27417 8DG7 A v1-1
27417_8dg7_A_v1-1
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RCSB PDB: 8DG7
EMDB: 27417
Structure title Structural Basis of MicroRNA Biogenesis by Dicer-1 and Its Partner Protein Loqs-PB - complex III
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 3.32 Å
Source organism Drosophila melanogaster
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Sequence of
11   ​H​​T​​T​​V​​F​​T​​P​​R​​D​​F​21   ​Q​​V​​E​​L​​L​​A​​T​​A​​Y​​E​31   ​R​​N​​T​​I​​I​​C​​L​​G​​H​​R​41   ​S​​S​​K​​E​​F​​I​​A​​L​​K​​L​51   ​L​​Q​​E​​L​​S​​R​​R​​A​​R​​R​61   ​H​​G​​R​​V​​S​​V​​Y​​L​​S​​C​71   ​E​​V​​G​​T​​S​​T​​E​​P​​C​​S​81   ​I​​Y​​T​​M​​L​​T​​H​​L​​T​​D​91   ​L​​R​​V​​W​​Q​​E​​Q​​P​​D​​M​101  ​Q​​I​​P​​F​​D​​H​​C​​W​​T​​D​111  ​Y​​H​​V​​S​​I​​L​​R​​P​​E​​G​121  ​F​​L​​Y​​L​​L​​E​​T​​R​​E​​L​131  ​L​​L​​S​​R​​V​​E​​L​​I​​V​​L​141  ​E​​D​​C​​H​​D​​S​​A​​V​​Y​​Q​151  ​R​​I​​R​​P​​L​​F​​E​​N​​H​​I​161  ​M​​P​​A​​P​​P​​A​​D​​R​​P​​R​171  ​I​​L​​G​​L​​A​​G​​P​​L​​H​​S​181  ​A​​G​​C​​E​​L​​Q​​Q​​L​​S​​A​191  ​M​​L​​A​​T​​L​​E​​Q​​S​​V​​L​201  ​C​​Q​​I​​E​​S​​A​​S​​D​​I​​V​211  ​T​​V​​L​​R​​Y​​C​​S​​R​​P​​H​221  ​E​​Y​​I​​V​​Q​​C​​A​​P​​F​​E​231  ​M​​D​​E​​L​​S​​L​​V​​L​​A​​D​241  ​V​​L​​N​​T​​H​​K​​S​​F​​L​​L​251  ​D​​H​​R​​Y​​D​​P​​D​​P​​L​​N​282  ​V​​I​​N​​S​​L​​L​​V​​V​​L​​H​292  ​E​​M​​G​​P​​W​​C​​T​​Q​​R​​A​302  ​A​​H​​H​​F​​Y​​Q​​C​​N​​E​​K​312  ​L​​K​​V​​K​​T​​P​​H​​E​​R​​H​322  ​Y​​L​​L​​Y​​C​​L​​V​​S​​T​​A​332  ​L​​I​​Q​​L​​Y​​S​​L​​C​​E​​H​342  ​A​​F​​H​​R​​H​​L​​S​​R​​Q​​T​357  ​I​​E​​R​​Y​​S​​S​​P​​K​​V​​R​367  ​R​​L​​L​​Q​​T​​L​​R​​C​​F​​K​492  ​T​​L​​C​​A​​L​​I​​Y​​C​​N​​Q​502  ​N​​H​​T​​A​​R​​V​​L​​F​​E​​L​512  ​L​​A​​E​​I​​S​​R​​R​​D​​P​​D​522  ​L​​K​​F​​L​​R​​C​​Q​​Y​​T​​T​532  ​D​​R​​V​​A​​D​​P​​T​​T​​E​​P​542  ​K​​E​​A​​E​​L​​E​​H​​R​​R​​Q​552  ​E​​E​​V​​L​​K​​R​​F​​R​​M​​H​562  ​D​​C​​N​​V​​L​​I​​G​​T​​S​​V​572  ​L​​E​​E​​G​​I​​D​​V​​P​​K​​C​582  ​N​​L​​V​​V​​R​​W​​D​​P​​P​​T​592  ​T​​Y​​R​​S​​Y​​V​​Q​​C​​K​​G​602  ​R​​A​​R​​A​​A​​P​​A​​Y​​H​​V​612  ​I​​L​​V​​A​​P​​S​​Y​​K​​S​​P​622  ​T​​V​​G​​S​​V​​Q​​L​​T​​D​​R​632  ​S​​H​​R​​Y​​I​​C​​A​​T​​S​​L​761  ​A​​S​​T​​T​​K​​D​​L​​V​​H​​Q​771  ​M​​A​​Q​​Y​​R​​E​​I​​E​​Q​​M​781  ​L​​L​​S​​K​​C​​A​​N​​T​​E​​P​791  ​P​​E​​Q​​E​​Q​​C​​E​​A​​E​​R​801  ​F​​S​​A​​C​​L​​A​​A​​Y​​R​​P​811  ​K​​P​​H​​L​​L​​T​​G​​A​​S​​V​821  ​D​​L​​G​​S​​A​​I​​A​​L​​V​​N​831  ​K​​Y​​C​​A​​R​​L​​P​​S​​D​​T​841  ​F​​T​​K​​L​​T​​A​​L​​W​​R​​C​851  ​T​​R​​N​​E​​R​​A​​G​​V​​T​​L​861  ​F​​Q​​Y​​T​​L​​R​​L​​P​​I​​N​871  ​S​​P​​L​​K​​H​​D​​I​​V​​G​​L​881  ​P​​M​​P​​T​​Q​​T​​L​​A​​R​​R​891  ​L​​A​​A​​L​​Q​​A​​C​​V​​E​​L​901  ​H​​R​​I​​G​​E​​L​​D​​D​​Q​​L​911  ​Q​​P​​I​​G​​K​​E​​G​​F​​R​​A​921  ​L​​E​​P​​D​​W​​E​​C​​F​​E​​L​931  ​E​​P​​E​​D​​E​​Q​​I​​V​​Q​​L​941  ​S​​D​​E​​P​​R​​P​​G​​T​​T​​K​951  ​R​​R​​Q​​Y​​Y​​Y​​K​​R​​I​​A​961  ​S​​E​​F​​C​​D​​C​​R​​P​​V​​A​971  ​G​​A​​P​​C​​Y​​L​​Y​​F​​I​​Q​981  ​L​​T​​L​​Q​​C​​P​​I​​P​​E​​E​991  ​Q​​N​​T​​R​​G​​R​​K​​I​​Y​​P​1001 ​P​​E​​D​​A​​Q​​Q​​G​​F​​G​​I​1011 ​L​​T​​T​​K​​R​​I​​P​​K​​L​​S​1021 ​A​​F​​S​​I​​F​​T​​R​​S​​G​​E​1031 ​V​​K​​V​​S​​L​​E​​L​​A​​K​​E​1041 ​R​​V​​I​​L​​T​​S​​E​​Q​​I​​V​1051 ​C​​I​​N​​G​​F​​L​​N​​Y​​T​​F​1061 ​T​​N​​V​​L​​R​​L​​Q​​K​​F​​L​1071 ​M​​L​​F​​D​​P​​D​​S​​T​​E​​N​1081 ​C​​V​​F​​I​​V​​P​​T​​V​​K​​A​1091 ​P​​A​​G​​G​​K​​H​​I​​D​​W​​Q​1101 ​F​​L​​E​​L​​I​​Q​​A​​N​​G​​N​1111 ​T​​M​​P​​R​​A​​V​​P​​D​​E​​E​1121 ​R​​Q​​A​​Q​​P​​F​​D​​P​​Q​​R​1131 ​F​​Q​​D​​A​​V​​V​​M​​P​​W​​Y​1141 ​R​​N​​Q​​D​​Q​​P​​Q​​Y​​F​​Y​1151 ​V​​A​​E​​I​​C​​P​​H​​L​​S​​P​1161 ​L​​S​​C​​F​​P​​G​​D​​N​​Y​​R​1171 ​T​​F​​K​​H​​Y​​Y​​L​​V​​K​​Y​1181 ​G​​L​​T​​I​​Q​​N​​T​​S​​Q​​P​1191 ​L​​L​​D​​V​​D​​H​​T​​S​​A​​R​1201 ​L​​N​​F​​L​​T​​P​​R​​Y​​V​​N​1211 ​R​​K​​G​​V​​A​​L​​P​​T​​S​​S​1221 ​E​​E​​T​​K​​R​​A​​K​​R​​E​​N​1231 ​L​​E​​Q​​K​​Q​​I​​L​​V​​P​​E​1241 ​L​​C​​T​​V​​H​​P​​F​​P​​A​​S​1251 ​L​​W​​R​​T​​A​​V​​C​​L​​P​​C​1261 ​I​​L​​Y​​R​​I​​N​​G​​L​​L​​L​1271 ​A​​D​​D​​I​​R​​K​​Q​​V​​S​​A​1281 ​D​​L​​G​​L​​G​​R​​Q​​Q​​I​​F​1295 ​E​​W​​P​​M​​L​​D​​F​​G​​W​​R​1526 ​Q​​K​​Q​​L​​S​​I​​I​​Q​​A​​T​1536 ​N​​A​​N​​E​​R​​Q​​Y​​Q​​Q​​T​1546 ​K​​N​​L​​L​​I​​G​​F​​N​​F​​K​1556 ​H​​E​​R​​Y​​E​​E​​S​​I​​A​​K​1574 ​L​​K​​T​​E​​I​​E​​S​​G​​G​​M​1584 ​L​​V​​P​​H​​D​​Q​​Q​​L​​V​​V​1607 ​S​​M​​M​​E​​L​​L​​K​​Q​​L​​L​1617 ​P​​Y​​V​​L​​A​​K​​K​​L​​G​​D​1631 ​R​​R​​E​​L​​L​​L​​S​​D​​L​​V​1641 ​E​​L​​N​​A​​D​​W​​V​​A​​R​​H​1651 ​E​​Q​​E​​T​​Y​​N​​V​​M​​G​​D​1663 ​S​​F​​D​​N​​Y​​N​​D​​H​​H​​A​1706 ​G​​F​​S​​F​​D​​R​​Q​​P​​D​​L​1716 ​V​​G​​H​​P​​G​​P​​S​​P​​S​​I​1726 ​I​​L​​Q​​A​​L​​T​​M​​S​​N​​A​1736 ​N​​D​​G​​I​​N​​L​​E​​R​​L​​E​1746 ​T​​I​​G​​D​​S​​F​​L​​K​​Y​​A​1756 ​I​​T​​T​​Y​​L​​Y​​I​​T​​Y​​E​1766 ​N​​V​​H​​E​​G​​K​​L​​S​​H​​L​1776 ​R​​S​​K​​Q​​V​​A​​N​​L​​N​​L​1786 ​Y​​R​​L​​G​​R​​R​​K​​R​​L​​G​1796 ​E​​Y​​M​​I​​A​​T​​K​​F​​E​​P​1806 ​H​​D​​N​​W​​L​​P​​P​​C​​Y​​Y​1816 ​V​​P​​K​​E​​L​​E​​K​​A​​L​​K​1836 ​L​​A​​D​​L​​L​​D​​I​​K​​N​​L​1846 ​S​​S​​V​​Q​​I​​C​​E​​M​​V​​D​1884 ​F​​S​​C​​F​​I​​P​​Y​​N​​L​​V​1894 ​S​​Q​​H​​S​​I​​P​​D​​K​​S​​I​1904 ​A​​D​​C​​V​​E​​A​​L​​I​​G​​A​1914 ​Y​​L​​I​​E​​C​​G​​P​​R​​G​​A​1924 ​L​​L​​F​​M​​A​​W​​L​​G​​V​​R​1934 ​V​​L​​P​​I​​T​​R​​Q​​L​​D​​G​1944 ​G​​N​​Q​​E​​Q​​R​​I​​P​​G​​S​1954 ​T​​K​​P​​N​​A​​E​​N​​V​​V​​T​1964 ​V​​Y​​G​​A​​W​​P​​T​​P​​R​​S​1974 ​P​​L​​L​​H​​F​​A​​P​​N​​A​​T​1984 ​E​​E​​L​​D​​Q​​L​​L​​S​​G​​F​1994 ​E​​E​​F​​E​​E​​S​​L​​G​​Y​​K​2004 ​F​​R​​D​​R​​S​​Y​​L​​L​​Q​​A​2014 ​M​​T​​H​​A​​S​​Y​​T​​P​​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DAQ Score Table

Score range in the table: -0.56 .. 1.02
-0.56
1.02
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
11
HIS
-0.06
2
12
THR
0.00
3
13
THR
-0.02
4
14
VAL
0.02
5
15
PHE
-0.10
6
16
THR
0.05
7
17
PRO
0.11
8
18
ARG
0.07
9
19
ASP
0.11
10
20
PHE
0.16
11
21
GLN
0.14
12
22
VAL
0.14
13
23
GLU
0.17
14
24
LEU
0.25
15
25
LEU
0.26
16
26
ALA
0.38
17
27
THR
0.27
18
28
ALA
0.39
19
29
TYR
0.46
20
30
GLU
0.51
21
31
ARG
0.53
22
32
ASN
0.58
23
33
THR
0.48
24
34
ILE
0.53
25
35
ILE
0.45
26
36
CYS
0.33
27
37
LEU
0.37
28
38
GLY
0.43
29
39
HIS
0.41
30
40
ARG
0.39
31
41
SER
0.39
32
42
SER
0.42
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11   ​H​​T​​T​​V​​F​​T​​P​​R​​D​​F​21   ​Q​​V​​E​​L​​L​​A​​T​​A​​Y​​E​31   ​R​​N​​T​​I​​I​​C​​L​​G​​H​​R​41   ​S​​S​​K​​E​​F​​I​​A​​L​​K​​L​51   ​L​​Q​​E​​L​​S​​R​​R​​A​​R​​R​61   ​H​​G​​R​​V​​S​​V​​Y​​L​​S​​C​71   ​E​​V​​G​​T​​S​​T​​E​​P​​C​​S​81   ​I​​Y​​T​​M​​L​​T​​H​​L​​T​​D​91   ​L​​R​​V​​W​​Q​​E​​Q​​P​​D​​M​101  ​Q​​I​​P​​F​​D​​H​​C​​W​​T​​D​111  ​Y​​H​​V​​S​​I​​L​​R​​P​​E​​G​121  ​F​​L​​Y​​L​​L​​E​​T​​R​​E​​L​131  ​L​​L​​S​​R​​V​​E​​L​​I​​V​​L​141  ​E​​D​​C​​H​​D​​S​​A​​V​​Y​​Q​151  ​R​​I​​R​​P​​L​​F​​E​​N​​H​​I​161  ​M​​P​​A​​P​​P​​A​​D​​R​​P​​R​171  ​I​​L​​G​​L​​A​​G​​P​​L​​H​​S​181  ​A​​G​​C​​E​​L​​Q​​Q​​L​​S​​A​191  ​M​​L​​A​​T​​L​​E​​Q​​S​​V​​L​201  ​C​​Q​​I​​E​​S​​A​​S​​D​​I​​V​211  ​T​​V​​L​​R​​Y​​C​​S​​R​​P​​H​221  ​E​​Y​​I​​V​​Q​​C​​A​​P​​F​​E​231  ​M​​D​​E​​L​​S​​L​​V​​L​​A​​D​241  ​V​​L​​N​​T​​H​​K​​S​​F​​L​​L​251  ​D​​H​​R​​Y​​D​​P​​D​​P​​L​​N​282  ​V​​I​​N​​S​​L​​L​​V​​V​​L​​H​292  ​E​​M​​G​​P​​W​​C​​T​​Q​​R​​A​302  ​A​​H​​H​​F​​Y​​Q​​C​​N​​E​​K​312  ​L​​K​​V​​K​​T​​P​​H​​E​​R​​H​322  ​Y​​L​​L​​Y​​C​​L​​V​​S​​T​​A​332  ​L​​I​​Q​​L​​Y​​S​​L​​C​​E​​H​342  ​A​​F​​H​​R​​H​​L​​S​​R​​Q​​T​357  ​I​​E​​R​​Y​​S​​S​​P​​K​​V​​R​367  ​R​​L​​L​​Q​​T​​L​​R​​C​​F​​K​492  ​T​​L​​C​​A​​L​​I​​Y​​C​​N​​Q​502  ​N​​H​​T​​A​​R​​V​​L​​F​​E​​L​512  ​L​​A​​E​​I​​S​​R​​R​​D​​P​​D​522  ​L​​K​​F​​L​​R​​C​​Q​​Y​​T​​T​532  ​D​​R​​V​​A​​D​​P​​T​​T​​E​​P​542  ​K​​E​​A​​E​​L​​E​​H​​R​​R​​Q​552  ​E​​E​​V​​L​​K​​R​​F​​R​​M​​H​562  ​D​​C​​N​​V​​L​​I​​G​​T​​S​​V​572  ​L​​E​​E​​G​​I​​D​​V​​P​​K​​C​582  ​N​​L​​V​​V​​R​​W​​D​​P​​P​​T​592  ​T​​Y​​R​​S​​Y​​V​​Q​​C​​K​​G​602  ​R​​A​​R​​A​​A​​P​​A​​Y​​H​​V​612  ​I​​L​​V​​A​​P​​S​​Y​​K​​S​​P​622  ​T​​V​​G​​S​​V​​Q​​L​​T​​D​​R​632  ​S​​H​​R​​Y​​I​​C​​A​​T​​S​​L​761  ​A​​S​​T​​T​​K​​D​​L​​V​​H​​Q​771  ​M​​A​​Q​​Y​​R​​E​​I​​E​​Q​​M​781  ​L​​L​​S​​K​​C​​A​​N​​T​​E​​P​791  ​P​​E​​Q​​E​​Q​​C​​E​​A​​E​​R​801  ​F​​S​​A​​C​​L​​A​​A​​Y​​R​​P​811  ​K​​P​​H​​L​​L​​T​​G​​A​​S​​V​821  ​D​​L​​G​​S​​A​​I​​A​​L​​V​​N​831  ​K​​Y​​C​​A​​R​​L​​P​​S​​D​​T​841  ​F​​T​​K​​L​​T​​A​​L​​W​​R​​C​851  ​T​​R​​N​​E​​R​​A​​G​​V​​T​​L​861  ​F​​Q​​Y​​T​​L​​R​​L​​P​​I​​N​871  ​S​​P​​L​​K​​H​​D​​I​​V​​G​​L​881  ​P​​M​​P​​T​​Q​​T​​L​​A​​R​​R​891  ​L​​A​​A​​L​​Q​​A​​C​​V​​E​​L​901  ​H​​R​​I​​G​​E​​L​​D​​D​​Q​​L​911  ​Q​​P​​I​​G​​K​​E​​G​​F​​R​​A​921  ​L​​E​​P​​D​​W​​E​​C​​F​​E​​L​931  ​E​​P​​E​​D​​E​​Q​​I​​V​​Q​​L​941  ​S​​D​​E​​P​​R​​P​​G​​T​​T​​K​951  ​R​​R​​Q​​Y​​Y​​Y​​K​​R​​I​​A​961  ​S​​E​​F​​C​​D​​C​​R​​P​​V​​A​971  ​G​​A​​P​​C​​Y​​L​​Y​​F​​I​​Q​981  ​L​​T​​L​​Q​​C​​P​​I​​P​​E​​E​991  ​Q​​N​​T​​R​​G​​R​​K​​I​​Y​​P​1001 ​P​​E​​D​​A​​Q​​Q​​G​​F​​G​​I​1011 ​L​​T​​T​​K​​R​​I​​P​​K​​L​​S​1021 ​A​​F​​S​​I​​F​​T​​R​​S​​G​​E​1031 ​V​​K​​V​​S​​L​​E​​L​​A​​K​​E​1041 ​R​​V​​I​​L​​T​​S​​E​​Q​​I​​V​1051 ​C​​I​​N​​G​​F​​L​​N​​Y​​T​​F​1061 ​T​​N​​V​​L​​R​​L​​Q​​K​​F​​L​1071 ​M​​L​​F​​D​​P​​D​​S​​T​​E​​N​1081 ​C​​V​​F​​I​​V​​P​​T​​V​​K​​A​1091 ​P​​A​​G​​G​​K​​H​​I​​D​​W​​Q​1101 ​F​​L​​E​​L​​I​​Q​​A​​N​​G​​N​1111 ​T​​M​​P​​R​​A​​V​​P​​D​​E​​E​1121 ​R​​Q​​A​​Q​​P​​F​​D​​P​​Q​​R​1131 ​F​​Q​​D​​A​​V​​V​​M​​P​​W​​Y​1141 ​R​​N​​Q​​D​​Q​​P​​Q​​Y​​F​​Y​1151 ​V​​A​​E​​I​​C​​P​​H​​L​​S​​P​1161 ​L​​S​​C​​F​​P​​G​​D​​N​​Y​​R​1171 ​T​​F​​K​​H​​Y​​Y​​L​​V​​K​​Y​1181 ​G​​L​​T​​I​​Q​​N​​T​​S​​Q​​P​1191 ​L​​L​​D​​V​​D​​H​​T​​S​​A​​R​1201 ​L​​N​​F​​L​​T​​P​​R​​Y​​V​​N​1211 ​R​​K​​G​​V​​A​​L​​P​​T​​S​​S​1221 ​E​​E​​T​​K​​R​​A​​K​​R​​E​​N​1231 ​L​​E​​Q​​K​​Q​​I​​L​​V​​P​​E​1241 ​L​​C​​T​​V​​H​​P​​F​​P​​A​​S​1251 ​L​​W​​R​​T​​A​​V​​C​​L​​P​​C​1261 ​I​​L​​Y​​R​​I​​N​​G​​L​​L​​L​1271 ​A​​D​​D​​I​​R​​K​​Q​​V​​S​​A​1281 ​D​​L​​G​​L​​G​​R​​Q​​Q​​I​​F​1295 ​E​​W​​P​​M​​L​​D​​F​​G​​W​​R​1526 ​Q​​K​​Q​​L​​S​​I​​I​​Q​​A​​T​1536 ​N​​A​​N​​E​​R​​Q​​Y​​Q​​Q​​T​1546 ​K​​N​​L​​L​​I​​G​​F​​N​​F​​K​1556 ​H​​E​​R​​Y​​E​​E​​S​​I​​A​​K​1574 ​L​​K​​T​​E​​I​​E​​S​​G​​G​​M​1584 ​L​​V​​P​​H​​D​​Q​​Q​​L​​V​​V​1607 ​S​​M​​M​​E​​L​​L​​K​​Q​​L​​L​1617 ​P​​Y​​V​​L​​A​​K​​K​​L​​G​​D​1631 ​R​​R​​E​​L​​L​​L​​S​​D​​L​​V​1641 ​E​​L​​N​​A​​D​​W​​V​​A​​R​​H​1651 ​E​​Q​​E​​T​​Y​​N​​V​​M​​G​​D​1663 ​S​​F​​D​​N​​Y​​N​​D​​H​​H​​A​1706 ​G​​F​​S​​F​​D​​R​​Q​​P​​D​​L​1716 ​V​​G​​H​​P​​G​​P​​S​​P​​S​​I​1726 ​I​​L​​Q​​A​​L​​T​​M​​S​​N​​A​1736 ​N​​D​​G​​I​​N​​L​​E​​R​​L​​E​1746 ​T​​I​​G​​D​​S​​F​​L​​K​​Y​​A​1756 ​I​​T​​T​​Y​​L​​Y​​I​​T​​Y​​E​1766 ​N​​V​​H​​E​​G​​K​​L​​S​​H​​L​1776 ​R​​S​​K​​Q​​V​​A​​N​​L​​N​​L​1786 ​Y​​R​​L​​G​​R​​R​​K​​R​​L​​G​1796 ​E​​Y​​M​​I​​A​​T​​K​​F​​E​​P​1806 ​H​​D​​N​​W​​L​​P​​P​​C​​Y​​Y​1816 ​V​​P​​K​​E​​L​​E​​K​​A​​L​​K​1836 ​L​​A​​D​​L​​L​​D​​I​​K​​N​​L​1846 ​S​​S​​V​​Q​​I​​C​​E​​M​​V​​D​1884 ​F​​S​​C​​F​​I​​P​​Y​​N​​L​​V​1894 ​S​​Q​​H​​S​​I​​P​​D​​K​​S​​I​1904 ​A​​D​​C​​V​​E​​A​​L​​I​​G​​A​1914 ​Y​​L​​I​​E​​C​​G​​P​​R​​G​​A​1924 ​L​​L​​F​​M​​A​​W​​L​​G​​V​​R​1934 ​V​​L​​P​​I​​T​​R​​Q​​L​​D​​G​1944 ​G​​N​​Q​​E​​Q​​R​​I​​P​​G​​S​1954 ​T​​K​​P​​N​​A​​E​​N​​V​​V​​T​1964 ​V​​Y​​G​​A​​W​​P​​T​​P​​R​​S​1974 ​P​​L​​L​​H​​F​​A​​P​​N​​A​​T​1984 ​E​​E​​L​​D​​Q​​L​​L​​S​​G​​F​1994 ​E​​E​​F​​E​​E​​S​​L​​G​​Y​​K​2004 ​F​​R​​D​​R​​S​​Y​​L​​L​​Q​​A​2014 ​M​​T​​H​​A​​S​​Y​​T​​P​​N​​R​2024 ​L​​T​​D​​C​​Y​​Q​​R​​L​​E​​F​2034 ​L​​G​​D​​A​​V​​L​​D​​Y​​L​​I​2044 ​T​​R​​H​​L​​Y​​E​​D​​P​​R​​Q​2054 ​H​​S​​P​​G​​A​​L​​T​​D​​L​​R​2064 ​S​​A​​L​​V​​N​​N​​T​​I​​F​​A​2074 ​S​​L​​A​​V​​R​​H​​G​​F​​H​​K​2084 ​F​​F​​R​​H​​L​​S​​P​​G​​L​​N​2094 ​D​​V​​I​​D​​R​​F​​V​​R​​I​​Q​2104 ​Q​​E​​N​​G​​H​​C​​I​​D​​D​​A​2126 ​E​​D​​V​​E​​V​​P​​K​​A​​L​​G​2136 ​D​​V​​F​​E​​S​​I​​A​​G​​A​​I​2146 ​F​​L​​D​​S​​N​​M​​S​​L​​D​​V​2156 ​V​​W​​H​​V​​Y​​S​​N​​M​​M​​S​2166 ​P​​E​​I​​E​​Q​​F​​S​​N​​S​​V​2176 ​P​​K​​S​​P​​I​​R​​E​​L​​L​​E​2186 ​L​​E​​P​​E​​T​​A​​K​​F​​G​​K​2196 ​P​​E​​K​​L​​A​​D​​G​​R​​R​​V​2206 ​R​​V​​T​​V​​D​​V​​F​​C​​K​​G​2216 ​T​​F​​R​​G​​I​​G​​R​​N​​Y​​R​2226 ​I​​A​​K​​C​​T​​A​​A​​K​​C​​A​2236 ​L​​R​​Q​​L​​K​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.72 .. 0.95
-0.72
0.95
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
11
HIS
0.28
2
12
THR
0.39
3
13
THR
0.27
4
14
VAL
0.21
5
15
PHE
0.32
6
16
THR
0.38
7
17
PRO
0.44
8
18
ARG
0.45
9
19
ASP
0.43
10
20
PHE
0.45
11
21
GLN
0.46
12
22
