29645 8G05 B v1-0
29645_8g05_B_v1-0
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RCSB PDB: 8G05
EMDB: 29645
Structure title Cryo-EM structure of an orphan GPCR-Gi protein signaling complex
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 3.0 Å
Source organism Homo sapiens
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Download PDB file DAQ[AA]
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Sequence of
2    ​S​​E​​L​​D​​Q​​L​​R​​Q​​E​​A​12   ​E​​Q​​L​​K​​N​​Q​​I​​R​​D​​A​22   ​R​​K​​A​​C​​A​​D​​A​​T​​L​​S​32   ​Q​​I​​T​​N​​N​​I​​D​​P​​V​​G​42   ​R​​I​​Q​​M​​R​​T​​R​​R​​T​​L​52   ​R​​G​​H​​L​​A​​K​​I​​Y​​A​​M​62   ​H​​W​​G​​T​​D​​S​​R​​L​​L​​V​72   ​S​​A​​S​​Q​​D​​G​​K​​L​​I​​I​82   ​W​​D​​S​​Y​​T​​T​​N​​K​​V​​H​92   ​A​​I​​P​​L​​R​​S​​S​​W​​V​​M​102  ​T​​C​​A​​Y​​A​​P​​S​​G​​N​​Y​112  ​V​​A​​C​​G​​G​​L​​D​​N​​I​​C​122  ​S​​I​​Y​​N​​L​​K​​T​​R​​E​​G​132  ​N​​V​​R​​V​​S​​R​​E​​L​​A​​G​142  ​H​​T​​G​​Y​​L​​S​​C​​C​​R​​F​152  ​L​​D​​D​​N​​Q​​I​​V​​T​​S​​S​162  ​G​​D​​T​​T​​C​​A​​L​​W​​D​​I​172  ​E​​T​​G​​Q​​Q​​T​​T​​T​​F​​T​182  ​G​​H​​T​​G​​D​​V​​M​​S​​L​​S​192  ​L​​A​​P​​D​​T​​R​​L​​F​​V​​S​202  ​G​​A​​C​​D​​A​​S​​A​​K​​L​​W​212  ​D​​V​​R​​E​​G​​M​​C​​R​​Q​​T​222  ​F​​T​​G​​H​​E​​S​​D​​I​​N​​A​232  ​I​​C​​F​​F​​P​​N​​G​​N​​A​​F​242  ​A​​T​​G​​S​​D​​D​​A​​T​​C​​R​252  ​L​​F​​D​​L​​R​​A​​D​​Q​​E​​L​262  ​M​​T​​Y​​S​​H​​D​​N​​I​​I​​C​272  ​G​​I​​T​​S​​V​​S​​F​​S​​K​​S​282  ​G​​R​​L​​L​​L​​A​​G​​Y​​D​​D​292  ​F​​N​​C​​N​​V​​W​​D​​A​​L​​K​302  ​A​​D​​R​​A​​G​​V​​L​​A​​G​​H​312  ​D​​N​​R​​V​​S​​C​​L​​G​​V​​T​322  ​D​​D​​G​​M​​A​​V​​A​​T​​G​​S​332  ​W​​D​​S​​F​​L​​K​​I​​W​​N​​G​342  ​S​​S​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.13 .. 1.10
-0.13
1.10
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
2
SER
0.60
2
3
GLU
0.67
3
4
LEU
0.60
4
5
ASP
0.62
5
6
GLN
0.52
6
7
LEU
0.52
7
8
ARG
0.51
8
9
GLN
0.54
9
10
GLU
0.38
10
11
ALA
0.41
11
12
GLU
0.47
12
13
GLN
0.34
13
14
LEU
0.38
14
15
LYS
0.38
15
