3539 5MPS o v2-0
Structure title Structure of a spliceosome remodeled for exon ligation
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 3.85 Å
Source organism Saccharomyces cerevisiae

Sequence of
51   ​F​​T​​K​​S​​E​​L​​K​​R​​R​​R​61   ​K​​T​​R​​K​​G​​D​​G​​P​​W​​G​71   ​S​​W​​S​​I​​R​​N​​Y​​P​​G​​H​162  ​P​​E​​G​​T​​T​​A​​L​​K​​F​​L​172  ​P​​K​​T​​G​​H​​L​​I​​L​​S​​G​182  ​G​​N​​D​​H​​T​​I​​K​​I​​W​​D​192  ​F​​Y​​H​​D​​Y​​E​​C​​L​​R​​D​202  ​F​​Q​​G​​H​​N​​K​​P​​I​​K​​A​212  ​L​​R​​F​​T​​E​​D​​C​​Q​​S​​F​222  ​L​​S​​S​​S​​F​​D​​R​​S​​V​​K​232  ​I​​W​​D​​T​​E​​T​​G​​K​​V​​K​242  ​T​​R​​L​​H​​L​​N​​S​​T​​P​​A​252  ​D​​V​​E​​S​​R​​P​​T​​N​​P​​H​262  ​E​​F​​I​​V​​G​​L​​S​​N​​S​​K​272  ​I​​L​​H​​Y​​D​​D​​R​​V​​S​​E​282  ​N​​Q​​G​​L​​V​​Q​​T​​Y​​D​​H​292  ​H​​L​​S​​S​​I​​L​​A​​L​​K​​Y​302  ​F​​P​​D​​G​​S​​K​​F​​I​​S​​S​312  ​S​​E​​D​​K​​T​​V​​R​​I​​W​​E​322  ​N​​Q​​I​​N​​V​​P​​I​​K​​Q​​I​332  ​S​​D​​T​​A​​Q​​H​​S​​M​​P​​F​342  ​L​​N​​V​​H​​P​​S​​Q​​N​​Y​​F​352  ​C​​A​​Q​​S​​M​​D​​N​​R​​I​​Y​362  ​S​​F​​S​​L​​K​​P​​K​​Y​​K​​R​372  ​H​​P​​K​​K​​I​​F​​K​​G​​H​​S​382  ​S​​A​​G​​Y​​G​​I​​S​​L​​R​​Y​398  ​I​​C​​S​​G​​D​​S​​K​​S​​R​​L​408  ​F​​T​​W​​D​​W​​N​​T​​S​​R​​L​418  ​L​​N​​N​​I​​N​​K​​P​​I​​T​​Q​432  ​V​​D​​W​​H​​P​​Q​​E​​T​​S​​K​442  ​V​​I​​C​​S​​G​​A​​A​​G​​K​​I​452  ​Y​​V​​C​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.14 .. 0.75
-0.14
0.75
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
51
PHE
0.31
2
52
THR
0.38
3
53
LYS
0.36
4
54
SER
0.35
5
55
GLU
0.39
6
56
LEU
0.42
7
57
LYS
0.44
8
58
ARG
0.35
9
59
ARG
0.38
10
60
ARG
0.40
11
61
LYS
0.54
12
62
THR
0.57
13
63
ARG
0.70
14
64
LYS
0.71
15
65
GLY
0.70
16
66
ASP
0.67
17
67
GLY
0.69
18
68
PRO
0.74
19
69
TRP
0.74
20
70
GLY
0.69
21
71
SER
0.66
22
72
TRP
0.70
23
73
SER
0.75
24
155
ILE
0.13
25
156
ARG
0.10
26
157
ASN
0.13
27
158
TYR
0.15
28
159
PRO
0.08
29
160
GLY
0.05
30
161
HIS
0.04
31
162
PRO
0.04
32
163
GLU
0.09
Sequence of
