34038 7YQX H v1-2
Structure title SARS-CoV-2 BA.2.75 S Trimer in complex with S309 (state1)
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 3.72 Å
Source organism Homo sapiens

Sequence of
1    ​Q​​V​​Q​​L​​V​​Q​​S​​G​​A​​E​11   ​V​​K​​K​​P​​G​​A​​S​​V​​K​​V​21   ​S​​C​​K​​A​​S​​G​​Y​​P​​F​​T​31   ​S​​Y​​G​​I​​S​​W​​V​​R​​Q​​A​41   ​P​​G​​Q​​G​​L​​E​​W​​M​​G​​W​51   ​I​​S​​T​​Y​​N​​G​​N​​T​​N​​Y​61   ​A​​Q​​K​​F​​Q​​G​​R​​V​​T​​M​71   ​T​​T​​D​​T​​S​​T​​T​​T​​G​​Y​81   ​M​​E​​L​​R​​R​​L​​R​​S​​D​​D​91   ​T​​A​​V​​Y​​Y​​C​​A​​R​​D​​Y​101  ​T​​R​​G​​A​​W​​F​​G​​E​​S​​L​111  ​I​​G​​G​​F​​D​​N​​W​​G​​Q​​G​121  ​T​​L​​V​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.06 .. 0.39
-0.06
0.39
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
1
GLN
0.01
2
2
VAL
-0.03
3
3
GLN
-0.02
4
4
LEU
-0.02
5
5
VAL
-0.01
6
6
GLN
-0.01
7
7
SER
-0.01
8
8
GLY
0.00
9
9
ALA
0.03
10
10
GLU
0.04
11
11
VAL
0.02
12
12
LYS
0.06
13
13
LYS
0.07
14
14
PRO
0.10
15
15
GLY
0.12
16
16
ALA
0.12
17
17
SER
0.11
18
18
VAL
0.00
19
19
LYS
0.01
20
20
VAL
0.00
21
21
SER
0.03
22
22
CYS
0.03
23
23
LYS
0.04
24
24
ALA
0.07
25
25
SER
0.14
26
26
GLY
0.15
27
27
TYR
0.16
28
28
PRO
0.15
29
29
PHE
0.13
30
30
THR
0.15
31
31
SER
0.15
32
32
TYR
0.13
Sequence of
1    ​Q​​V​​Q​​L​​V​​Q​​S​​G​​A​​E​11   ​V​​K​​K​​P​​G​​A​​S​​V​​K​​V​21   ​S​​C​​K​​A​​S​​G​​Y​​P​​F​​T​31   ​S​​Y​​G​​I​​S​​W​​V​​R​​Q​​A​41   ​P​​G​​Q​​G​​L​​E​​W​​M​​G​​W​51   ​I​​S​​T​​Y​​N​​G​​N​​T​​N​​Y​61   ​A​​Q​​K​​F​​Q​​G​​R​​V​​T​​M​71   ​T​​T​​D​​T​​S​​T​​T​​T​​G​​Y​81   ​M​​E​​L​​R​​R​​L​​R​​S​​D​​D​91   ​T​​A​​V​​Y​​Y​​C​​A​​R​​D​​Y​101  ​T​​R​​G​​A​​W​​F​​G​​E​​S​​L​111  ​I​​G​​G​​F​​D​​N​​W​​G​​Q​​G​121  ​T​​L​​V​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.05 .. 0.28
-0.05
0.28
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
1
GLN
0.10
2
2
VAL
0.09
3
3
GLN
0.10
4
4
LEU
0.10
5
5
VAL
0.11
6
6
GLN
0.11
7
7
SER
0.11
8
8
GLY
0.12
9
9
ALA
0.12
10
10
GLU
0.12
11
11
VAL
0.12
12
12
LYS
0.12
13
13
LYS
0.12
14
14
PRO
0.12
15
15
GLY
0.13
16
16
ALA
0.14
17
17
SER
0.15
18
18
VAL
0.16
19
19
LYS
0.18
20
20
VAL
0.21
21
21
SER
0.23
22
22
CYS
0.28
23
23
LYS
0.24
24
24
ALA
0.23
25
25
SER
0.18
26
26
GLY
0.18
27
27
TYR
