26058 7TPK E v1-0
Structure title SARS-CoV-2 E406W mutant RBD - Local Refinement
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 3.4 Å
Source organism Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2

Sequence of
333  ​T​​N​​L​​C​​P​​F​​G​​E​​V​​F​343  ​N​​A​​T​​R​​F​​A​​S​​V​​Y​​A​353  ​W​​N​​R​​K​​R​​I​​S​​N​​C​​V​363  ​A​​D​​Y​​S​​V​​L​​Y​​N​​S​​A​373  ​S​​F​​S​​T​​F​​K​​C​​Y​​G​​V​383  ​S​​P​​T​​K​​L​​N​​D​​L​​C​​F​393  ​T​​N​​V​​Y​​A​​D​​S​​F​​V​​I​403  ​R​​G​​D​​W​​V​​R​​Q​​I​​A​​P​413  ​G​​Q​​T​​G​​K​​I​​A​​D​​Y​​N​423  ​Y​​K​​L​​P​​D​​D​​F​​T​​G​​C​433  ​V​​I​​A​​W​​N​​S​​N​​N​​L​​D​443  ​S​​K​​V​​G​​G​​N​​Y​​N​​Y​​L​453  ​Y​​R​​L​​F​​R​​K​​S​​N​​L​​K​463  ​P​​F​​E​​R​​D​​I​​S​​T​​E​​I​473  ​Y​​Q​​A​​G​​S​​T​​P​​C​​N​​G​483  ​V​​E​​G​​F​​N​​C​​Y​​F​​P​​L​493  ​Q​​S​​Y​​G​​F​​Q​​P​​T​​N​​G​503  ​V​​G​​Y​​Q​​P​​Y​​R​​V​​V​​V​513  ​L​​S​​F​​E​​L​​L​​H​​A​​P​​A​523  ​T​​V​​C​​G​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.11 .. 1.18
-0.11
1.18
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
333
THR
0.38
2
334
ASN
0.29
3
335
LEU
0.43
4
336
CYS
0.45
5
337
PRO
0.41
6
338
PHE
0.40
7
339
GLY
0.44
8
340
GLU
0.46
9
341
VAL
0.38
10
342
PHE
0.40
11
343
ASN
0.45
12
344
ALA
0.49
13
345
THR
0.57
14
346
ARG
0.57
15
347
PHE
0.74
16
348
ALA
0.65
17
349
SER
0.64
18
350
VAL
0.65
19
351
TYR
0.68
20
352
ALA
0.60
21
353
TRP
0.62
22
354
ASN
0.56
23
355
ARG
0.56
24
356
LYS
0.61
25
357
ARG
0.62
26
358
ILE
0.58
27
359
SER
0.64
28
360
ASN
0.76
29
361
CYS
0.77
30
362
VAL
0.75
31
363
ALA
0.71
32
364
ASP
0.66
Sequence of
333  ​T​​N​​L​​C​​P​​F​​G​​E​​V​​F​343  ​N​​A​​T​​R​​F​​A​​S​​V​​Y​​A​353  ​W​​N​​R​​K​​R​​I​​S​​N​​C​​V​363  ​A​​D​​Y​​S​​V​​L​​Y​​N​​S​​A​373  ​S​​F​​S​​T​​F​​K​​C​​Y​​G​​V​383  ​S​​P​​T​​K​​L​​N​​D​​L​​C​​F​393  ​T​​N​​V​​Y​​A​​D​​S​​F​​V​​I​403  ​R​​G​​D​​W​​V​​R​​Q​​I​​A​​P​413  ​G​​Q​​T​​G​​K​​I​​A​​D​​Y​​N​423  ​Y​​K​​L​​P​​D​​D​​F​​T​​G​​C​433  ​V​​I​​A​​W​​N​​S​​N​​N​​L​​D​443  ​S​​K​​V​​G​​G​​N​​Y​​N​​Y​​L​453  ​Y​​R​​L​​F​​R​​K​​S​​N​​L​​K​463  ​P​​F​​E​​R​​D​​I​​S​​T​​E​​I​473  ​Y​​Q​​A​​G​​S​​T​​P​​C​​N​​G​483  ​V​​E​​G​​F​​N​​C​​Y​​F​​P​​L​493  ​Q​​S​​Y​​G​​F​​Q​​P​​T​​N​​G​503  ​V​​G​​Y​​Q​​P​​Y​​R​​V​​V​​V​513  ​L​​S​​F​​E​​L​​L​​H​​A​​P​​A​523  ​T​​V​​C​​G​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.15 .. 0.75
-0.15
0.75
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
333
THR
0.51
2
334
ASN
0.62
3
335
LEU
0.65
4
336
CYS
0.65
5
337
PRO
0.63
6
338
PHE
0.54
7
339
GLY
0.42
8
340
GLU
0.41
9
341
VAL
0.44
10
342
PHE
0.39
11
343
ASN
0.39
12
344
ALA
0.41
13
345
THR
0.44
14
346
ARG
0.52
15
347
PHE
0.53
16
348
ALA
0.55
17
349
SER
0.58
18
350
VAL
0.55
19
351
TYR
0.56
20
352
ALA
0.53
21
353
TRP
0.50
22
354
ASN
0.47
23
355
ARG
0.44
24
356
LYS
0.36
25
357
ARG
0.43
26
358