16
ASN
0.35
16
17
GLN
0.33
17
18
ILE
0.35
18
19
ARG
0.29
19
20
ASP
0.22
20
21
ALA
0.22
21
22
ARG
0.15
22
23
LYS
0.19
23
24
ALA
0.19
24
25
CYS
0.24
25
26
ALA
0.26
26
27
ASP
0.27
27
28
ALA
0.27
28
29
THR
0.45
29
30
LEU
0.50
30
31
SER
0.45
31
32
GLN
0.56
32
33
ILE
0.44
3D View
Download PDB file DAQ[Cα]
Render Map
Sequence of
2    ​S​​E​​L​​D​​Q​​L​​R​​Q​​E​​A​12   ​E​​Q​​L​​K​​N​​Q​​I​​R​​D​​A​22   ​R​​K​​A​​C​​A​​D​​A​​T​​L​​S​32   ​Q​​I​​T​​N​​N​​I​​D​​P​​V​​G​42   ​R​​I​​Q​​M​​R​​T​​R​​R​​T​​L​52   ​R​​G​​H​​L​​A​​K​​I​​Y​​A​​M​62   ​H​​W​​G​​T​​D​​S​​R​​L​​L​​V​72   ​S​​A​​S​​Q​​D​​G​​K​​L​​I​​I​82   ​W​​D​​S​​Y​​T​​T​​N​​K​​V​​H​92   ​A​​I​​P​​L​​R​​S​​S​​W​​V​​M​102  ​T​​C​​A​​Y​​A​​P​​S​​G​​N​​Y​112  ​V​​A​​C​​G​​G​​L​​D​​N​​I​​C​122  ​S​​I​​Y​​N​​L​​K​​T​​R​​E​​G​132  ​N​​V​​R​​V​​S​​R​​E​​L​​A​​G​142  ​H​​T​​G​​Y​​L​​S​​C​​C​​R​​F​152  ​L​​D​​D​​N​​Q​​I​​V​​T​​S​​S​162  ​G​​D​​T​​T​​C​​A​​L​​W​​D​​I​172  ​E​​T​​G​​Q​​Q​​T​​T​​T​​F​​T​182  ​G​​H​​T​​G​​D​​V​​M​​S​​L​​S​192  ​L​​A​​P​​D​​T​​R​​L​​F​​V​​S​202  ​G​​A​​C​​D​​A​​S​​A​​K​​L​​W​212  ​D​​V​​R​​E​​G​​M​​C​​R​​Q​​T​222  ​F​​T​​G​​H​​E​​S​​D​​I​​N​​A​232  ​I​​C​​F​​F​​P​​N​​G​​N​​A​​F​242  ​A​​T​​G​​S​​D​​D​​A​​T​​C​​R​252  ​L​​F​​D​​L​​R​​A​​D​​Q​​E​​L​262  ​M​​T​​Y​​S​​H​​D​​N​​I​​I​​C​272  ​G​​I​​T​​S​​V​​S​​F​​S​​K​​S​282  ​G​​R​​L​​L​​L​​A​​G​​Y​​D​​D​292  ​F​​N​​C​​N​​V​​W​​D​​A​​L​​K​302  ​A​​D​​R​​A​​G​​V​​L​​A​​G​​H​312  ​D​​N​​R​​V​​S​​C​​L​​G​​V​​T​322  ​D​​D​​G​​M​​A​​V​​A​​T​​G​​S​332  ​W​​D​​S​​F​​L​​K​​I​​W​​N​​G​342  ​S​​S​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.02 .. 0.87
0.02
0.87
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
2
SER
0.52
2
3
GLU
0.50
3
4
LEU
0.53
4
5
ASP
0.52
5
6
GLN
0.54
6
7
LEU
0.57
7
8
ARG
0.57
8
9
GLN
0.51
9
10
GLU
0.50
10
11
ALA
0.50
11
12
GLU
0.54
12
13
GLN
0.59
13
14
LEU
0.60
14
15
LYS
0.62
15
16
ASN
0.60
16
17
GLN
0.62
17
18
ILE
0.65
18
19
ARG
0.61
19
20
ASP
0.54
20
21
ALA
0.53
21
22
ARG
0.58
22
