33675 7Y7Z A v1-2
33675_7y7z_A_v1-2
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RCSB PDB: 7Y7Z
EMDB: 33675
Structure title Cryo-EM structure of human GABA transporter GAT1 bound with tiagabine in NaCl solution in an inward-open state at 3.2 angstrom
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 3.2 Å
Source organism Homo sapiens
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Download PDB file DAQ[AA]
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Sequence of
49   ​G​​R​​F​​D​​F​​L​​M​​S​​C​​V​59   ​G​​Y​​A​​I​​G​​L​​G​​N​​V​​W​69   ​R​​F​​P​​Y​​L​​C​​G​​K​​N​​G​79   ​G​​G​​A​​F​​L​​I​​P​​Y​​F​​L​89   ​T​​L​​I​​F​​A​​G​​V​​P​​L​​F​99   ​L​​L​​E​​C​​S​​L​​G​​Q​​Y​​T​109  ​S​​I​​G​​G​​L​​G​​V​​W​​K​​L​119  ​A​​P​​M​​F​​K​​G​​V​​G​​L​​A​129  ​A​​A​​V​​L​​S​​F​​W​​L​​N​​I​139  ​Y​​Y​​I​​V​​I​​I​​S​​W​​A​​I​149  ​Y​​Y​​L​​Y​​N​​S​​F​​T​​T​​T​159  ​L​​P​​W​​K​​Q​​C​​D​​N​​P​​W​169  ​N​​T​​D​​R​​C​​F​​S​​N​​Y​​S​179  ​M​​V​​N​​T​​T​​N​​M​​T​​S​​A​189  ​V​​V​​E​​F​​W​​E​​R​​N​​M​​H​199  ​Q​​M​​T​​D​​G​​L​​D​​K​​P​​G​209  ​Q​​I​​R​​W​​P​​L​​A​​I​​T​​L​219  ​A​​I​​A​​W​​I​​L​​V​​Y​​F​​C​229  ​I​​W​​K​​G​​V​​G​​W​​T​​G​​K​239  ​V​​V​​Y​​F​​S​​A​​T​​Y​​P​​Y​249  ​I​​M​​L​​I​​I​​L​​F​​F​​R​​G​259  ​V​​T​​L​​P​​G​​A​​K​​E​​G​​I​269  ​L​​F​​Y​​I​​T​​P​​N​​F​​R​​K​279  ​L​​S​​D​​S​​E​​V​​W​​L​​D​​A​289  ​A​​T​​Q​​I​​F​​F​​S​​Y​​G​​L​299  ​G​​L​​G​​S​​L​​I​​A​​L​​G​​S​309  ​Y​​N​​S​​F​​H​​N​​N​​V​​Y​​R​319  ​D​​S​​I​​I​​V​​C​​C​​I​​N​​S​329  ​C​​T​​S​​M​​F​​A​​G​​F​​V​​I​339  ​F​​S​​I​​V​​G​​F​​M​​A​​H​​V​349  ​T​​K​​R​​S​​I​​A​​D​​V​​A​​A​359  ​S​​G​​P​​G​​L​​A​​F​​L​​A​​Y​369  ​P​​E​​A​​V​​T​​Q​​L​​P​​I​​S​379  ​P​​L​​W​​A​​I​​L​​F​​F​​S​​M​389  ​L​​L​​M​​L​​G​​I​​D​​S​​Q​​F​399  ​C​​T​​V​​E​​G​​F​​I​​T​​A​​L​409  ​V​​D​​E​​Y​​P​​R​​L​​L​​R​​N​419  ​R​​R​​E​​L​​F​​I​​A​​A​​V​​C​429  ​I​​I​​S​​Y​​L​​I​​G​​L​​S​​N​439  ​I​​T​​Q​​G​​G​​I​​Y​​V​​F​​K​449  ​L​​F​​D​​Y​​Y​​S​​A​​S​​G​​M​459  ​S​​L​​L​​F​​L​​V​​F​​F​​E​​C​469  ​V​​S​​I​​S​​W​​F​​Y​​G​​V​​N​479  ​R​​F​​Y​​D​​N​​I​​Q​​E​​M​​V​489  ​G​​S​​R​​P​​C​​I​​W​​W​​K​​L​499  ​C​​W​​S​​F​​F​​T​​P​​I​​I​​V​509  ​A​​G​​V​​F​​I​​F​​S​​A​​V​​Q​519  ​M​​T​​P​​L​​T​​M​​G​​N​​Y​​V​529  ​F​​P​​K​​W​​G​​Q​​G​​V​​G​​W​539  ​L​​M​​A​​L​​S​​S​​M​​V​​L​​I​549  ​P​​G​​Y​​M​​A​​Y​​M​​F​​L​​T​559  ​L​​K​​G​​S​​L​​K​​Q​​R​​I​​Q​569  ​V​​M​​V​​Q​​P​​S​​E​​D​​I​​V​579  ​R​​P​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.01 .. 1.67
