V​​Y​262  ​I​​I​​G​​S​​G​​Q​​V​​S​​P​​I​272  ​A​​S​​A​​S​​I​​E​​K​​I​​L​​R​282  ​S​​Y​​T​​A​​D​​E​​L​​A​​D​​G​292  ​V​​M​​E​​S​​L​​R​​F​​D​​A​​H​302  ​E​​L​​L​​I​​I​​H​​L​​P​​R​​H​312  ​V​​L​​V​​Y​​D​​A​​S​​S​​S​​A​322  ​N​​G​​P​​Q​​W​​C​​V​​L​​K​​T​332  ​G​​L​​Y​​D​​D​​V​​Y​​R​​A​​I​342  ​D​​F​​I​​Y​​E​​G​​N​​Q​​I​​T​352  ​C​​G​​D​​K​​L​​E​​S​​V​​T​​G​362  ​K​​L​​Q​​F​​D​​I​​S​​S​​Q​​Y​372  ​G​​L​​Q​​Q​​E​​H​​L​​L​​F​​T​382  ​P​​L​​F​​K​​A​​D​​N​​A​​R​​C​392  ​F​​D​​L​​E​​V​​E​​S​​S​​T​​G​402  ​V​​A​​Q​​Y​​A​​D​​R​​L​​F​​L​412  ​S​​A​​T​​T​​D​​G​​I​​N​​Y​​G​422  ​R​​E​​Q​​M​​I​​E​​Q​​N​​E​​P​432  ​F​​V​​Y​​D​​K​​R​​V​​L​​W​​K​442  ​R​​V​​G​​R​​I​​R​​K​​N​​V​​G​452  ​F​​K​​L​​R​​V​​I​​T​​K​​S​​P​462  ​V​​T​​L​​S​​G​​A​​Q​​I​​R​​I​472  ​E​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.45 .. 1.62
0.45
1.62
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
2
PRO
1.12
2
3
ILE
1.19
3
4
GLN
1.26
4
5
GLN
1.29
5
6
LEU
1.30
6
7
PRO
1.22
7
8
LEU
1.20
8
9
MET
1.21
9
10
LYS
1.27
10
11
GLY
1.27
11
12
VAL
1.53
12
13
GLY
1.48
13
14
LYS
1.40
14
15
ASP
1.33
15
16
PHE
1.25
16
17
ARG
1.15
17
18
ASN
0.98
18
19
ALA
0.91
19
20
ASP
0.92
20
21
TYR
0.86
21
22
ILE
0.82
22
23
ASP
0.68
23
24
TYR
0.72
24
25
LEU
0.74
25
26
PRO
0.82
26
27
VAL
0.82
27
28
ASN
0.85
28
29
MET
0.82
29
30
LEU
0.83
30
31
ALA
0.76
31
32
THR
0.83
32
33
PRO
0.86
Sequence of
2    ​P​​I​​Q​​Q​​L​​P​​L​​M​​K​​G​12   ​V​​G​​K​​D​​F​​R​​N​​A​​D​​Y​22   ​I​​D​​Y​​L​​P​​V​​N​​M​​L​​A​32   ​T​​P​​K​​E​​I​​L​​N​​S​​S​​G​42   ​Y​​L​​R​​S​​F​​P​​G​​I​​A​​K​52   ​R​​S​​D​​V​​N​​G​​V​​S​​R​​G​62   ​V​​E​​Y​​N​​M​​A​​Q​​N​​A​​V​72   ​Y​​R​​V​​C​​G​​G​​K​​L​​Y​​K​82   ​G​​E​​S​​E​​V​​G​​D​​V​​A​​G​92   ​S​​G​​R​​V​​S​​M​​A​​H​​G​​R​102  ​T​​S​​Q​​A​​V​​G​​V​​N​​G​​Q​112  ​L​​V​​E​​Y​​R​​Y​​D​​G​​T​​V​122  ​K​​T​​V​​S​​N​​W​​P​​T​​D​​S​132  ​G​​F​​T​​Q​​Y​​E​​L​​G​​S​​V​142  ​R​​D​​I​​T​​R​​L​​R​​G​​R​​Y​152  ​A​​W​​S​​K​​D​​G​​T​​D​​S​​W​162  ​F​​I​​T​​D​​L​​E​​D​​E​​S​​H​172  ​P​​D​​R​​Y​​S​​A​​Q​​Y​​R​​A​182  ​E​​S​​Q​​P​​D​​G​​I​​I​​G​​I​192  ​G​​T​​W​​R​​D​​F​​I​​V​​C​​F​202  ​G​​S​​S​​T​​I​​E​​Y​​F​​S​​L​212  ​T​​G​​A​​T​​T​​A​​G​​A​​A​​L​222  ​Y​​V​​A​​Q​​P​​S​​L​​M​​V​​Q​232  ​K​​G​​I​​A​​G​​T​​Y​​C​​K​​T​242  ​P​​F​​A​​D​​S​​Y​​A​​F​​I​​S​252  ​N​​P​​A​​T​​G​​A​​P​​S​​V​​Y​262  ​I​​I​​G​​S​​G​​Q​​V​​S​​P​​I​272  ​A​​S​​A​​S​​I​​E​​K​​I​​L​​R​282  ​S​​Y​​T​​A​​D​​E​​L​​A​​D​​G​292  ​V​​M​​E​​S​​L​​R​​F​​D​​A​​H​302  ​E​​L​​L​​I​​I​​H​​L​​P​​R​​H​312  ​V​​L​​V​​Y​​D​​A​​S​​S​​S​​A​322  ​N​​G​​P​​Q​​W​​C​​V​​L​​K​​T​332  ​G​​L​​Y​​D​​D​​V​​Y​​R​​A​​I​342  ​D​​F​​I​​Y​​E​​G​​N​​Q​​I​​T​352  ​C​​G​​D​​K​​L​​E​​S​​V​​T​​G​362  ​K​​L​​Q​​F​​D​​I​​S​​S​​Q​​Y​372  ​G​​L​​Q​​Q​​E​​H​​L​​L​​F​​T​382  ​P​​L​​F​​K​​A​​D​​N​​A​​R​​C​392  ​F​​D​​L​​E​​V​​E​​S​​S​​T​​G​402  ​V​​A​​Q​​Y​​A​​D​​R​​L​​F​​L​412  ​S​​A​​T​​T​​D​​G​​I​​N​​Y​​G​422  ​R​​E​​Q​​M​​I​​E​​Q​​N​​E​​P​432  ​F​​V​​Y​​D​​K​​R​​V​​L​​W​​K​442  ​R​​V​​G​​R​​I​​R​​K​​N​​V​​G​452  ​F​​K​​L​​R​​V​​I​​T​​K​​S​​P​462  ​V​​T​​L​​S​​G​​A​​Q​​I​​R​​I​472  ​E​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.10 .. 1.25
0.10
1.25
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
2
PRO
0.61
2
3
ILE
0.57
3
4
GLN
0.61
4
5
GLN
0.69
5
6
LEU
0.69
6
7
PRO
0.72
7
8
LEU
0.62
8
9
MET
0.65
9
10
LYS
0.69
10
11
GLY
0.69
11
12
VAL
0.85
12
13
GLY
0.86
13
14
LYS
0.86
14
15
ASP
0.89
15
16
PHE
0.77
16
17
ARG
0.78
17
18
ASN
0.77
18
19
ALA
0.75
19
20
ASP
0.74
20
21
TYR
0.80
21
22
ILE
0.80
22
23
ASP
0.72
23
24
TYR
0.66
24
25
LEU
0.70
25
26
PRO
0.74
26
27
VAL
0.86
27
28
ASN
0.88
28
29
MET
0.88
29
30
LEU
0.91
30
31
ALA
0.83
31
32
THR
0.84
32
33
PRO
0.79
Converting to mmCIF
SequenceNo structure available
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.80 .. 1.39
-0.80
1.39
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
2
PRO
-0.18
2
3
ILE
-0.26
3
4
GLN
-0.26
4
5
GLN
-0.28
5
6
LEU
-0.27
6
7
PRO
-0.25
7
8
LEU
-0.23
8
9
MET
-0.19
9
10
LYS
-0.16
10
11
GLY
-0.16
11
12
VAL
-0.22
12
13
GLY
-0.23
13
14
LYS
-0.25
14
15
ASP
-0.28
15
16
PHE
-0.29
16
17
ARG
-0.26
17
18
ASN
-0.27
18
19
ALA
-0.22
19
20
ASP
-0.19
20
21
TYR
-0.16
21
22
ILE
-0.09
22
23
ASP
-0.06
23
24
TYR
-0.17
24
25
LEU
-0.40
25
26
PRO
-0.56
26
27
VAL
-0.71
27
28
ASN
-0.78
28
29
MET
-0.80
29
30
LEU
-0.77
30
31
ALA
-0.74
31
32
THR
-0.71
32
33
PRO
-0.67
Sequence of
