30599 7D72 C v1-1
30599_7d72_C_v1-1
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RCSB PDB: 7D72
EMDB: 30599
Structure title Cryo-EM structures of human GMPPA/GMPPB complex bound to GDP-Mannose
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 3.4 Å
Source organism Homo sapiens
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Download PDB file DAQ[AA]
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Sequence of
1    ​M​​L​​K​​A​​V​​I​​L​​I​​G​​G​11   ​P​​Q​​K​​G​​T​​R​​F​​R​​P​​L​21   ​S​​F​​E​​V​​P​​K​​P​​L​​F​​P​31   ​V​​A​​G​​V​​P​​M​​I​​Q​​H​​H​41   ​I​​E​​A​​C​​A​​Q​​V​​P​​G​​M​51   ​Q​​E​​I​​L​​L​​I​​G​​F​​Y​​Q​61   ​P​​D​​E​​P​​L​​T​​Q​​F​​L​​E​71   ​A​​A​​Q​​Q​​E​​F​​N​​L​​P​​V​81   ​R​​Y​​L​​Q​​E​​F​​A​​P​​L​​G​91   ​T​​G​​G​​G​​L​​Y​​H​​F​​R​​D​101  ​Q​​I​​L​​A​​G​​S​​P​​E​​A​​F​111  ​F​​V​​L​​N​​A​​D​​V​​C​​S​​D​121  ​F​​P​​L​​S​​A​​M​​L​​E​​A​​H​131  ​R​​R​​Q​​R​​H​​P​​F​​L​​L​​L​141  ​G​​T​​T​​A​​N​​R​​T​​Q​​S​​L​151  ​N​​Y​​G​​C​​I​​V​​E​​N​​P​​Q​161  ​T​​H​​E​​V​​L​​H​​Y​​V​​E​​K​171  ​P​​S​​T​​F​​I​​S​​D​​I​​I​​N​181  ​C​​G​​I​​Y​​L​​F​​S​​P​​E​​A​191  ​L​​K​​P​​L​​R​​D​​V​​F​​Q​​R​201  ​N​​Q​​Q​​G​​T​​I​​R​​L​​E​​Q​225  ​D​​V​​F​​S​​A​​L​​A​​G​​Q​​G​235  ​Q​​I​​Y​​V​​H​​L​​T​​D​​G​​I​245  ​W​​S​​Q​​I​​K​​S​​A​​G​​S​​A​255  ​L​​Y​​A​​S​​R​​L​​Y​​L​​S​​R​265  ​Y​​Q​​D​​T​​H​​P​​E​​R​​L​​A​275  ​K​​H​​T​​P​​G​​G​​P​​W​​I​​R​285  ​G​​N​​V​​Y​​I​​H​​P​​T​​A​​K​295  ​V​​A​​P​​S​​A​​V​​L​​G​​P​​N​305  ​V​​S​​I​​G​​K​​G​​V​​T​​V​​G​315  ​E​​G​​V​​R​​L​​R​​E​​S​​I​​V​325  ​L​​H​​G​​A​​T​​L​​Q​​E​​H​​T​335  ​C​​V​​L​​H​​S​​I​​V​​G​​W​​G​345  ​S​​T​​V​​G​​R​​W​​A​​R​​V​​E​355  ​G​​T​​P​​S​​D​​P​​N​​P​​N​​D​365  ​P​​R​​A​​R​​M​​D​​S​​E​​S​​L​375  ​F​​K​​D​​G​​K​​L​​L​​P​​A​​I​385  ​T​​I​​L​​G​​C​​R​​V​​R​​I​​P​395  ​A​​E​​V​​L​​I​​L​​N​​S​​I​​V​405  ​L​​P​​H​​K​​E​​L​​S​​R​​S​​F​415  ​T​​N​​Q​​I​​I​​L​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.21 .. 1.69
0.21
1.69
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
1
MET
0.77
2
2
LEU
0.96
3
3
LYS
0.93
4
4
ALA
0.91
5
5
VAL
0.85
6
6
ILE
0.81
7
7
LEU
0.78
8
8
ILE
0.76
9
9
GLY
0.67
10
10
GLY
0.73
11
11
PRO
0.65
12
12
GLN
0.63
13
13
LYS
0.69
14
14
GLY
0.66
15
15
THR
0.60
16
16
ARG
0.60
17
17
PHE
0.56
18
18
ARG
0.56
19
19
PRO
0.56
20
20
LEU
0.70
21
21
SER
0.48
22
22
PHE
0.49