23
LYS
0.54
23
24
ALA
0.56
24
25
CYS
0.56
25
26
ALA
0.55
26
27
ASP
0.55
27
28
ALA
0.62
28
29
THR
0.69
29
30
LEU
0.63
30
31
SER
0.63
31
32
GLN
0.60
32
33
ILE
0.64
3D View
Download PDB file DAQ[SS]
Download Secondary Structure Prediction file
Render Map
Sequence of
2    ​S​​E​​L​​D​​Q​​L​​R​​Q​​E​​A​12   ​E​​Q​​L​​K​​N​​Q​​I​​R​​D​​A​22   ​R​​K​​A​​C​​A​​D​​A​​T​​L​​S​32   ​Q​​I​​T​​N​​N​​I​​D​​P​​V​​G​42   ​R​​I​​Q​​M​​R​​T​​R​​R​​T​​L​52   ​R​​G​​H​​L​​A​​K​​I​​Y​​A​​M​62   ​H​​W​​G​​T​​D​​S​​R​​L​​L​​V​72   ​S​​A​​S​​Q​​D​​G​​K​​L​​I​​I​82   ​W​​D​​S​​Y​​T​​T​​N​​K​​V​​H​92   ​A​​I​​P​​L​​R​​S​​S​​W​​V​​M​102  ​T​​C​​A​​Y​​A​​P​​S​​G​​N​​Y​112  ​V​​A​​C​​G​​G​​L​​D​​N​​I​​C​122  ​S​​I​​Y​​N​​L​​K​​T​​R​​E​​G​132  ​N​​V​​R​​V​​S​​R​​E​​L​​A​​G​142  ​H​​T​​G​​Y​​L​​S​​C​​C​​R​​F​152  ​L​​D​​D​​N​​Q​​I​​V​​T​​S​​S​162  ​G​​D​​T​​T​​C​​A​​L​​W​​D​​I​172  ​E​​T​​G​​Q​​Q​​T​​T​​T​​F​​T​182  ​G​​H​​T​​G​​D​​V​​M​​S​​L​​S​192  ​L​​A​​P​​D​​T​​R​​L​​F​​V​​S​202  ​G​​A​​C​​D​​A​​S​​A​​K​​L​​W​212  ​D​​V​​R​​E​​G​​M​​C​​R​​Q​​T​222  ​F​​T​​G​​H​​E​​S​​D​​I​​N​​A​232  ​I​​C​​F​​F​​P​​N​​G​​N​​A​​F​242  ​A​​T​​G​​S​​D​​D​​A​​T​​C​​R​252  ​L​​F​​D​​L​​R​​A​​D​​Q​​E​​L​262  ​M​​T​​Y​​S​​H​​D​​N​​I​​I​​C​272  ​G​​I​​T​​S​​V​​S​​F​​S​​K​​S​282  ​G​​R​​L​​L​​L​​A​​G​​Y​​D​​D​292  ​F​​N​​C​​N​​V​​W​​D​​A​​L​​K​302  ​A​​D​​R​​A​​G​​V​​L​​A​​G​​H​312  ​D​​N​​R​​V​​S​​C​​L​​G​​V​​T​322  ​D​​D​​G​​M​​A​​V​​A​​T​​G​​S​332  ​W​​D​​S​​F​​L​​K​​I​​W​​N​​G​342  ​S​​S​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.37 .. 1.57
-0.37
1.57
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
2
SER
1.05
2
3
GLU
1.11
3
4
LEU
1.12
4
5
ASP
1.17
5
6
GLN
1.21
6
7
LEU
1.24
7
8
ARG
1.27
8
9
GLN
1.30
9
10
GLU
1.32
10
11
ALA
1.35
11
12
GLU
1.42
12
13
GLN
1.50
13
14
LEU
1.56
14
15
LYS
1.57
15
16
ASN
1.51
16
17
GLN
1.43
17
18
ILE
1.34
18
19
ARG
1.25
19
20
ASP
1.16
20
21
ALA
1.10
21
22
ARG
1.03
22
23
LYS
1.00
23
24
ALA
0.93
24
25
CYS
0.86
25
26
ALA
0.77
26
