2938 4UG0 Lz v1-3
2938_4ug0_Lz_v1-3
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RCSB PDB: 4UG0
EMDB: 2938
Structure title STRUCTURE OF THE HUMAN 80S RIBOSOME
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 3.6 Å
Source organism Homo sapiens
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Download PDB file DAQ[AA]
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Sequence of
1    ​M​​S​​S​​K​​V​​S​​R​​D​​T​​L​11   ​Y​​E​​A​​V​​R​​E​​V​​L​​H​​G​21   ​N​​Q​​R​​K​​R​​R​​K​​F​​L​​E​31   ​T​​V​​E​​L​​Q​​I​​S​​L​​K​​N​41   ​Y​​D​​P​​Q​​K​​D​​K​​R​​F​​S​51   ​G​​T​​V​​R​​L​​K​​S​​T​​P​​R​61   ​P​​K​​F​​S​​V​​C​​V​​L​​G​​D​71   ​Q​​Q​​H​​C​​D​​E​​A​​K​​A​​V​81   ​D​​I​​P​​H​​M​​D​​I​​E​​A​​L​91   ​K​​K​​L​​N​​K​​N​​K​​K​​L​​V​101  ​K​​K​​L​​A​​K​​K​​Y​​D​​A​​F​111  ​L​​A​​S​​E​​S​​L​​I​​K​​Q​​I​121  ​P​​R​​I​​L​​G​​P​​G​​L​​N​​K​131  ​A​​G​​K​​F​​P​​S​​L​​L​​T​​H​141  ​N​​E​​N​​M​​V​​A​​K​​V​​D​​E​151  ​V​​K​​S​​T​​I​​K​​F​​Q​​M​​K​161  ​K​​V​​L​​C​​L​​A​​V​​A​​V​​G​171  ​H​​V​​K​​M​​T​​D​​D​​E​​L​​V​181  ​Y​​N​​I​​H​​L​​A​​V​​N​​F​​L​191  ​V​​S​​L​​L​​K​​K​​N​​W​​Q​​N​201  ​V​​R​​A​​L​​Y​​I​​K​​S​​T​​M​211  ​G​​K​​P​​Q​​R​​L​​Y​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.49 .. 0.17
-0.49
0.17
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
1
MET
-0.48
2
2
SER
-0.49
3
3
SER
-0.44
4
4
LYS
-0.40
5
5
VAL
-0.37
6
6
SER
-0.42
7
7
ARG
-0.43
8
8
ASP
-0.37
9
9
THR
-0.36
10
10
LEU
-0.33
11
11
TYR
-0.29
12
12
GLU
-0.26
13
13
ALA
-0.22
14
14
VAL
-0.30
15
15
ARG
-0.23
16
16
GLU
-0.20
17
17
VAL
-0.21
18
18
LEU
-0.25
19
19
HIS
-0.22
20
20
GLY
-0.18
21
21
ASN
-0.20
22
22
GLN
-0.20
23
23
ARG
-0.19
24
24
LYS
-0.23
25
25
ARG
-0.18
26
26
ARG
-0.14
27
27
LYS
-0.19
28
28
PHE
-0.17
29
29
LEU
-0.19
30
30
GLU
-0.25
31
31
THR
-0.26
32
32
VAL
-0.28
3D View
Download PDB file DAQ[Cα]
Render Map
Sequence of
1    ​M​​S​​S​​K​​V​​S​​R​​D​​T​​L​11   ​Y​​E​​A​​V​​R​​E​​V​​L​​H​​G​21   ​N​​Q​​R​​K​​R​​R​​K​​F​​L​​E​31   ​T​​V​​E​​L​​Q​​I​​S​​L​​K​​N​41   ​Y​​D​​P​​Q​​K​​D​​K​​R​​F​​S​51   ​G​​T​​V​​R​​L​​K​​S​​T​​P​​R​61   ​P​​K​​F​​S​​V​​C​​V​​L​​G​​D​71   ​Q​​Q​​H​​C​​D​​E​​A​​K​​A​​V​81   ​D​​I​​P​​H​​M​​D​​I​​E​​A​​L​91   ​K​​K​​L​​N​​K​​N​​K​​K​​L​​V​101  ​K​​K​​L​​A​​K​​K​​Y​​D​​A​​F​111  ​L​​A​​S​​E​​S​​L​​I​​K​​Q​​I​121  ​P​​R​​I​​L​​G​​P​​G​​L​​N​​K​131  ​A​​G​​K​​F​​P​​S​​L​​L​​T​​H​141  ​N​​E​​N​​M​​V​​A​​K​​V​​D​​E​151  ​V​​K​​S​​T​​I​​K​​F​​Q​​M​​K​161  ​K​​V​​L​​C​​L​​A​​V​​A​​V​​G​171  ​H​​V​​K​​M​​T​​D​​D​​E​​L​​V​181  ​Y​​N​​I​​H​​L​​A​​V​​N​​F​​L​191  ​V​​S​​L​​L​​K​​K​​N​​W​​Q​​N​201  ​V​​R​​A​​L​​Y​​I​​K​​S​​T​​M​211  ​G​​K​​P​​Q​​R​​L​​Y​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -1.07 .. 0.23