23
23
GLU
0.53
24
24
VAL
0.66
25
25
PRO
0.66
26
26
LYS
0.59
27
27
PRO
0.62
28
28
LEU
0.73
29
29
PHE
0.70
30
30
PRO
0.90
31
31
VAL
0.92
32
32
ALA
1.01
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Download PDB file DAQ[Cα]
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Sequence of
1    ​M​​L​​K​​A​​V​​I​​L​​I​​G​​G​11   ​P​​Q​​K​​G​​T​​R​​F​​R​​P​​L​21   ​S​​F​​E​​V​​P​​K​​P​​L​​F​​P​31   ​V​​A​​G​​V​​P​​M​​I​​Q​​H​​H​41   ​I​​E​​A​​C​​A​​Q​​V​​P​​G​​M​51   ​Q​​E​​I​​L​​L​​I​​G​​F​​Y​​Q​61   ​P​​D​​E​​P​​L​​T​​Q​​F​​L​​E​71   ​A​​A​​Q​​Q​​E​​F​​N​​L​​P​​V​81   ​R​​Y​​L​​Q​​E​​F​​A​​P​​L​​G​91   ​T​​G​​G​​G​​L​​Y​​H​​F​​R​​D​101  ​Q​​I​​L​​A​​G​​S​​P​​E​​A​​F​111  ​F​​V​​L​​N​​A​​D​​V​​C​​S​​D​121  ​F​​P​​L​​S​​A​​M​​L​​E​​A​​H​131  ​R​​R​​Q​​R​​H​​P​​F​​L​​L​​L​141  ​G​​T​​T​​A​​N​​R​​T​​Q​​S​​L​151  ​N​​Y​​G​​C​​I​​V​​E​​N​​P​​Q​161  ​T​​H​​E​​V​​L​​H​​Y​​V​​E​​K​171  ​P​​S​​T​​F​​I​​S​​D​​I​​I​​N​181  ​C​​G​​I​​Y​​L​​F​​S​​P​​E​​A​191  ​L​​K​​P​​L​​R​​D​​V​​F​​Q​​R​201  ​N​​Q​​Q​​G​​T​​I​​R​​L​​E​​Q​225  ​D​​V​​F​​S​​A​​L​​A​​G​​Q​​G​235  ​Q​​I​​Y​​V​​H​​L​​T​​D​​G​​I​245  ​W​​S​​Q​​I​​K​​S​​A​​G​​S​​A​255  ​L​​Y​​A​​S​​R​​L​​Y​​L​​S​​R​265  ​Y​​Q​​D​​T​​H​​P​​E​​R​​L​​A​275  ​K​​H​​T​​P​​G​​G​​P​​W​​I​​R​285  ​G​​N​​V​​Y​​I​​H​​P​​T​​A​​K​295  ​V​​A​​P​​S​​A​​V​​L​​G​​P​​N​305  ​V​​S​​I​​G​​K​​G​​V​​T​​V​​G​315  ​E​​G​​V​​R​​L​​R​​E​​S​​I​​V​325  ​L​​H​​G​​A​​T​​L​​Q​​E​​H​​T​335  ​C​​V​​L​​H​​S​​I​​V​​G​​W​​G​345  ​S​​T​​V​​G​​R​​W​​A​​R​​V​​E​355  ​G​​T​​P​​S​​D​​P​​N​​P​​N​​D​365  ​P​​R​​A​​R​​M​​D​​S​​E​​S​​L​375  ​F​​K​​D​​G​​K​​L​​L​​P​​A​​I​385  ​T​​I​​L​​G​​C​​R​​V​​R​​I​​P​395  ​A​​E​​V​​L​​I​​L​​N​​S​​I​​V​405  ​L​​P​​H​​K​​E​​L​​S​​R​​S​​F​415  ​T​​N​​Q​​I​​I​​L​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.06 .. 1.21
-0.06
1.21
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
1
MET
0.64
2
2
LEU
0.62
3
3
LYS
0.56
4
4
ALA
0.51
5
5
VAL
0.42
6
6
ILE
0.31
7
7
LEU
0.30
8
8
ILE
0.32
9
9
GLY
0.37
10
10
GLY
0.37
11
11
PRO
0.31
12
12
GLN
0.27
13
13
LYS
0.19
14
14
GLY
0.24
15
15
THR
0.29
16
16
ARG
0.37
17
17
PHE
0.36
18
18
ARG
0.38
19
19
PRO
0.40
20
20
LEU
0.42
21
21
SER
0.35
22
22
PHE
0.36
23
23
GLU
0.39
24
24
VAL
0.50
25
25
PRO
0.65
26
26
LYS
0.70
27
27
PRO
0.76
28
28
LEU
0.79
29
29
PHE
0.78
30
30
PRO
0.89
31
31
VAL
0.83
32
32
