42788 8UXX P v1-2
Structure title Arp2/3 branch junction complex, BeFx state
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 3.2 Å
Source organism Oryctolagus cuniculus

Sequence of
6    ​T​​A​​L​​V​​C​​D​​N​​G​​S​​G​16   ​L​​V​​K​​A​​G​​F​​A​​G​​D​​D​26   ​A​​P​​R​​A​​V​​F​​P​​S​​I​​V​36   ​G​​R​​P​​R​​H​​Q​​G​​V​​M​​V​46   ​G​​M​​G​​Q​​K​​D​​S​​Y​​V​​G​56   ​D​​E​​A​​Q​​S​​K​​R​​G​​I​​L​66   ​T​​L​​K​​Y​​P​​I​​E​​G​​I​​I​77   ​T​​N​​W​​D​​D​​M​​E​​K​​I​​W​87   ​H​​H​​T​​F​​Y​​N​​E​​L​​R​​V​97   ​A​​P​​E​​E​​H​​P​​T​​L​​L​​T​107  ​E​​A​​P​​L​​N​​P​​K​​A​​N​​R​117  ​E​​K​​M​​T​​Q​​I​​M​​F​​E​​T​127  ​F​​N​​V​​P​​A​​M​​Y​​V​​A​​I​137  ​Q​​A​​V​​L​​S​​L​​Y​​A​​S​​G​147  ​R​​T​​T​​G​​I​​V​​L​​D​​S​​G​157  ​D​​G​​V​​T​​H​​N​​V​​P​​I​​Y​167  ​E​​G​​Y​​A​​L​​P​​H​​A​​I​​M​177  ​R​​L​​D​​L​​A​​G​​R​​D​​L​​T​187  ​D​​Y​​L​​M​​K​​I​​L​​T​​E​​R​197  ​G​​Y​​S​​F​​V​​T​​T​​A​​E​​R​207  ​E​​I​​V​​R​​D​​I​​K​​E​​K​​L​217  ​C​​Y​​V​​A​​L​​D​​F​​E​​N​​E​227  ​M​​A​​T​​A​​A​​S​​S​​S​​S​​L​237  ​E​​K​​S​​Y​​E​​L​​P​​D​​G​​Q​247  ​V​​I​​T​​I​​G​​N​​E​​R​​F​​R​257  ​C​​P​​E​​T​​L​​F​​Q​​P​​S​​F​267  ​I​​G​​M​​E​​S​​A​​G​​I​​H​​E​277  ​T​​T​​Y​​N​​S​​I​​M​​K​​C​​D​287  ​I​​D​​I​​R​​K​​D​​L​​Y​​A​​N​297  ​N​​V​​M​​S​​G​​G​​T​​T​​M​​Y​307  ​P​​G​​I​​A​​D​​R​​M​​Q​​K​​E​317  ​I​​T​​A​​L​​A​​P​​S​​T​​M​​K​327  ​I​​K​​I​​I​​A​​P​​P​​E​​R​​K​337  ​Y​​S​​V​​W​​I​​G​​G​​S​​I​​L​347  ​A​​S​​L​​S​​T​​F​​Q​​Q​​M​​W​357  ​I​​T​​K​​Q​​E​​Y​​D​​E​​A​​G​367  ​P​​S​​I​​V​​H​​R​​K​​C​​F​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.49 .. 1.53
0.49
1.53
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
6
THR
0.68
2
7
ALA
0.62
3
8
LEU
0.66
4
9
VAL
0.52
5
10
CYS
0.55
6
11
ASP
0.49
7
12
ASN
0.56
8
13
GLY
0.64
9
14
SER
0.70
10
15
GLY
0.72
11
16
LEU
0.75
12
17
VAL
0.68
13
18
LYS
0.71
14
19
ALA
0.68
15
20
GLY
0.82
16
21
PHE
0.88
17
22
ALA
1.05
18
23
GLY
1.12
19
24
ASP
1.03
20
25
ASP
0.96
21
26
ALA
1.07
22
27
PRO
1.13
23
28
ARG
1.31
24
29
ALA
1.40
25
30
VAL
1.46
26
31
PHE
1.40
27
32
PRO
1.27
28
33
SER
1.24
29
34
ILE
1.28
30
35
VAL
1.28
31
36
GLY
1.19
32
37
ARG
1.15
Sequence of
