42787 8UXW R v1-2
Structure title Arp2/3 branch junction complex, ADP state
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 2.7 Å
Source organism Oryctolagus cuniculus

Sequence of
6    ​T​​A​​L​​V​​C​​D​​N​​G​​S​​G​16   ​L​​V​​K​​A​​G​​F​​A​​G​​D​​D​26   ​A​​P​​R​​A​​V​​F​​P​​S​​I​​V​36   ​G​​R​​P​​R​​H​​Q​​G​​V​​M​​V​46   ​G​​M​​G​​Q​​K​​D​​S​​Y​​V​​G​56   ​D​​E​​A​​Q​​S​​K​​R​​G​​I​​L​66   ​T​​L​​K​​Y​​P​​I​​E​​G​​I​​I​77   ​T​​N​​W​​D​​D​​M​​E​​K​​I​​W​87   ​H​​H​​T​​F​​Y​​N​​E​​L​​R​​V​97   ​A​​P​​E​​E​​H​​P​​T​​L​​L​​T​107  ​E​​A​​P​​L​​N​​P​​K​​A​​N​​R​117  ​E​​K​​M​​T​​Q​​I​​M​​F​​E​​T​127  ​F​​N​​V​​P​​A​​M​​Y​​V​​A​​I​137  ​Q​​A​​V​​L​​S​​L​​Y​​A​​S​​G​147  ​R​​T​​T​​G​​I​​V​​L​​D​​S​​G​157  ​D​​G​​V​​T​​H​​N​​V​​P​​I​​Y​167  ​E​​G​​Y​​A​​L​​P​​H​​A​​I​​M​177  ​R​​L​​D​​L​​A​​G​​R​​D​​L​​T​187  ​D​​Y​​L​​M​​K​​I​​L​​T​​E​​R​197  ​G​​Y​​S​​F​​V​​T​​T​​A​​E​​R​207  ​E​​I​​V​​R​​D​​I​​K​​E​​K​​L​217  ​C​​Y​​V​​A​​L​​D​​F​​E​​N​​E​227  ​M​​A​​T​​A​​A​​S​​S​​S​​S​​L​237  ​E​​K​​S​​Y​​E​​L​​P​​D​​G​​Q​247  ​V​​I​​T​​I​​G​​N​​E​​R​​F​​R​257  ​C​​P​​E​​T​​L​​F​​Q​​P​​S​​F​267  ​I​​G​​M​​E​​S​​A​​G​​I​​H​​E​277  ​T​​T​​Y​​N​​S​​I​​M​​K​​C​​D​287  ​I​​D​​I​​R​​K​​D​​L​​Y​​A​​N​297  ​N​​V​​M​​S​​G​​G​​T​​T​​M​​Y​307  ​P​​G​​I​​A​​D​​R​​M​​Q​​K​​E​317  ​I​​T​​A​​L​​A​​P​​S​​T​​M​​K​327  ​I​​K​​I​​I​​A​​P​​P​​E​​R​​K​337  ​Y​​S​​V​​W​​I​​G​​G​​S​​I​​L​347  ​A​​S​​L​​S​​T​​F​​Q​​Q​​M​​W​357  ​I​​T​​K​​Q​​E​​Y​​D​​E​​A​​G​367  ​P​​S​​I​​V​​H​​R​​K​​C​​F​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.28 .. 1.27
0.28
1.27
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
6
THR
0.28
2
7
ALA
0.28
3
8
LEU
0.41
4
9
VAL
0.38
5
10
CYS
0.49
6
11
ASP
0.61
7
12
ASN
0.63
8
13
GLY
0.65
9
14
SER
0.65
10
15
GLY
0.68
11
16
LEU
0.70
12
17
VAL
0.73
13
18
LYS
0.83
14
19
ALA
0.79
15
20
GLY
0.93
16
21
PHE
1.06
17
22
ALA
1.09
18
23
GLY
1.01
19
24
ASP
1.03
20
25
ASP
1.05
21
26
ALA
1.04
22
27
PRO
1.05
23
28
ARG
1.02
24
29
ALA
0.97
25
30
VAL
0.80
26
31
PHE
0.76
27
32
PRO
0.76
28
33
SER
0.82
29
34
ILE
0.86
30
35
VAL
0.84
31
36
GLY
0.77
32
37
ARG
0.70
Sequence of