VAL
0.44
13
23
GLU
0.48
14
24
LEU
0.52
15
25
LEU
0.50
16
26
ALA
0.58
17
27
THR
0.56
18
28
ALA
0.58
19
29
TYR
0.67
20
30
GLU
0.70
21
31
ARG
0.67
22
32
ASN
0.70
23
33
THR
0.82
24
34
ILE
0.72
25
35
ILE
0.73
26
36
CYS
0.63
27
37
LEU
0.59
28
38
GLY
0.61
29
39
HIS
0.58
30
40
ARG
0.62
31
41
SER
0.68
32
42
SER
0.69
3D View
Download PDB file DAQ[SS]
Download Secondary Structure Prediction file
Render Map
Converting to mmCIF
SequenceNo structure available
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -1.95 .. 1.19
-1.95
1.19
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
11
HIS
0.19
2
12
THR
0.26
3
13
THR
0.33
4
14
VAL
0.40
5
15
PHE
0.47
6
16
THR
0.53
7
17
PRO
0.57
8
18
ARG
0.62
9
19
ASP
0.66
10
20
PHE
0.68
11
21
GLN
0.69
12
22
VAL
0.70
13
23
GLU
0.70
14
24
LEU
0.74
15
25
LEU
0.79
16
26
ALA
0.82
17
27
THR
0.84
18
28
ALA
0.84
19
29
TYR
0.84
20
30
GLU
0.86
21
31
ARG
0.81
22
32
ASN
0.75
23
33
THR
0.71
24
34
ILE
0.70
25
35
ILE
0.69
26
36
CYS
0.69
27
37
LEU
0.69
28
38
GLY
0.68
29
39
HIS
0.67
30
40
ARG
0.71
31
41
SER
0.78
32
42
SER
0.84
3D View
Download PDB file DAQ[Total]
Render Map
SequenceNo structure available
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -2.37 .. 2.60
-2.37
2.60
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
11
HIS
0.41
2
12
THR
0.65
3
13
THR
0.58
4
14
VAL
0.62
5
15
PHE
0.69
6
16
THR
0.96
7
17
PRO
1.12
8
18
ARG
1.13
9
19
ASP
1.20
10
20
PHE
1.28
11
21
GLN
1.29
12
22
VAL
1.27
13
23
GLU
1.34
14
24
LEU
1.52
15
25
LEU
1.55
16
26
ALA
1.78
17
27
THR
1.67
18
28
ALA
1.80
19
29
TYR
1.97
20
30
GLU
2.06
21
31
ARG
2.01
22
32
ASN
2.03
23
33
THR
2.01
24
34
ILE
1.95
25
35
ILE
1.87
26
36
CYS
1.65
27
37
LEU
1.65
28
38
GLY
1.73
29
39
HIS
1.66
30
40
ARG
1.72
31
41
SER
1.85
32
42
SER
1.95