27
ASP
0.69
27
28
ALA
0.60
28
29
THR
0.52
29
30
LEU
0.42
30
31
SER
0.30
31
32
GLN
0.18
32
33
ILE
0.08
3D View
Download PDB file DAQ[Total]
Render Map
Sequence of
2    ​S​​E​​L​​D​​Q​​L​​R​​Q​​E​​A​12   ​E​​Q​​L​​K​​N​​Q​​I​​R​​D​​A​22   ​R​​K​​A​​C​​A​​D​​A​​T​​L​​S​32   ​Q​​I​​T​​N​​N​​I​​D​​P​​V​​G​42   ​R​​I​​Q​​M​​R​​T​​R​​R​​T​​L​52   ​R​​G​​H​​L​​A​​K​​I​​Y​​A​​M​62   ​H​​W​​G​​T​​D​​S​​R​​L​​L​​V​72   ​S​​A​​S​​Q​​D​​G​​K​​L​​I​​I​82   ​W​​D​​S​​Y​​T​​T​​N​​K​​V​​H​92   ​A​​I​​P​​L​​R​​S​​S​​W​​V​​M​102  ​T​​C​​A​​Y​​A​​P​​S​​G​​N​​Y​112  ​V​​A​​C​​G​​G​​L​​D​​N​​I​​C​122  ​S​​I​​Y​​N​​L​​K​​T​​R​​E​​G​132  ​N​​V​​R​​V​​S​​R​​E​​L​​A​​G​142  ​H​​T​​G​​Y​​L​​S​​C​​C​​R​​F​152  ​L​​D​​D​​N​​Q​​I​​V​​T​​S​​S​162  ​G​​D​​T​​T​​C​​A​​L​​W​​D​​I​172  ​E​​T​​G​​Q​​Q​​T​​T​​T​​F​​T​182  ​G​​H​​T​​G​​D​​V​​M​​S​​L​​S​192  ​L​​A​​P​​D​​T​​R​​L​​F​​V​​S​202  ​G​​A​​C​​D​​A​​S​​A​​K​​L​​W​212  ​D​​V​​R​​E​​G​​M​​C​​R​​Q​​T​222  ​F​​T​​G​​H​​E​​S​​D​​I​​N​​A​232  ​I​​C​​F​​F​​P​​N​​G​​N​​A​​F​242  ​A​​T​​G​​S​​D​​D​​A​​T​​C​​R​252  ​L​​F​​D​​L​​R​​A​​D​​Q​​E​​L​262  ​M​​T​​Y​​S​​H​​D​​N​​I​​I​​C​272  ​G​​I​​T​​S​​V​​S​​F​​S​​K​​S​282  ​G​​R​​L​​L​​L​​A​​G​​Y​​D​​D​292  ​F​​N​​C​​N​​V​​W​​D​​A​​L​​K​302  ​A​​D​​R​​A​​G​​V​​L​​A​​G​​H​312  ​D​​N​​R​​V​​S​​C​​L​​G​​V​​T​322  ​D​​D​​G​​M​​A​​V​​A​​T​​G​​S​332  ​W​​D​​S​​F​​L​​K​​I​​W​​N​​G​342  ​S​​S​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.09 .. 2.57
-0.09
2.57
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
2
SER
2.17
2
3
GLU
2.28
3
4
LEU
2.26
4
5
ASP
2.30
5
6
GLN
2.27
6
7
LEU
2.33
7
8
ARG
2.35
8
9
GLN
2.35
9
10
GLU
2.20
10
11
ALA
2.25
11
12
GLU
2.43
12
13
GLN
2.43
13
14
LEU
2.53
14
15
LYS
2.57
15
16
ASN
2.46
16
17
GLN
2.37
17
18
ILE
2.35
18
19
ARG
2.15
19
20
ASP
1.92
20
21
ALA
1.85
21
22
ARG
1.75
22
23
LYS
1.73
23
24
ALA
1.69
24
25
CYS
1.66
25
26
ALA
1.58
26
27
ASP
1.50
27
28
ALA
1.49
28
29
THR
1.66
29
30
LEU
1.55
30
31
SER
1.39
31
32
GLN
1.35
32
33
ILE
1.16