34872 8HLC I v1-0
Structure title S protein of SARS-CoV-2 in complex with 3711
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 2.8 Å
Source organism Homo sapiens

Sequence of
1    ​E​​V​​Q​​L​​V​​E​​S​​G​​G​​G​11   ​L​​V​​K​​P​​G​​R​​S​​L​​R​​L​21   ​S​​C​​A​​A​​S​​G​​F​​T​​F​​S​31   ​D​​Y​​Y​​M​​S​​W​​I​​R​​Q​​A​41   ​P​​G​​K​​G​​L​​E​​W​​V​​S​​Y​51   ​I​​S​​S​​S​​G​​S​​T​​I​​Y​​Y​61   ​A​​D​​S​​V​​R​​G​​R​​F​​T​​I​71   ​S​​R​​D​​N​​A​​K​​N​​S​​L​​Y​81   ​L​​Q​​M​​N​​T​​L​​R​​A​​E​​D​91   ​T​​A​​V​​Y​​Y​​C​​A​​R​​G​​G​101  ​W​​E​​L​​R​​S​​L​​A​​G​​G​​Y​111  ​Y​​G​​M​​D​​V​​W​​G​​Q​​G​​T​121  ​T​​V​​T​​V​​S​​S​​A​​S​​T​​K​131  ​G​​P​​S​​V​​F​​P​​L​​A​​P​​S​141  ​S​​K​​S​​T​​S​​G​​G​​T​​A​​A​151  ​L​​G​​C​​L​​V​​K​​D​​Y​​F​​P​161  ​E​​P​​V​​T​​V​​S​​W​​N​​S​​G​171  ​A​​L​​T​​S​​G​​V​​H​​T​​F​​P​181  ​A​​V​​L​​Q​​S​​S​​G​​L​​Y​​S​191  ​L​​S​​S​​V​​V​​T​​V​​P​​S​​S​201  ​S​​L​​G​​T​​Q​​T​​Y​​I​​C​​N​211  ​V​​N​​H​​K​​P​​S​​N​​T​​K​​V​221  ​D​​K​​K​​V​​E​​P​​K​​S​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.12 .. 0.27
-0.12
0.27
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
1
GLU
0.10
2
2
VAL
0.09
3
3
GLN
0.09
4
4
LEU
0.05
5
5
VAL
0.02
6
6
GLU
0.02
7
7
SER
0.00
8
8
GLY
-0.01
9
9
GLY
0.00
10
10
GLY
0.00
11
11
LEU
0.00
12
12
VAL
0.00
13
13
LYS
0.00
14
14
PRO
-0.01
15
15
GLY
0.00
16
16
ARG
-0.01
17
17
SER
0.00
18
18
LEU
-0.05
19
19
ARG
-0.04
20
20
LEU
-0.05
21
21
SER
-0.05
22
22
CYS
-0.05
23
23
ALA
-0.02
24
24
ALA
0.02
25
25
SER
0.02
26
26
GLY
0.02
27
27
PHE
0.06
28
28
THR
0.07
29
29
PHE
0.07
30
30
SER
0.05
31
31
ASP
0.06
32
32
TYR
0.05
Sequence of
1    ​E​​V​​Q​​L​​V​​E​​S​​G​​G​​G​11   ​L​​V​​K​​P​​G​​R​​S​​L​​R​​L​21   ​S​​C​​A​​A​​S​​G​​F​​T​​F​​S​31   ​D​​Y​​Y​​M​​S​​W​​I​​R​​Q​​A​41   ​P​​G​​K​​G​​L​​E​​W​​V​​S​​Y​51   ​I​​S​​S​​S​​G​​S​​T​​I​​Y​​Y​61   ​A​​D​​S​​V​​R​​G​​R​​F​​T​​I​71   ​S​​R​​D​​N​​A​​K​​N​​S​​L​​Y​81   ​L​​Q​​M​​N​​T​​L​​R​​A​​E​​D​91   ​T​​A​​V​​Y​​Y​​C​​A​​R​​G​​G​101  ​W​​E​​L​​R​​S​​L​​A​​G​​G​​Y​111  ​Y​​G​​M​​D​​V​​W​​G​​Q​​G​​T​121  ​T​​V​​T​​V​​S​​S​​A​​S​​T​​K​131  ​G​​P​​S​​V​​F​​P​​L​​A​​P​​S​141  ​S​​K​​S​​T​​S​​G​​G​​T​​A​​A​151  ​L​​G​​C​​L​​V​​K​​D​​Y​​F​​P​161  ​E​​P​​V​​T​​V​​S​​W​​N​​S​​G​171  ​A​​L​​T​​S​​G​​V​​H​​T​​F​​P​181  ​A​​V​​L​​Q​​S​​S​​G​​L​​Y​​S​191  ​L​​S​​S​​V​​V​​T​​V​​P​​S​​S​201  ​S​​L​​G​​T​​Q​​T​​Y​​I​​C​​N​211  ​V​​N​​H​​K​​P​​S​​N​​T​​K​​V​221  ​D​​K​​K​​V​​E​​P​​K​​S​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.07 .. 0.20
-0.07
0.20
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
1
GLU
0.01
2
2
VAL
0.01
3
3
GLN
0.01
4
4
LEU
0.00
5
5
VAL
0.00
6
6
GLU
0.02
7
7
SER
0.02
8
8
GLY
0.01
9
9
GLY
0.01
10
10
GLY
0.00
11
11
LEU
0.01
12
12
VAL
-0.01
13
13
LYS
-0.02
14
14
PRO
-0.04
15
15
GLY
-0.05
16
16
ARG
-0.04
17
17
SER
-0.02
18
18
LEU
0.01
19
19
ARG
0.04
20
20
LEU
0.04
21
21
SER
0.06
22
22
CYS
0.09
23
23
ALA
0.12
24
24
ALA
0.13
25
25
SER
0.12
26
26
GLY
0.12
27
27
PHE
0.13
28
28
THR
0.13
29
29
PHE
0.14
30
30
SER
0.14
31
31
ASP
0.12
32
32
TYR
0.14
Sequence of
1    ​E​​V​​Q​​L​​V​​E​​S​​G​​G​​G​11   ​L​​V​​K​​P​​G​​R​​S​​L​​R​​L​21   ​S​​C​​A​​A​​S​​G​​F​​T​​F​​S​31   ​D​​Y​​Y​​M​​S​​W​​I​​R​​Q​​A​41   ​P​​G​​K​​G​​L​​E​​W​​V​​S​​Y​51   ​I​​S​​S​​S​​G​​S​​T​​I​​Y​​Y​61   ​A​​D​​S​​V​​R​​G​​R​​F​​T​​I​71   ​S​​R​​D​​N​​A​​K​​N​​S​​L​​Y​81   ​L​​Q​​M​​N​​T​​L​​R​​A​​E​​D​91   ​T​​A​​V​​Y​​Y​​C​​A​​R​​G​​G​101  ​W​​E​​L​​R​​S​​L​​A​​G​​G​​Y​111  ​Y​​G​​M​​D​​V​​W​​G​​Q​​G​​T​121  ​T​​V​​T​​V​​S​​S​​A​​S​​T​​K​131  ​G​​P​​S​​V​​F​​P​​L​​A​​P​​S​141  ​S​​K​​S​​T​​S​​G​​G​​T​​A​​A​151  ​L​​G​​C​​L​​V​​K​​D​​Y​​F​​P​161  ​E​​P​​V​​T​​V​​S​​W​​N​​S​​G​171  ​A​​L​​T​​S​​G​​V​​H​​T​​F​​P​181  ​A​​V​​L​​Q​​S​​S​​G​​L​​Y​​S​191  ​L​​S​​S​​V​​V​​T​​V​​P​​S​​S​201  ​S​​L​​G​​T​​Q​​T​​Y​​I​​C​​N​211  ​V​​N​​H​​K​​P​​S​​N​​T​​K​​V​221  ​D​​K​​K​​V​​E​​P​​K​​S​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.46 .. 0.33
-0.46
0.33