-1.07
0.23
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
1
MET
-1.07
2
2
SER
-0.98
3
3
SER
-0.89
4
4
LYS
-0.83
5
5
VAL
-0.77
6
6
SER
-0.71
7
7
ARG
-0.62
8
8
ASP
-0.60
9
9
THR
-0.54
10
10
LEU
-0.50
11
11
TYR
-0.47
12
12
GLU
-0.46
13
13
ALA
-0.39
14
14
VAL
-0.36
15
15
ARG
-0.30
16
16
GLU
-0.27
17
17
VAL
-0.21
18
18
LEU
-0.12
19
19
HIS
-0.01
20
20
GLY
0.10
21
21
ASN
0.08
22
22
GLN
0.07
23
23
ARG
0.09
24
24
LYS
0.07
25
25
ARG
0.06
26
26
ARG
0.01
27
27
LYS
0.01
28
28
PHE
-0.02
29
29
LEU
-0.09
30
30
GLU
-0.10
31
31
THR
-0.15
32
32
VAL
-0.09
3D View
Download PDB file DAQ[SS]
Download Secondary Structure Prediction file
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Converting to mmCIF
SequenceNo structure available
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.33 .. 0.15
-0.33
0.15
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
1
MET
0.06
2
2
SER
0.04
3
3
SER
0.00
4
4
LYS
0.00
5
5
VAL
-0.01
6
6
SER
-0.04
7
7
ARG
-0.04
8
8
ASP
-0.01
9
9
THR
-0.05
10
10
LEU
-0.07
11
11
TYR
-0.07
12
12
GLU
-0.08
13
13
ALA
-0.06
14
14
VAL
-0.06
15
15
ARG
-0.06
16
16
GLU
-0.06
17
17
VAL
-0.05
18
18
LEU
-0.07
19
19
HIS
-0.07
20
20
GLY
-0.09
21
21
ASN
-0.08
22
22
GLN
-0.04
23
23
ARG
0.00
24
24
LYS
0.04
25
25
ARG
0.05
26
26
ARG
0.04
27
27
LYS
0.04
28
28
PHE
-0.01
29
29
LEU
0.00
30
30
GLU
0.00
31
31
THR
-0.01
32
32
VAL
-0.01
3D View
Download PDB file DAQ[Total]
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Sequence of
1    ​M​​S​​S​​K​​V​​S​​R​​D​​T​​L​11   ​Y​​E​​A​​V​​R​​E​​V​​L​​H​​G​21   ​N​​Q​​R​​K​​R​​R​​K​​F​​L​​E​31   ​T​​V​​E​​L​​Q​​I​​S​​L​​K​​N​41   ​Y​​D​​P​​Q​​K​​D​​K​​R​​F​​S​51   ​G​​T​​V​​R​​L​​K​​S​​T​​P​​R​61   ​P​​K​​F​​S​​V​​C​​V​​L​​G​​D​71   ​Q​​Q​​H​​C​​D​​E​​A​​K​​A​​V​81   ​D​​I​​P​​H​​M​​D​​I​​E​​A​​L​91   ​K​​K​​L​​N​​K​​N​​K​​K​​L​​V​101  ​K​​K​​L​​A​​K​​K​​Y​​D​​A​​F​111  ​L​​A​​S​​E​​S​​L​​I​​K​​Q​​I​121  ​P​​R​​I​​L​​G​​P​​G​​L​​N​​K​131  ​A​​G​​K​​F​​P​​S​​L​​L​​T​​H​141  ​N​​E​​N​​M​​V​​A​​K​​V​​D​​E​151  ​V​​K​​S​​T​​I​​K​​F​​Q​​M​​K​161  ​K​​V​​L​​C​​L​​A​​V​​A​​V​​G​171  ​H​​V​​K​​M​​T​​D​​D​​E​​L​​V​181  ​Y​​N​​I​​H​​L​​A​​V​​N​​F​​L​191  ​V​​S​​L​​L​​K​​K​​N​​W​​Q​​N​201  ​V​​R​​A​​L​​Y​​I​​K​​S​​T​​M​211  ​G​​K​​P​​Q​​R​​L​​Y​
colorbar

DAQ Score Table