-0.01
1.67
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
49
GLY
0.31
2
50
ARG
0.34
3
51
PHE
0.22
4
52
ASP
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5
53
PHE
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6
54
LEU
0.26
7
55
MET
0.25
8
56
SER
0.30
9
57
CYS
0.32
10
58
VAL
0.34
11
59
GLY
0.47
12
60
TYR
0.49
13
61
ALA
0.63
14
62
ILE
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15
63
GLY
0.80
16
64
LEU
0.80
17
65
GLY
0.80
18
66
ASN
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19
67
VAL
0.86
20
68
TRP
0.85
21
69
ARG
0.92
22
70
PHE
1.09
23
71
PRO
1.14
24
72
TYR
1.21
25
73
LEU
1.15
26
74
CYS
1.15
27
75
GLY
1.19
28
76
LYS
1.24
29
77
ASN
1.25
30
78
GLY
1.15
31
79
GLY
1.15
32
80
GLY
1.11
3D View
Download PDB file DAQ[Cα]
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Sequence of
49   ​G​​R​​F​​D​​F​​L​​M​​S​​C​​V​59   ​G​​Y​​A​​I​​G​​L​​G​​N​​V​​W​69   ​R​​F​​P​​Y​​L​​C​​G​​K​​N​​G​79   ​G​​G​​A​​F​​L​​I​​P​​Y​​F​​L​89   ​T​​L​​I​​F​​A​​G​​V​​P​​L​​F​99   ​L​​L​​E​​C​​S​​L​​G​​Q​​Y​​T​109  ​S​​I​​G​​G​​L​​G​​V​​W​​K​​L​119  ​A​​P​​M​​F​​K​​G​​V​​G​​L​​A​129  ​A​​A​​V​​L​​S​​F​​W​​L​​N​​I​139  ​Y​​Y​​I​​V​​I​​I​​S​​W​​A​​I​149  ​Y​​Y​​L​​Y​​N​​S​​F​​T​​T​​T​159  ​L​​P​​W​​K​​Q​​C​​D​​N​​P​​W​169  ​N​​T​​D​​R​​C​​F​​S​​N​​Y​​S​179  ​M​​V​​N​​T​​T​​N​​M​​T​​S​​A​189  ​V​​V​​E​​F​​W​​E​​R​​N​​M​​H​199  ​Q​​M​​T​​D​​G​​L​​D​​K​​P​​G​209  ​Q​​I​​R​​W​​P​​L​​A​​I​​T​​L​219  ​A​​I​​A​​W​​I​​L​​V​​Y​​F​​C​229  ​I​​W​​K​​G​​V​​G​​W​​T​​G​​K​239  ​V​​V​​Y​​F​​S​​A​​T​​Y​​P​​Y​249  ​I​​M​​L​​I​​I​​L​​F​​F​​R​​G​259  ​V​​T​​L​​P​​G​​A​​K​​E​​G​​I​269  ​L​​F​​Y​​I​​T​​P​​N​​F​​R​​K​279  ​L​​S​​D​​S​​E​​V​​W​​L​​D​​A​289  ​A​​T​​Q​​I​​F​​F​​S​​Y​​G​​L​299  ​G​​L​​G​​S​​L​​I​​A​​L​​G​​S​309  ​Y​​N​​S​​F​​H​​N​​N​​V​​Y​​R​319  ​D​​S​​I​​I​​V​​C​​C​​I​​N​​S​329  ​C​​T​​S​​M​​F​​A​​G​​F​​V​​I​339  ​F​​S​​I​​V​​G​​F​​M​​A​​H​​V​349  ​T​​K​​R​​S​​I​​A​​D​​V​​A​​A​359  ​S​​G​​P​​G​​L​​A​​F​​L​​A​​Y​369  ​P​​E​​A​​V​​T​​Q​​L​​P​​I​​S​379  ​P​​L​​W​​A​​I​​L​​F​​F​​S​​M​389  ​L​​L​​M​​L​​G​​I​​D​​S​​Q​​F​399  ​C​​T​​V​​E​​G​​F​​I​​T​​A​​L​409  ​V​​D​​E​​Y​​P​​R​​L​​L​​R​​N​419  ​R​​R​​E​​L​​F​​I​​A​​A​​V​​C​429  ​I​​I​​S​​Y​​L​​I​​G​​L​​S​​N​439  ​I​​T​​Q​​G​​G​​I​​Y​​V​​F​​K​449  ​L​​F​​D​​Y​​Y​​S​​A​​S​​G​​M​459  ​S​​L​​L​​F​​L​​V​​F​​F​​E​​C​469  ​V​​S​​I​​S​​W​​F​​Y​​G​​V​​N​479  ​R​​F​​Y​​D​​N​​I​​Q​​E​​M​​V​489  ​G​​S​​R​​P​​C​​I​​W​​W​​K​​L​499  ​C​​W​​S​​F​​F​​T​​P​​I​​I​​V​509  ​A​​G​​V​​F​​I​​F​​S​​A​​V​​Q​519  ​M​​T​​P​​L​​T​​M​​G​​N​​Y​​V​529  ​F​​P​​K​​W​​G​​Q​​G​​V​​G​​W​539  ​L​​M​​A​​L​​S​​S​​M​​V​​L​​I​549  ​P​​G​​Y​​M​​A​​Y​​M​​F​​L​​T​559  ​L​​K​​G​​S​​L​​K​​Q​​R​​I​​Q​569  ​V​​M​​V​​Q​​P​​S​​E​​D​​I​​V​579  ​R​​P​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.14 .. 1.25
0.14
1.25
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
49
GLY
0.49
2
50
ARG
0.41
3
51
PHE
0.39
4
52
ASP
0.36
5
53
PHE
0.24
6
54
LEU
0.19
7
55
MET
0.19
8
56
SER
0.23
9
57
CYS
0.31
10
58
VAL
0.30
11
59
GLY
0.41
12
60
TYR
0.39
13
61
ALA
0.37
14
62
ILE
0.38
15
63
GLY
0.28
16
64
LEU
0.27
17
65
GLY
0.28
18
66
ASN
0.23
19
67
VAL
0.26
20
68
TRP
0.35
21
69
ARG
0.45
22
70
PHE
0.46
23
71
PRO
0.46
24
72
TYR
0.55
25
73
LEU
0.64
26
74
CYS
0.62
27
75
GLY
0.60
28
76
LYS
0.60
29
77
ASN
0.66
30
78
GLY
0.64
31
79
GLY
0.71
32
80
GLY
0.62
3D View
Download PDB file DAQ[SS]
Download Secondary Structure Prediction file
Render Map
Sequence of
49   ​G​​R​​F​​D​​F​​L​​M​​S​​C​​V​59   ​G​​Y​​A​​I​​G​​L​​G​​N​​V​​W​69   ​R​​F​​P​​Y​​L​​C​​G​​K​​N​​G​79   ​G​​G​​A​​F​​L​​I​​P​​Y​​F​​L​89   ​T​​L​​I​​F​​A​​G​​V​​P​​L​​F​99   ​L​​L​​E​​C​​S​​L​​G​​Q​​Y​​T​109  ​S​​I​​G​​G​​L​​G​​V​​W​​K​​L​119  ​A​​P​​M​​F​​K​​G​​V​​G​​L​​A​129  ​A​​A​​V​​L​​S​​F​​W​​L​​N​​I​139  ​Y​​Y​​I​​V​​I​​I​​S​​W​​A​​I​149  ​Y​​Y​​L​​Y​​N​​S​​F​​T​​T​​T​159  ​L​​P​​W​​K​​Q​​C​​D​​N​​P​​W​169  ​N​​T​​D​​R​​C​​F​​S​​N​​Y​​S​179  ​M​​V​​N​​T​​T​​N​​M​​T​​S​​A​189  ​V​​V​​E​​F​​W​​E​​R​​N​​M​​H​199  ​Q​​M​​T​​D​​G​​L​​D​​K​​P​​G​209  ​Q​​I​​R​​W​​P​​L​​A​​I​​T​​L​219  ​A​​I​​A​​W​​I​​L​​V​​Y​​F​​C​229  ​I​​W​​K​​G​​V​​G​​W​​T​​G​​K​239  ​V​​V​​Y​​F​​S​​A​​T​​Y​​P​​Y​249  ​I​​M​​L​​I​​I​​L​​F​​F​​R​​G​259  ​V​​T​​L​​P​​G​​A​​K​​E​​G​​I​269  ​L​​F​​Y​​I​​T​​P​​N​​F​​R​​K​279  ​L​​S​​D​​S​​E​​V​​W​​L​​D​​A​289  ​A​​T​​Q​​I​​F​​F​​S​​Y​​G​​L​299  ​G​​L​​G​​S​​L​​I​​A​​L​​G​​S​309  ​Y​​N​​S​​F​​H​​N​​N​​V​​Y​​R​319  ​D​​S​​I​​I​​V​​C​​C​​I​​N​​S​329  ​C​​T​​S​​M​​F​​A​​G​​F​​V​​I​339  ​F​​S​​I​​V​​G​​F​​M​​A​​H​​V​349  ​T​​K​​R​​S​​I​​A​​D​​V​​A​​A​359  ​S​​G​​P​​G​​L​​A​​F​​L​​A​​Y​369  ​P​​E​​A​​V​​T​​Q​​L​​P​​I​​S​379  ​P​​L​​W​​A​​I​​L​​F​​F​​S​​M​389  ​L​​L​​M​​L​​G​​I​​D​​S​​Q​​F​399  ​C​​T​​V​​E​​G​​F​​I​​T​​A​​L​409  ​V​​D​​E​​Y​​P​​R​​L​​L​​R​​N​419  ​R​​R​​E​​L​​F​​I​​A​​A​​V​​C​429  ​I​​I​​S​​Y​​L​​I​​G​​L​​S​​N​439  ​I​​T​​Q​​G​​G​​I​​Y​​V​​F​​K​449  ​L​​F​​D​​Y​​Y​​S​​A​​S​​G​​M​459  ​S​​L​​L​​F​​L​​V​​F​​F​​E​​C​469  ​V​​S​​I​​S​​W​​F​​Y​​G​​V​​N​479  ​R​​F​​Y​​D​​N​​I​​Q​​E​​M​​V​489  ​G​​S​​R​​P​​C​​I​​W​​W​​K​​L​499  ​C​​W​​S​​F​​F​​T​​P​​I​​I​​V​509  ​A​​G​​V​​F​​I​​F​​S​​A​​V​​Q​519  ​M​​T​​P​​L​​T​​M​​G​​N​​Y​​V​529  ​F​​P​​K​​W​​G​​Q​​G​​V​​G​​W​539  ​L​​M​​A​​L​​S​​S​​M​​V​​L​​I​549  ​P​​G​​Y​​M​​A​​Y​​M​​F​​L​​T​559  ​L​​K​​G​​S​​L​​K​​Q​​R​​I​​Q​569  ​V​​M​​V​​Q​​P​​S​​E​​D​​I​​V​579  ​R​​P​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.95 .. 0.62
-0.95
0.62
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
49
GLY
0.22
2
50
ARG
0.13
3
51
PHE
0.00
4
52
ASP
-0.10
5
53
PHE
-0.07
6
54
LEU
-0.07
7
55
MET
-0.16
8
56
SER
-0.14
9
57
CYS
-0.11
10
58
VAL
-0.11
11
59
GLY
-0.14
12
60
TYR
-0.14
13
61
ALA
-0.15
14
62
ILE
-0.16
15
63
GLY
-0.31
16
64
LEU
-0.34
17
65
GLY
-0.44
18
66
ASN
-0.56
19
67
VAL
-0.55
20
68
TRP
-0.44
21
69
ARG
-0.38
22
70
PHE
-0.34
23
71
PRO
-0.33
24
72
TYR
-0.36
25
73
LEU
-0.46
26
74
CYS
-0.50
27
75
GLY
-0.49
28
76
LYS
-0.50
29
77
ASN
-0.51
30
78
GLY
-0.47
31
79
GLY
-0.63
32
80
GLY
-0.64
3D View
Download PDB file DAQ[Total]
Render Map
Sequence of