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
1
GLU
-0.13
2
2
VAL
-0.12
3
3
GLN
-0.14
4
4
LEU
-0.14
5
5
VAL
-0.14
6
6
GLU
-0.12
7
7
SER
-0.11
8
8
GLY
-0.10
9
9
GLY
-0.10
10
10
GLY
-0.09
11
11
LEU
-0.05
12
12
VAL
-0.03
13
13
LYS
0.03
14
14
PRO
0.08
15
15
GLY
0.09
16
16
ARG
0.10
17
17
SER
0.08
18
18
LEU
0.08
19
19
ARG
0.06
20
20
LEU
0.09
21
21
SER
0.09
22
22
CYS
0.09
23
23
ALA
0.10
24
24
ALA
0.11
25
25
SER
0.10
26
26
GLY
0.12
27
27
PHE
0.13
28
28
THR
0.17
29
29
PHE
0.17
30
30
SER
0.15
31
31
ASP
0.14
32
32
TYR
0.11
Sequence of
1    ​E​​V​​Q​​L​​V​​E​​S​​G​​G​​G​11   ​L​​V​​K​​P​​G​​R​​S​​L​​R​​L​21   ​S​​C​​A​​A​​S​​G​​F​​T​​F​​S​31   ​D​​Y​​Y​​M​​S​​W​​I​​R​​Q​​A​41   ​P​​G​​K​​G​​L​​E​​W​​V​​S​​Y​51   ​I​​S​​S​​S​​G​​S​​T​​I​​Y​​Y​61   ​A​​D​​S​​V​​R​​G​​R​​F​​T​​I​71   ​S​​R​​D​​N​​A​​K​​N​​S​​L​​Y​81   ​L​​Q​​M​​N​​T​​L​​R​​A​​E​​D​91   ​T​​A​​V​​Y​​Y​​C​​A​​R​​G​​G​101  ​W​​E​​L​​R​​S​​L​​A​​G​​G​​Y​111  ​Y​​G​​M​​D​​V​​W​​G​​Q​​G​​T​121  ​T​​V​​T​​V​​S​​S​​A​​S​​T​​K​131  ​G​​P​​S​​V​​F​​P​​L​​A​​P​​S​141  ​S​​K​​S​​T​​S​​G​​G​​T​​A​​A​151  ​L​​G​​C​​L​​V​​K​​D​​Y​​F​​P​161  ​E​​P​​V​​T​​V​​S​​W​​N​​S​​G​171  ​A​​L​​T​​S​​G​​V​​H​​T​​F​​P​181  ​A​​V​​L​​Q​​S​​S​​G​​L​​Y​​S​191  ​L​​S​​S​​V​​V​​T​​V​​P​​S​​S​201  ​S​​L​​G​​T​​Q​​T​​Y​​I​​C​​N​211  ​V​​N​​H​​K​​P​​S​​N​​T​​K​​V​221  ​D​​K​​K​​V​​E​​P​​K​​S​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.42 .. 0.59
-0.42
0.59
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
1
GLU
-0.02
2
2
VAL
-0.02
3
3
GLN
-0.04
4
4
LEU
-0.09
5
5
VAL
-0.12
6
6
GLU
-0.08
7
7
SER
-0.08
8
8
GLY
-0.09
9
9
GLY
-0.09
10
10
GLY
-0.09
11
11
LEU
-0.04
12
12
VAL
-0.04
13
13
LYS
0.01
14
14
PRO
0.03
15
15
GLY
0.04
16
16
ARG
0.05
17
17
SER
0.06
18
18
LEU
0.04
19
19
ARG
0.06
20
20
LEU
0.08
21
21
SER
0.10
22
22
CYS
0.13
23
23
ALA
0.20
24
24
ALA
0.25
25
25
SER
0.24
26
26
GLY
0.26
27
27
PHE
0.31
28
28
THR
0.37
29
29
PHE
0.38
30
30
SER
0.35
31
31
ASP
0.33
32
32
TYR
0.30