2    ​P​​I​​Q​​Q​​L​​P​​L​​M​​K​​G​12   ​V​​G​​K​​D​​F​​R​​N​​A​​D​​Y​22   ​I​​D​​Y​​L​​P​​V​​N​​M​​L​​A​32   ​T​​P​​K​​E​​I​​L​​N​​S​​S​​G​42   ​Y​​L​​R​​S​​F​​P​​G​​I​​A​​K​52   ​R​​S​​D​​V​​N​​G​​V​​S​​R​​G​62   ​V​​E​​Y​​N​​M​​A​​Q​​N​​A​​V​72   ​Y​​R​​V​​C​​G​​G​​K​​L​​Y​​K​82   ​G​​E​​S​​E​​V​​G​​D​​V​​A​​G​92   ​S​​G​​R​​V​​S​​M​​A​​H​​G​​R​102  ​T​​S​​Q​​A​​V​​G​​V​​N​​G​​Q​112  ​L​​V​​E​​Y​​R​​Y​​D​​G​​T​​V​122  ​K​​T​​V​​S​​N​​W​​P​​T​​D​​S​132  ​G​​F​​T​​Q​​Y​​E​​L​​G​​S​​V​142  ​R​​D​​I​​T​​R​​L​​R​​G​​R​​Y​152  ​A​​W​​S​​K​​D​​G​​T​​D​​S​​W​162  ​F​​I​​T​​D​​L​​E​​D​​E​​S​​H​172  ​P​​D​​R​​Y​​S​​A​​Q​​Y​​R​​A​182  ​E​​S​​Q​​P​​D​​G​​I​​I​​G​​I​192  ​G​​T​​W​​R​​D​​F​​I​​V​​C​​F​202  ​G​​S​​S​​T​​I​​E​​Y​​F​​S​​L​212  ​T​​G​​A​​T​​T​​A​​G​​A​​A​​L​222  ​Y​​V​​A​​Q​​P​​S​​L​​M​​V​​Q​232  ​K​​G​​I​​A​​G​​T​​Y​​C​​K​​T​242  ​P​​F​​A​​D​​S​​Y​​A​​F​​I​​S​252  ​N​​P​​A​​T​​G​​A​​P​​S​​V​​Y​262  ​I​​I​​G​​S​​G​​Q​​V​​S​​P​​I​272  ​A​​S​​A​​S​​I​​E​​K​​I​​L​​R​282  ​S​​Y​​T​​A​​D​​E​​L​​A​​D​​G​292  ​V​​M​​E​​S​​L​​R​​F​​D​​A​​H​302  ​E​​L​​L​​I​​I​​H​​L​​P​​R​​H​312  ​V​​L​​V​​Y​​D​​A​​S​​S​​S​​A​322  ​N​​G​​P​​Q​​W​​C​​V​​L​​K​​T​332  ​G​​L​​Y​​D​​D​​V​​Y​​R​​A​​I​342  ​D​​F​​I​​Y​​E​​G​​N​​Q​​I​​T​352  ​C​​G​​D​​K​​L​​E​​S​​V​​T​​G​362  ​K​​L​​Q​​F​​D​​I​​S​​S​​Q​​Y​372  ​G​​L​​Q​​Q​​E​​H​​L​​L​​F​​T​382  ​P​​L​​F​​K​​A​​D​​N​​A​​R​​C​392  ​F​​D​​L​​E​​V​​E​​S​​S​​T​​G​402  ​V​​A​​Q​​Y​​A​​D​​R​​L​​F​​L​412  ​S​​A​​T​​T​​D​​G​​I​​N​​Y​​G​422  ​R​​E​​Q​​M​​I​​E​​Q​​N​​E​​P​432  ​F​​V​​Y​​D​​K​​R​​V​​L​​W​​K​442  ​R​​V​​G​​R​​I​​R​​K​​N​​V​​G​452  ​F​​K​​L​​R​​V​​I​​T​​K​​S​​P​462  ​V​​T​​L​​S​​G​​A​​Q​​I​​R​​I​472  ​E​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.84 .. 3.97
0.84
3.97
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
2
PRO
1.55
2
3
ILE
1.50
3
4
GLN
1.61
4
5
GLN
1.69
5
6
LEU
1.72
6
7
PRO
1.69
7
8
LEU
1.60
8
9
MET
1.67
9
10
LYS
1.80
10
11
GLY
1.79
11
12
VAL
2.16
12
13
GLY
2.12
13
14
LYS
2.02
14
15
ASP
1.94
15
16
PHE
1.73
16
17
ARG
1.67
17
18
ASN
1.48
18
19
ALA
1.44
19
20
ASP
1.48
20
21
TYR
1.50
21
22
ILE
1.53
22
23
ASP
1.35
23
24
TYR
1.21
24
25
LEU
1.05
25
26
PRO
0.99
26
27
VAL
0.97
27
28
ASN
0.95
28
29
MET
0.90
29
30
LEU
0.96
30
31
ALA
0.84
31
32
THR
0.96
32
33
PRO
0.99