6    ​T​​A​​L​​V​​C​​D​​N​​G​​S​​G​16   ​L​​V​​K​​A​​G​​F​​A​​G​​D​​D​26   ​A​​P​​R​​A​​V​​F​​P​​S​​I​​V​36   ​G​​R​​P​​R​​H​​Q​​G​​V​​M​​V​46   ​G​​M​​G​​Q​​K​​D​​S​​Y​​V​​G​56   ​D​​E​​A​​Q​​S​​K​​R​​G​​I​​L​66   ​T​​L​​K​​Y​​P​​I​​E​​G​​I​​I​77   ​T​​N​​W​​D​​D​​M​​E​​K​​I​​W​87   ​H​​H​​T​​F​​Y​​N​​E​​L​​R​​V​97   ​A​​P​​E​​E​​H​​P​​T​​L​​L​​T​107  ​E​​A​​P​​L​​N​​P​​K​​A​​N​​R​117  ​E​​K​​M​​T​​Q​​I​​M​​F​​E​​T​127  ​F​​N​​V​​P​​A​​M​​Y​​V​​A​​I​137  ​Q​​A​​V​​L​​S​​L​​Y​​A​​S​​G​147  ​R​​T​​T​​G​​I​​V​​L​​D​​S​​G​157  ​D​​G​​V​​T​​H​​N​​V​​P​​I​​Y​167  ​E​​G​​Y​​A​​L​​P​​H​​A​​I​​M​177  ​R​​L​​D​​L​​A​​G​​R​​D​​L​​T​187  ​D​​Y​​L​​M​​K​​I​​L​​T​​E​​R​197  ​G​​Y​​S​​F​​V​​T​​T​​A​​E​​R​207  ​E​​I​​V​​R​​D​​I​​K​​E​​K​​L​217  ​C​​Y​​V​​A​​L​​D​​F​​E​​N​​E​227  ​M​​A​​T​​A​​A​​S​​S​​S​​S​​L​237  ​E​​K​​S​​Y​​E​​L​​P​​D​​G​​Q​247  ​V​​I​​T​​I​​G​​N​​E​​R​​F​​R​257  ​C​​P​​E​​T​​L​​F​​Q​​P​​S​​F​267  ​I​​G​​M​​E​​S​​A​​G​​I​​H​​E​277  ​T​​T​​Y​​N​​S​​I​​M​​K​​C​​D​287  ​I​​D​​I​​R​​K​​D​​L​​Y​​A​​N​297  ​N​​V​​M​​S​​G​​G​​T​​T​​M​​Y​307  ​P​​G​​I​​A​​D​​R​​M​​Q​​K​​E​317  ​I​​T​​A​​L​​A​​P​​S​​T​​M​​K​327  ​I​​K​​I​​I​​A​​P​​P​​E​​R​​K​337  ​Y​​S​​V​​W​​I​​G​​G​​S​​I​​L​347  ​A​​S​​L​​S​​T​​F​​Q​​Q​​M​​W​357  ​I​​T​​K​​Q​​E​​Y​​D​​E​​A​​G​367  ​P​​S​​I​​V​​H​​R​​K​​C​​F​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.40 .. 1.59
0.40
1.59
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
6
THR
0.50
2
7
ALA
0.63
3
8
LEU
0.71
4
9
VAL
0.82
5
10
CYS
0.82
6
11
ASP
0.85
7
12
ASN
0.91
8
13
GLY
0.91
9
14
SER
0.92
10
15
GLY
0.94
11
16
LEU
1.02
12
17
VAL
1.00
13
18
LYS
1.00
14
19
ALA
1.17
15
20
GLY
1.23
16
21
PHE
1.23
17
22
ALA
1.24
18
23
GLY
1.24
19
24
ASP
1.29
20
25
ASP
1.34
21
26
ALA
1.33
22
27
PRO
1.28
23
28
ARG
1.27
24
29
ALA
1.24
25
30
VAL
1.27
26
31
PHE
1.23
27
32
PRO
1.20
28
33
SER
1.22
29
34
ILE
1.12
30
35
VAL
1.04
31
36
GLY
1.08
32
37
ARG
1.05
Sequence of
6    ​T​​A​​L​​V​​C​​D​​N​​G​​S​​G​16   ​L​​V​​K​​A​​G​​F​​A​​G​​D​​D​26   ​A​​P​​R​​A​​V​​F​​P​​S​​I​​V​36   ​G​​R​​P​​R​​H​​Q​​G​​V​​M​​V​46   ​G​​M​​G​​Q​​K​​D​​S​​Y​​V​​G​56   ​D​​E​​A​​Q​​S​​K​​R​​G​​I​​L​66   ​T​​L​​K​​Y​​P​​I​​E​​G​​I​​I​77   ​T​​N​​W​​D​​D​​M​​E​​K​​I​​W​87   ​H​​H​​T​​F​​Y​​N​​E​​L​​R​​V​97   ​A​​P​​E​​E​​H​​P​​T​​L​​L​​T​107  ​E​​A​​P​​L​​N​​P​​K​​A​​N​​R​117  ​E​​K​​M​​T​​Q​​I​​M​​F​​E​​T​127  ​F​​N​​V​​P​​A​​M​​Y​​V​​A​​I​137  ​Q​​A​​V​​L​​S​​L​​Y​​A​​S​​G​147  ​R​​T​​T​​G​​I​​V​​L​​D​​S​​G​157  ​D​​G​​V​​T​​H​​N​​V​​P​​I​​Y​167  ​E​​G​​Y​​A​​L​​P​​H​​A​​I​​M​177  ​R​​L​​D​​L​​A​​G​​R​​D​​L​​T​187  ​D​​Y​​L​​M​​K​​I​​L​​T​​E​​R​197  ​G​​Y​​S​​F​​V​​T​​T​​A​​E​​R​207  ​E​​I​​V​​R​​D​​I​​K​​E​​K​​L​217  ​C​​Y​​V​​A​​L​​D​​F​​E​​N​​E​227  ​M​​A​​T​​A​​A​​S​​S​​S​​S​​L​237  ​E​​K​​S​​Y​​E​​L​​P​​D​​G​​Q​247  ​V​​I​​T​​I​​G​​N​​E​​R​​F​​R​257  ​C​​P​​E​​T​​L​​F​​Q​​P​​S​​F​267  ​I​​G​​M​​E​​S​​A​​G​​I​​H​​E​277  ​T​​T​​Y​​N​​S​​I​​M​​K​​C​​D​287  ​I​​D​​I​​R​​K​​D​​L​​Y​​A​​N​297  ​N​​V​​M​​S​​G​​G​​T​​T​​M​​Y​307  ​P​​G​​I​​A​​D​​R​​M​​Q​​K​​E​317  ​I​​T​​A​​L​​A​​P​​S​​T​​M​​K​327  ​I​​K​​I​​I​​A​​P​​P​​E​​R​​K​337  ​Y​​S​​V​​W​​I​​G​​G​​S​​I​​L​347  ​A​​S​​L​​S​​T​​F​​Q​​Q​​M​​W​357  ​I​​T​​K​​Q​​E​​Y​​D​​E​​A​​G​367  ​P​​S​​I​​V​​H​​R​​K​​C​​F​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.35 .. 0.91
-0.35
0.91
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
6
THR
0.74
2
7
ALA
0.73
3
8
LEU
0.78
4
9
VAL
0.82
5
10
CYS
0.85
6
11
ASP
0.87
7
12
ASN
0.88
8
13
GLY
0.84
9
14
SER
0.83
10
15
GLY
0.82
11
16
LEU
0.86
12
17
VAL
0.87
13
18
LYS
0.83
14
19
ALA
0.79
15
20
GLY
0.77
16
21
PHE
0.74
17
22
ALA
0.75
18
23
GLY
0.74
19
24
ASP
0.70
20
25
ASP
0.68
21
26
ALA
0.66
22
27
PRO
0.61
23
28
ARG
0.55
24
29
ALA
0.50
25
30
VAL
0.45
26
31
PHE
0.41
27
32
PRO
0.39
28
33
SER
0.35
29
34
ILE
0.32
30
35
VAL
0.22
31
36
GLY
0.14
32
37
ARG
0.11
Converting to mmCIF
SequenceNo structure available
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.92 .. 3.49
0.92
3.49
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
6
THR
1.92
2
7
ALA
1.97
3
8
LEU
2.15
4
9
VAL
2.16
5
10
CYS
2.21
6
11
ASP
2.21
7
12
ASN
2.35
8
13
GLY
2.39
9
14
SER
2.45
10
15
GLY
2.48
11
16
LEU
2.63
12
17
VAL
2.55
13
18
LYS
2.54
14
19
ALA
2.63
15
20
GLY
2.82
16
21
PHE
2.85
17
22
ALA
3.04
18
23
GLY
3.10
19
24
ASP
3.02
20
25
ASP
2.98
21
26
ALA
3.06
22
27
PRO
3.03
23
28
ARG
3.12
24
29
ALA
3.14
25
30
VAL
3.19
26
31
PHE
3.04
27
32
PRO
2.86
28
33
SER
2.82
29
34
ILE
2.71
30
35
VAL
2.55
31
36
GLY
2.42
32
37
ARG
2.30