49   ​G​​R​​F​​D​​F​​L​​M​​S​​C​​V​59   ​G​​Y​​A​​I​​G​​L​​G​​N​​V​​W​69   ​R​​F​​P​​Y​​L​​C​​G​​K​​N​​G​79   ​G​​G​​A​​F​​L​​I​​P​​Y​​F​​L​89   ​T​​L​​I​​F​​A​​G​​V​​P​​L​​F​99   ​L​​L​​E​​C​​S​​L​​G​​Q​​Y​​T​109  ​S​​I​​G​​G​​L​​G​​V​​W​​K​​L​119  ​A​​P​​M​​F​​K​​G​​V​​G​​L​​A​129  ​A​​A​​V​​L​​S​​F​​W​​L​​N​​I​139  ​Y​​Y​​I​​V​​I​​I​​S​​W​​A​​I​149  ​Y​​Y​​L​​Y​​N​​S​​F​​T​​T​​T​159  ​L​​P​​W​​K​​Q​​C​​D​​N​​P​​W​169  ​N​​T​​D​​R​​C​​F​​S​​N​​Y​​S​179  ​M​​V​​N​​T​​T​​N​​M​​T​​S​​A​189  ​V​​V​​E​​F​​W​​E​​R​​N​​M​​H​199  ​Q​​M​​T​​D​​G​​L​​D​​K​​P​​G​209  ​Q​​I​​R​​W​​P​​L​​A​​I​​T​​L​219  ​A​​I​​A​​W​​I​​L​​V​​Y​​F​​C​229  ​I​​W​​K​​G​​V​​G​​W​​T​​G​​K​239  ​V​​V​​Y​​F​​S​​A​​T​​Y​​P​​Y​249  ​I​​M​​L​​I​​I​​L​​F​​F​​R​​G​259  ​V​​T​​L​​P​​G​​A​​K​​E​​G​​I​269  ​L​​F​​Y​​I​​T​​P​​N​​F​​R​​K​279  ​L​​S​​D​​S​​E​​V​​W​​L​​D​​A​289  ​A​​T​​Q​​I​​F​​F​​S​​Y​​G​​L​299  ​G​​L​​G​​S​​L​​I​​A​​L​​G​​S​309  ​Y​​N​​S​​F​​H​​N​​N​​V​​Y​​R​319  ​D​​S​​I​​I​​V​​C​​C​​I​​N​​S​329  ​C​​T​​S​​M​​F​​A​​G​​F​​V​​I​339  ​F​​S​​I​​V​​G​​F​​M​​A​​H​​V​349  ​T​​K​​R​​S​​I​​A​​D​​V​​A​​A​359  ​S​​G​​P​​G​​L​​A​​F​​L​​A​​Y​369  ​P​​E​​A​​V​​T​​Q​​L​​P​​I​​S​379  ​P​​L​​W​​A​​I​​L​​F​​F​​S​​M​389  ​L​​L​​M​​L​​G​​I​​D​​S​​Q​​F​399  ​C​​T​​V​​E​​G​​F​​I​​T​​A​​L​409  ​V​​D​​E​​Y​​P​​R​​L​​L​​R​​N​419  ​R​​R​​E​​L​​F​​I​​A​​A​​V​​C​429  ​I​​I​​S​​Y​​L​​I​​G​​L​​S​​N​439  ​I​​T​​Q​​G​​G​​I​​Y​​V​​F​​K​449  ​L​​F​​D​​Y​​Y​​S​​A​​S​​G​​M​459  ​S​​L​​L​​F​​L​​V​​F​​F​​E​​C​469  ​V​​S​​I​​S​​W​​F​​Y​​G​​V​​N​479  ​R​​F​​Y​​D​​N​​I​​Q​​E​​M​​V​489  ​G​​S​​R​​P​​C​​I​​W​​W​​K​​L​499  ​C​​W​​S​​F​​F​​T​​P​​I​​I​​V​509  ​A​​G​​V​​F​​I​​F​​S​​A​​V​​Q​519  ​M​​T​​P​​L​​T​​M​​G​​N​​Y​​V​529  ​F​​P​​K​​W​​G​​Q​​G​​V​​G​​W​539  ​L​​M​​A​​L​​S​​S​​M​​V​​L​​I​549  ​P​​G​​Y​​M​​A​​Y​​M​​F​​L​​T​559  ​L​​K​​G​​S​​L​​K​​Q​​R​​I​​Q​569  ​V​​M​​V​​Q​​P​​S​​E​​D​​I​​V​579  ​R​​P​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.08 .. 3.15
0.08
3.15
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
49
GLY
1.02
2
50
ARG
0.88
3
51
PHE
0.61
4
52
ASP
0.53
5
53
PHE
0.34
6
54
LEU
0.38
7
55
MET
0.28
8
56
SER
0.39
9
57
CYS
0.52
10
58
VAL
0.52
11
59
GLY
0.74
12
60
TYR
0.74
13
61
ALA
0.85
14
62
ILE
0.94
15
63
GLY
0.77
16
64
LEU
0.73
17
65
GLY
0.64
18
66
ASN
0.55
19
67
VAL
0.57
20
68
TRP
0.76
21
69
ARG
1.00
22
70
PHE
1.21
23
71
PRO
1.27
24
72
TYR
1.40
25
73
LEU
1.33
26
74
CYS
1.28
27
75
GLY
1.29
28
76
LYS
1.34
29
77
ASN
1.41
30
78
GLY
1.32
31
79
GLY
1.22
32
80
GLY
1.09