51   ​F​​T​​K​​S​​E​​L​​K​​R​​R​​R​61   ​K​​T​​R​​K​​G​​D​​G​​P​​W​​G​71   ​S​​W​​S​​I​​R​​N​​Y​​P​​G​​H​162  ​P​​E​​G​​T​​T​​A​​L​​K​​F​​L​172  ​P​​K​​T​​G​​H​​L​​I​​L​​S​​G​182  ​G​​N​​D​​H​​T​​I​​K​​I​​W​​D​192  ​F​​Y​​H​​D​​Y​​E​​C​​L​​R​​D​202  ​F​​Q​​G​​H​​N​​K​​P​​I​​K​​A​212  ​L​​R​​F​​T​​E​​D​​C​​Q​​S​​F​222  ​L​​S​​S​​S​​F​​D​​R​​S​​V​​K​232  ​I​​W​​D​​T​​E​​T​​G​​K​​V​​K​242  ​T​​R​​L​​H​​L​​N​​S​​T​​P​​A​252  ​D​​V​​E​​S​​R​​P​​T​​N​​P​​H​262  ​E​​F​​I​​V​​G​​L​​S​​N​​S​​K​272  ​I​​L​​H​​Y​​D​​D​​R​​V​​S​​E​282  ​N​​Q​​G​​L​​V​​Q​​T​​Y​​D​​H​292  ​H​​L​​S​​S​​I​​L​​A​​L​​K​​Y​302  ​F​​P​​D​​G​​S​​K​​F​​I​​S​​S​312  ​S​​E​​D​​K​​T​​V​​R​​I​​W​​E​322  ​N​​Q​​I​​N​​V​​P​​I​​K​​Q​​I​332  ​S​​D​​T​​A​​Q​​H​​S​​M​​P​​F​342  ​L​​N​​V​​H​​P​​S​​Q​​N​​Y​​F​352  ​C​​A​​Q​​S​​M​​D​​N​​R​​I​​Y​362  ​S​​F​​S​​L​​K​​P​​K​​Y​​K​​R​372  ​H​​P​​K​​K​​I​​F​​K​​G​​H​​S​382  ​S​​A​​G​​Y​​G​​I​​S​​L​​R​​Y​398  ​I​​C​​S​​G​​D​​S​​K​​S​​R​​L​408  ​F​​T​​W​​D​​W​​N​​T​​S​​R​​L​418  ​L​​N​​N​​I​​N​​K​​P​​I​​T​​Q​432  ​V​​D​​W​​H​​P​​Q​​E​​T​​S​​K​442  ​V​​I​​C​​S​​G​​A​​A​​G​​K​​I​452  ​Y​​V​​C​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.18 .. 0.58
-0.18
0.58
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
51
PHE
0.45
2
52
THR
0.45
3
53
LYS
0.51
4
54
SER
0.46
5
55
GLU
0.47
6
56
LEU
0.48
7
57
LYS
0.48
8
58
ARG
0.35
9
59
ARG
0.30
10
60
ARG
0.32
11
61
LYS
0.28
12
62
THR
0.26
13
63
ARG
0.26
14
64
LYS
0.26
15
65
GLY
0.23
16
66
ASP
0.18
17
67
GLY
0.17
18
68
PRO
0.18
19
69
TRP
0.17
20
70
GLY
0.10
21
71
SER
0.07
22
72
TRP
-0.03
23
73
SER
-0.03
24
155
ILE
0.13
25
156
ARG
-0.18
26
157
ASN
-0.18
27
158
TYR
-0.16
28
159
PRO
-0.09
29
160
GLY
-0.02
30
161
HIS
0.01
31
162
PRO
0.04
32
163
GLU
0.07
Sequence of
51   ​F​​T​​K​​S​​E​​L​​K​​R​​R​​R​61   ​K​​T​​R​​K​​G​​D​​G​​P​​W​​G​71   ​S​​W​​S​​I​​R​​N​​Y​​P​​G​​H​162  ​P​​E​​G​​T​​T​​A​​L​​K​​F​​L​172  ​P​​K​​T​​G​​H​​L​​I​​L​​S​​G​182  ​G​​N​​D​​H​​T​​I​​K​​I​​W​​D​192  ​F​​Y​​H​​D​​Y​​E​​C​​L​​R​​D​202  ​F​​Q​​G​​H​​N​​K​​P​​I​​K​​A​212  ​L​​R​​F​​T​​E​​D​​C​​Q​​S​​F​222  ​L​​S​​S​​S​​F​​D​​R​​S​​V​​K​232  ​I​​W​​D​​T​​E​​T​​G​​K​​V​​K​242  ​T​​R​​L​​H​​L​​N​​S​​T​​P​​A​252  ​D​​V​​E​​S​​R​​P​​T​​N​​P​​H​262  ​E​​F​​I​​V​​G​​L​​S​​N​​S​​K​272  ​I​​L​​H​​Y​​D​​D​​R​​V​​S​​E​282  ​N​​Q​​G​​L​​V​​Q​​T​​Y​​D​​H​292  ​H​​L​​S​​S​​I​​L​​A​​L​​K​​Y​302  ​F​​P​​D​​G​​S​​K​​F​​I​​S​​S​312  ​S​​E​​D​​K​​T​​V​​R​​I​​W​​E​322  ​N​​Q​​I​​N​​V​​P​​I​​K​​Q​​I​332  ​S​​D​​T​​A​​Q​​H​​S​​M​​P​​F​342  ​L​​N​​V​​H​​P​​S​​Q​​N​​Y​​F​352  ​C​​A​​Q​​S​​M​​D​​N​​R​​I​​Y​362  ​S​​F​​S​​L​​K​​P​​K​​Y​​K​​R​372  ​H​​P​​K​​K​​I​​F​​K​​G​​H​​S​382  ​S​​A​​G​​Y​​G​​I​​S​​L​​R​​Y​398  ​I​​C​​S​​G​​D​​S​​K​​S​​R​​L​408  ​F​​T​​W​​D​​W​​N​​T​​S​​R​​L​418  ​L​​N​​N​​I​​N​​K​​P​​I​​T​​Q​432  ​V​​D​​W​​H​​P​​Q​​E​​T​​S​​K​442  ​V​​I​​C​​S​​G​​A​​A​​G​​K​​I​452  ​Y​​V​​C​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.78 .. 0.58
-0.78
0.58
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
51
PHE
-0.72
2
52
THR
-0.78
3
53
LYS
-0.73
4
54
SER
-0.67
5
55
GLU
-0.62
6
56
LEU
-0.56
7
57
LYS
-0.52
8
58
ARG
-0.49
9
59
ARG
-0.45
10
60
ARG
-0.43
11
61
LYS
-0.35
12
62
THR
-0.32
13
63
ARG
-0.33
14
64
LYS
-0.27
15
65
GLY
-0.28
16
66
ASP
-0.26
17
67
GLY
-0.27
18
68
PRO
-0.26
19
69
TRP
-0.18
20
70
GLY
-0.11
21
71
SER
-0.01
22
72
TRP
0.01
23
73
SER
0.02
24
155
ILE
0.18
25
156
ARG
0.23
26
157
ASN
0.23
27
158
TYR
0.14
28
159
PRO
0.19
29
160
GLY
0.22
30
161
HIS
0.24
31
162
PRO
0.23
32
163
GLU
0.24
Converting to mmCIF
SequenceNo structure available
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.08 .. 1.60
-0.08
1.60
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
51
PHE
0.04
2
52
THR
0.05
3
53
LYS
0.14
4
54
SER
0.14
5
55
GLU
0.24
6
56
LEU
0.34
7
57
LYS
0.41
8
58
ARG
0.21
9
59
ARG
0.24
10
60
ARG
0.29
11
61
LYS
0.48
12
62
THR
0.51
13
63
ARG
0.63
14
64
LYS
0.69
15
65
GLY
0.64
16
66
ASP
0.58
17
67
GLY
0.60
18
68
PRO
0.67
19
69
TRP
0.73
20
70
GLY
0.68
21
71
SER
0.72
22
72
TRP
0.68
23
73
SER
0.74
24
155
ILE
0.44
25
156
ARG
0.15
26
157
ASN
0.18
27
158
TYR
0.13
28
159
PRO
0.19
29
160
GLY
0.25
30
161
HIS
0.29
31
162
PRO
0.32
32
163
GLU
0.39