6    ​T​​A​​L​​V​​C​​D​​N​​G​​S​​G​16   ​L​​V​​K​​A​​G​​F​​A​​G​​D​​D​26   ​A​​P​​R​​A​​V​​F​​P​​S​​I​​V​36   ​G​​R​​P​​R​​H​​Q​​G​​V​​M​​V​46   ​G​​M​​G​​Q​​K​​D​​S​​Y​​V​​G​56   ​D​​E​​A​​Q​​S​​K​​R​​G​​I​​L​66   ​T​​L​​K​​Y​​P​​I​​E​​G​​I​​I​77   ​T​​N​​W​​D​​D​​M​​E​​K​​I​​W​87   ​H​​H​​T​​F​​Y​​N​​E​​L​​R​​V​97   ​A​​P​​E​​E​​H​​P​​T​​L​​L​​T​107  ​E​​A​​P​​L​​N​​P​​K​​A​​N​​R​117  ​E​​K​​M​​T​​Q​​I​​M​​F​​E​​T​127  ​F​​N​​V​​P​​A​​M​​Y​​V​​A​​I​137  ​Q​​A​​V​​L​​S​​L​​Y​​A​​S​​G​147  ​R​​T​​T​​G​​I​​V​​L​​D​​S​​G​157  ​D​​G​​V​​T​​H​​N​​V​​P​​I​​Y​167  ​E​​G​​Y​​A​​L​​P​​H​​A​​I​​M​177  ​R​​L​​D​​L​​A​​G​​R​​D​​L​​T​187  ​D​​Y​​L​​M​​K​​I​​L​​T​​E​​R​197  ​G​​Y​​S​​F​​V​​T​​T​​A​​E​​R​207  ​E​​I​​V​​R​​D​​I​​K​​E​​K​​L​217  ​C​​Y​​V​​A​​L​​D​​F​​E​​N​​E​227  ​M​​A​​T​​A​​A​​S​​S​​S​​S​​L​237  ​E​​K​​S​​Y​​E​​L​​P​​D​​G​​Q​247  ​V​​I​​T​​I​​G​​N​​E​​R​​F​​R​257  ​C​​P​​E​​T​​L​​F​​Q​​P​​S​​F​267  ​I​​G​​M​​E​​S​​A​​G​​I​​H​​E​277  ​T​​T​​Y​​N​​S​​I​​M​​K​​C​​D​287  ​I​​D​​I​​R​​K​​D​​L​​Y​​A​​N​297  ​N​​V​​M​​S​​G​​G​​T​​T​​M​​Y​307  ​P​​G​​I​​A​​D​​R​​M​​Q​​K​​E​317  ​I​​T​​A​​L​​A​​P​​S​​T​​M​​K​327  ​I​​K​​I​​I​​A​​P​​P​​E​​R​​K​337  ​Y​​S​​V​​W​​I​​G​​G​​S​​I​​L​347  ​A​​S​​L​​S​​T​​F​​Q​​Q​​M​​W​357  ​I​​T​​K​​Q​​E​​Y​​D​​E​​A​​G​367  ​P​​S​​I​​V​​H​​R​​K​​C​​F​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.39 .. 1.47
0.39
1.47
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
6
THR
1.02
2
7
ALA
1.08
3
8
LEU
1.11
4
9
VAL
1.16
5
10
CYS
1.20
6
11
ASP
1.20
7
12
ASN
1.21
8
13
GLY
1.09
9
14
SER
1.06
10
15
GLY
1.06
11
16
LEU
1.07
12
17
VAL
1.11
13
18
LYS
1.09
14
19
ALA
1.01
15
20
GLY
0.97
16
21
PHE
1.03
17
22
ALA
0.96
18
23
GLY
1.00
19
24
ASP
0.97
20
25
ASP
1.00
21
26
ALA
0.95
22
27
PRO
0.82
23
28
ARG
0.78
24
29
ALA
0.71
25
30
VAL
0.74
26
31
PHE
0.74
27
32
PRO
0.87
28
33
SER
0.87
29
34
ILE
0.91
30
35
VAL
0.91
31
36
GLY
0.88
32
37
ARG
0.78
Sequence of
6    ​T​​A​​L​​V​​C​​D​​N​​G​​S​​G​16   ​L​​V​​K​​A​​G​​F​​A​​G​​D​​D​26   ​A​​P​​R​​A​​V​​F​​P​​S​​I​​V​36   ​G​​R​​P​​R​​H​​Q​​G​​V​​M​​V​46   ​G​​M​​G​​Q​​K​​D​​S​​Y​​V​​G​56   ​D​​E​​A​​Q​​S​​K​​R​​G​​I​​L​66   ​T​​L​​K​​Y​​P​​I​​E​​G​​I​​I​77   ​T​​N​​W​​D​​D​​M​​E​​K​​I​​W​87   ​H​​H​​T​​F​​Y​​N​​E​​L​​R​​V​97   ​A​​P​​E​​E​​H​​P​​T​​L​​L​​T​107  ​E​​A​​P​​L​​N​​P​​K​​A​​N​​R​117  ​E​​K​​M​​T​​Q​​I​​M​​F​​E​​T​127  ​F​​N​​V​​P​​A​​M​​Y​​V​​A​​I​137  ​Q​​A​​V​​L​​S​​L​​Y​​A​​S​​G​147  ​R​​T​​T​​G​​I​​V​​L​​D​​S​​G​157  ​D​​G​​V​​T​​H​​N​​V​​P​​I​​Y​167  ​E​​G​​Y​​A​​L​​P​​H​​A​​I​​M​177  ​R​​L​​D​​L​​A​​G​​R​​D​​L​​T​187  ​D​​Y​​L​​M​​K​​I​​L​​T​​E​​R​197  ​G​​Y​​S​​F​​V​​T​​T​​A​​E​​R​207  ​E​​I​​V​​R​​D​​I​​K​​E​​K​​L​217  ​C​​Y​​V​​A​​L​​D​​F​​E​​N​​E​227  ​M​​A​​T​​A​​A​​S​​S​​S​​S​​L​237  ​E​​K​​S​​Y​​E​​L​​P​​D​​G​​Q​247  ​V​​I​​T​​I​​G​​N​​E​​R​​F​​R​257  ​C​​P​​E​​T​​L​​F​​Q​​P​​S​​F​267  ​I​​G​​M​​E​​S​​A​​G​​I​​H​​E​277  ​T​​T​​Y​​N​​S​​I​​M​​K​​C​​D​287  ​I​​D​​I​​R​​K​​D​​L​​Y​​A​​N​297  ​N​​V​​M​​S​​G​​G​​T​​T​​M​​Y​307  ​P​​G​​I​​A​​D​​R​​M​​Q​​K​​E​317  ​I​​T​​A​​L​​A​​P​​S​​T​​M​​K​327  ​I​​K​​I​​I​​A​​P​​P​​E​​R​​K​337  ​Y​​S​​V​​W​​I​​G​​G​​S​​I​​L​347  ​A​​S​​L​​S​​T​​F​​Q​​Q​​M​​W​357  ​I​​T​​K​​Q​​E​​Y​​D​​E​​A​​G​367  ​P​​S​​I​​V​​H​​R​​K​​C​​F​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.23 .. 0.94
-0.23
0.94
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
6
THR
0.45
2
7
ALA
0.47
3
8
LEU
0.52
4
9
VAL
0.58
5
10
CYS
0.61
6
11
ASP
0.62
7
12
ASN
0.63
8
13
GLY
0.60
9
14
SER
0.59
10
15
GLY
0.58
11
16
LEU
0.61
12
17
VAL
0.68
13
18
LYS
0.63
14
19
ALA
0.58
15
20
GLY
0.55
16
21
PHE
0.57
17
22
ALA
0.60
18
23
GLY
0.62
19
24
ASP
0.61
20
25
ASP
0.62
21
26
ALA
0.60
22
27
PRO
0.55
23
28
ARG
0.50
24
29
ALA
0.44
25
30
VAL
0.41
26
31
PHE
0.37
27
32
PRO
0.36
28
33
SER
0.33
29
34
ILE
0.30
30
35
VAL
0.25
31
36
GLY
0.18
32
37
ARG
0.15
Converting to mmCIF
SequenceNo structure available
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 1.09 .. 2.92
1.09
2.92
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
6
THR
1.75
2
7
ALA
1.83
3
8
LEU
2.04
4
9
VAL
2.12
5
10
CYS
2.30
6
11
ASP
2.42
7
12
ASN
2.47
8
13
GLY
2.34
9
14
SER
2.31
10
15
GLY
2.32
11
16
LEU
2.39
12
17
VAL
2.52
13
18
LYS
2.55
14
19
ALA
2.38
15
20
GLY
2.45
16
21
PHE
2.66
17
22
ALA
2.65
18
23
GLY
2.62
19
24
ASP
2.61
20
25
ASP
2.67
21
26
ALA
2.59
22
27
PRO
2.42
23
28
ARG
2.30
24
29
ALA
2.12
25
30
VAL
1.95
26
31
PHE
1.86
27
32
PRO
2.00
28
33
SER
2.01
29
34
ILE
2.07
30
35
VAL
1.99
31
36
GLY
1.84
32
37
ARG
1.63