ALA
0.86
3D View
Download PDB file DAQ[SS]
Download Secondary Structure Prediction file
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Converting to mmCIF
SequenceNo structure available
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.34 .. 1.08
-0.34
1.08
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
1
MET
0.59
2
2
LEU
0.51
3
3
LYS
0.47
4
4
ALA
0.40
5
5
VAL
0.40
6
6
ILE
0.37
7
7
LEU
0.35
8
8
ILE
0.33
9
9
GLY
0.33
10
10
GLY
0.32
11
11
PRO
0.32
12
12
GLN
0.27
13
13
LYS
0.24
14
14
GLY
0.22
15
15
THR
0.18
16
16
ARG
0.16
17
17
PHE
0.12
18
18
ARG
0.12
19
19
PRO
0.12
20
20
LEU
0.05
21
21
SER
0.11
22
22
PHE
-0.10
23
23
GLU
-0.06
24
24
VAL
-0.05
25
25
PRO
-0.08
26
26
LYS
-0.03
27
27
PRO
0.02
28
28
LEU
0.07
29
29
PHE
0.14
30
30
PRO
0.21
31
31
VAL
0.31
32
32
ALA
0.38
3D View
Download PDB file DAQ[Total]
Render Map
Sequence of
1    ​M​​L​​K​​A​​V​​I​​L​​I​​G​​G​11   ​P​​Q​​K​​G​​T​​R​​F​​R​​P​​L​21   ​S​​F​​E​​V​​P​​K​​P​​L​​F​​P​31   ​V​​A​​G​​V​​P​​M​​I​​Q​​H​​H​41   ​I​​E​​A​​C​​A​​Q​​V​​P​​G​​M​51   ​Q​​E​​I​​L​​L​​I​​G​​F​​Y​​Q​61   ​P​​D​​E​​P​​L​​T​​Q​​F​​L​​E​71   ​A​​A​​Q​​Q​​E​​F​​N​​L​​P​​V​81   ​R​​Y​​L​​Q​​E​​F​​A​​P​​L​​G​91   ​T​​G​​G​​G​​L​​Y​​H​​F​​R​​D​101  ​Q​​I​​L​​A​​G​​S​​P​​E​​A​​F​111  ​F​​V​​L​​N​​A​​D​​V​​C​​S​​D​121  ​F​​P​​L​​S​​A​​M​​L​​E​​A​​H​131  ​R​​R​​Q​​R​​H​​P​​F​​L​​L​​L​141  ​G​​T​​T​​A​​N​​R​​T​​Q​​S​​L​151  ​N​​Y​​G​​C​​I​​V​​E​​N​​P​​Q​161  ​T​​H​​E​​V​​L​​H​​Y​​V​​E​​K​171  ​P​​S​​T​​F​​I​​S​​D​​I​​I​​N​181  ​C​​G​​I​​Y​​L​​F​​S​​P​​E​​A​191  ​L​​K​​P​​L​​R​​D​​V​​F​​Q​​R​201  ​N​​Q​​Q​​G​​T​​I​​R​​L​​E​​Q​225  ​D​​V​​F​​S​​A​​L​​A​​G​​Q​​G​235  ​Q​​I​​Y​​V​​H​​L​​T​​D​​G​​I​245  ​W​​S​​Q​​I​​K​​S​​A​​G​​S​​A​255  ​L​​Y​​A​​S​​R​​L​​Y​​L​​S​​R​265  ​Y​​Q​​D​​T​​H​​P​​E​​R​​L​​A​275  ​K​​H​​T​​P​​G​​G​​P​​W​​I​​R​285  ​G​​N​​V​​Y​​I​​H​​P​​T​​A​​K​295  ​V​​A​​P​​S​​A​​V​​L​​G​​P​​N​305  ​V​​S​​I​​G​​K​​G​​V​​T​​V​​G​315  ​E​​G​​V​​R​​L​​R​​E​​S​​I​​V​325  ​L​​H​​G​​A​​T​​L​​Q​​E​​H​​T​335  ​C​​V​​L​​H​​S​​I​​V​​G​​W​​G​345  ​S​​T​​V​​G​​R​​W​​A​​R​​V​​E​355  ​G​​T​​P​​S​​D​​P​​N​​P​​N​​D​365  ​P​​R​​A​​R​​M​​D​​S​​E​​S​​L​375  ​F​​K​​D​​G​​K​​L​​L​​P​​A​​I​385  ​T​​I​​L​​G​​C​​R​​V​​R​​I​​P​395  ​A​​E​​V​​L​​I​​L​​N​​S​​I​​V​405  ​L​​P​​H​​K​​E​​L​​S​​R​​S​​F​415  ​T​​N​​Q​​I​​I​​L​
colorbar

DAQ Score Table