0.17
28
28
PRO
0.16
29
29
PHE
0.16
30
30
THR
0.15
31
31
SER
0.15
32
32
TYR
0.14
Sequence of
1    ​Q​​V​​Q​​L​​V​​Q​​S​​G​​A​​E​11   ​V​​K​​K​​P​​G​​A​​S​​V​​K​​V​21   ​S​​C​​K​​A​​S​​G​​Y​​P​​F​​T​31   ​S​​Y​​G​​I​​S​​W​​V​​R​​Q​​A​41   ​P​​G​​Q​​G​​L​​E​​W​​M​​G​​W​51   ​I​​S​​T​​Y​​N​​G​​N​​T​​N​​Y​61   ​A​​Q​​K​​F​​Q​​G​​R​​V​​T​​M​71   ​T​​T​​D​​T​​S​​T​​T​​T​​G​​Y​81   ​M​​E​​L​​R​​R​​L​​R​​S​​D​​D​91   ​T​​A​​V​​Y​​Y​​C​​A​​R​​D​​Y​101  ​T​​R​​G​​A​​W​​F​​G​​E​​S​​L​111  ​I​​G​​G​​F​​D​​N​​W​​G​​Q​​G​121  ​T​​L​​V​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.47 .. 0.36
-0.47
0.36
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
1
GLN
-0.33
2
2
VAL
-0.43
3
3
GLN
-0.47
4
4
LEU
-0.44
5
5
VAL
-0.40
6
6
GLN
-0.37
7
7
SER
-0.34
8
8
GLY
-0.32
9
9
ALA
-0.33
10
10
GLU
-0.35
11
11
VAL
-0.43
12
12
LYS
-0.40
13
13
LYS
-0.32
14
14
PRO
-0.29
15
15
GLY
-0.23
16
16
ALA
-0.17
17
17
SER
-0.16
18
18
VAL
-0.15
19
19
LYS
-0.13
20
20
VAL
-0.09
21
21
SER
0.00
22
22
CYS
0.06
23
23
LYS
0.06
24
24
ALA
0.08
25
25
SER
0.14
26
26
GLY
0.17
27
27
TYR
0.20
28
28
PRO
0.26
29
29
PHE
0.29
30
30
THR
0.36
31
31
SER
0.35
32
32
TYR
0.32
Sequence of
1    ​Q​​V​​Q​​L​​V​​Q​​S​​G​​A​​E​11   ​V​​K​​K​​P​​G​​A​​S​​V​​K​​V​21   ​S​​C​​K​​A​​S​​G​​Y​​P​​F​​T​31   ​S​​Y​​G​​I​​S​​W​​V​​R​​Q​​A​41   ​P​​G​​Q​​G​​L​​E​​W​​M​​G​​W​51   ​I​​S​​T​​Y​​N​​G​​N​​T​​N​​Y​61   ​A​​Q​​K​​F​​Q​​G​​R​​V​​T​​M​71   ​T​​T​​D​​T​​S​​T​​T​​T​​G​​Y​81   ​M​​E​​L​​R​​R​​L​​R​​S​​D​​D​91   ​T​​A​​V​​Y​​Y​​C​​A​​R​​D​​Y​101  ​T​​R​​G​​A​​W​​F​​G​​E​​S​​L​111  ​I​​G​​G​​F​​D​​N​​W​​G​​Q​​G​121  ​T​​L​​V​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.40 .. 0.69
-0.40
0.69
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
1
GLN
-0.22
2
2
VAL
-0.37
3
3
GLN
-0.40
4
4
LEU
-0.35
5
5
VAL
-0.31
6
6
GLN
-0.27
7
7
SER
-0.24
8
8
GLY
-0.21
9
9
ALA
-0.19
10
10
GLU
-0.20
11
11
VAL
-0.29
12
12
LYS
-0.22
13
13
LYS
-0.12
14
14
PRO
-0.07
15
15
GLY
0.02
16
16
ALA
0.09
17
17
SER
0.11
18
18
VAL
0.01
19
19
LYS
0.06
20
20
VAL
0.12
21
21
SER
0.26
22
22
CYS
0.37
23
23
LYS
0.35
24
24
ALA
0.38
25
25
SER
0.47
26
26
GLY
0.50
27
27
TYR
0.53
28
28
PRO
0.57
29
29
PHE
0.59
30
30
THR
0.66
31
31
SER
0.65
32
32
TYR
0.60