ILE
0.45
27
359
SER
0.48
28
360
ASN
0.50
29
361
CYS
0.59
30
362
VAL
0.59
31
363
ALA
0.53
32
364
ASP
0.57
Sequence of
333  ​T​​N​​L​​C​​P​​F​​G​​E​​V​​F​343  ​N​​A​​T​​R​​F​​A​​S​​V​​Y​​A​353  ​W​​N​​R​​K​​R​​I​​S​​N​​C​​V​363  ​A​​D​​Y​​S​​V​​L​​Y​​N​​S​​A​373  ​S​​F​​S​​T​​F​​K​​C​​Y​​G​​V​383  ​S​​P​​T​​K​​L​​N​​D​​L​​C​​F​393  ​T​​N​​V​​Y​​A​​D​​S​​F​​V​​I​403  ​R​​G​​D​​W​​V​​R​​Q​​I​​A​​P​413  ​G​​Q​​T​​G​​K​​I​​A​​D​​Y​​N​423  ​Y​​K​​L​​P​​D​​D​​F​​T​​G​​C​433  ​V​​I​​A​​W​​N​​S​​N​​N​​L​​D​443  ​S​​K​​V​​G​​G​​N​​Y​​N​​Y​​L​453  ​Y​​R​​L​​F​​R​​K​​S​​N​​L​​K​463  ​P​​F​​E​​R​​D​​I​​S​​T​​E​​I​473  ​Y​​Q​​A​​G​​S​​T​​P​​C​​N​​G​483  ​V​​E​​G​​F​​N​​C​​Y​​F​​P​​L​493  ​Q​​S​​Y​​G​​F​​Q​​P​​T​​N​​G​503  ​V​​G​​Y​​Q​​P​​Y​​R​​V​​V​​V​513  ​L​​S​​F​​E​​L​​L​​H​​A​​P​​A​523  ​T​​V​​C​​G​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.58 .. 0.46
-0.58
0.46
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
333
THR
0.23
2
334
ASN
0.24
3
335
LEU
0.22
4
336
CYS
0.20
5
337
PRO
0.14
6
338
PHE
0.12
7
339
GLY
0.12
8
340
GLU
0.11
9
341
VAL
0.10
10
342
PHE
0.06
11
343
ASN
0.06
12
344
ALA
0.03
13
345
THR
0.03
14
346
ARG
-0.03
15
347
PHE
0.00
16
348
ALA
0.14
17
349
SER
0.16
18
350
VAL
0.05
19
351
TYR
-0.01
20
352
ALA
-0.01
21
353
TRP
-0.02
22
354
ASN
-0.03
23
355
ARG
-0.01
24
356
LYS
0.03
25
357
ARG
0.10
26
358
ILE
0.17
27
359
SER
0.23
28
360
ASN
0.28
29
361
CYS
0.34
30
362
VAL
0.32
31
363
ALA
0.37
32
364
ASP
0.36
Sequence of
333  ​T​​N​​L​​C​​P​​F​​G​​E​​V​​F​343  ​N​​A​​T​​R​​F​​A​​S​​V​​Y​​A​353  ​W​​N​​R​​K​​R​​I​​S​​N​​C​​V​363  ​A​​D​​Y​​S​​V​​L​​Y​​N​​S​​A​373  ​S​​F​​S​​T​​F​​K​​C​​Y​​G​​V​383  ​S​​P​​T​​K​​L​​N​​D​​L​​C​​F​393  ​T​​N​​V​​Y​​A​​D​​S​​F​​V​​I​403  ​R​​G​​D​​W​​V​​R​​Q​​I​​A​​P​413  ​G​​Q​​T​​G​​K​​I​​A​​D​​Y​​N​423  ​Y​​K​​L​​P​​D​​D​​F​​T​​G​​C​433  ​V​​I​​A​​W​​N​​S​​N​​N​​L​​D​443  ​S​​K​​V​​G​​G​​N​​Y​​N​​Y​​L​453  ​Y​​R​​L​​F​​R​​K​​S​​N​​L​​K​463  ​P​​F​​E​​R​​D​​I​​S​​T​​E​​I​473  ​Y​​Q​​A​​G​​S​​T​​P​​C​​N​​G​483  ​V​​E​​G​​F​​N​​C​​Y​​F​​P​​L​493  ​Q​​S​​Y​​G​​F​​Q​​P​​T​​N​​G​503  ​V​​G​​Y​​Q​​P​​Y​​R​​V​​V​​V​513  ​L​​S​​F​​E​​L​​L​​H​​A​​P​​A​523  ​T​​V​​C​​G​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.41 .. 1.84
-0.41
1.84
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
333
THR
1.13
2
334
ASN
1.15
3
335
LEU
1.30
4
336
CYS
1.30
5
337
PRO
1.18
6
338
PHE
1.05
7
339
GLY
0.97
8
340
GLU
0.98
9
341
VAL
0.92
10
342
PHE
0.86
11
343
ASN
0.90
12
344
ALA
0.93
13
345
THR
1.03
14
346
ARG
1.06
15
347
PHE
1.27
16
348
ALA
1.34
17
349
SER
1.37
18
350
VAL
1.25
19
351
TYR
1.23
20
352
ALA
1.12
21
353
TRP
1.09
22
354
ASN
1.00
23
355
ARG
0.99
24
356
LYS
1.00
25
357
ARG
1.15
26
358
ILE
1.21
27
359
SER
1.36
28
360
ASN
1.55
29
361
CYS
1.70
30
362
VAL
1.66
31
363
ALA
1.60
32
364
ASP
1.59