4340 6G1S A v1-4
Structure title CryoEM structure of the MDA5-dsRNA filament with 87-degree helical twist
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 3.93 Å
Source organism Mus musculus

Converting to mmCIF
SequenceNo structure available
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.30 .. 1.20
-0.30
1.20
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
310
ARG
0.32
2
311
PRO
0.35
3
312
TYR
0.30
4
313
GLN
0.34
5
314
MET
0.39
6
315
GLU
0.44
7
316
VAL
0.46
8
317
ALA
0.43
9
318
GLN
0.49
10
319
PRO
0.55
11
320
ALA
0.56
12
321
LEU
0.58
13
322
ASP
0.68
14
323
GLY
0.66
15
324
LYS
0.69
16
325
ASN
0.63
17
326
ILE
0.68
18
327
ILE
0.50
19
328
ILE
0.51
20
329
CYS
0.47
21
330
LEU
0.46
22
331
PRO
0.50
23
332
THR
0.51
24
333
GLY
0.56
25
334
SER
0.53
26
335
GLY
0.49
27
336
LYS
0.51
28
337
THR
0.51
29
338
ARG
0.45
30
339
VAL
0.47
31
340
ALA
0.52
32
341
VAL
0.43
Converting to mmCIF
SequenceNo structure available
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.21 .. 1.09
-0.21
1.09
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
310
ARG
0.83
2
311
PRO
0.85
3
312
TYR
0.86
4
313
GLN
0.85
5
314
MET
0.73
6
315
GLU
0.77
7
316
VAL
0.77
8
317
ALA
0.79
9
318
GLN
0.83
10
319
PRO
0.85
11
320
ALA
0.79
12
321
LEU
0.77
13
322
ASP
0.78
14
323
GLY
0.82
15
324
LYS
0.81
16
325
ASN
0.81
17
326
ILE
0.75
18
327
ILE
0.77
19
328
ILE
0.80
20
329
CYS
0.84
21
330
LEU
0.84
22
331
PRO
0.83
23
332
THR
0.86
24
333
GLY
0.98
25
334
SER
0.97
26
335
GLY
0.97
27
336
LYS
0.99
28
337
THR
0.87
29
338
ARG
0.86
30
339
VAL
0.86
31
340
ALA
0.85
32
341
VAL
0.80
Sequence of
310  ​R​​P​​Y​​Q​​M​​E​​V​​A​​Q​​P​320  ​A​​L​​D​​G​​K​​N​​I​​I​​I​​C​330  ​L​​P​​T​​G​​S​​G​​K​​T​​R​​V​340  ​A​​V​​Y​​I​​T​​K​​D​​H​​L​​D​350  ​K​​K​​K​​Q​​A​​S​​E​​S​​G​​K​360  ​V​​I​​V​​L​​V​​N​​K​​V​​M​​L​370  ​A​​E​​Q​​L​​F​​R​​K​​E​​F​​N​380  ​P​​Y​​L​​K​​K​​W​​Y​​R​​I​​I​390  ​G​​L​​S​​G​​D​​T​​Q​​L​​K​​I​400  ​S​​F​​P​​E​​V​​V​​K​​S​​Y​​D​410  ​V​​I​​I​​S​​T​​A​​Q​​I​​L​​E​420  ​N​​S​​L​​L​​N​​L​​E​​S​​G​​D​430  ​D​​D​​G​​V​​Q​​L​​S​​D​​F​​S​440  ​L​​I​​I​​I​​D​​E​​C​​H​​H​​T​450  ​N​​K​​E​​A​​V​​Y​​N​​N​​I​​M​460  ​R​​R​​Y​​L​​K​​Q​​K​​L​​R​​N​470  ​N​​D​​L​​K​​A​​I​​P​​L​​P​​Q​485  ​I​​L​​G​​L​​T​​A​​S​​P​​G​​V​495  ​G​​A​​A​​K​​K​​Q​​S​​E​​A​​E​505  ​K​​H​​I​​L​​N​​I​​C​​A​​N​​L​515  ​D​​A​​F​​T​​I​​K​​T​​V​​K​​E​525  ​N​​L​​G​​Q​​L​​K​​H​​Q​​I​​K​535  ​E​​P​​C​​K​​K​​F​​V​​I​​A​​N​550  ​P​​F​​K​​E​​K​​L​​L​​E​​I​​M​560  ​A​​S​​I​​Q​​T​​Y​​C​​Q​​K​​S​570  ​P​​M​​S​​D​​F​​G​​T​​Q​​H​​Y​580  ​E​​Q​​W​​A​​I​​Q​​M​​E​​K​​K​590  ​A​​A​​K​​D​​G​​N​​R​​K​​D​​R​600  ​V​​C​​A​​E​​H​​L​​R​​K​​Y​​N​610  ​E​​A​​L​​Q​​I​​N​​D​​T​​I​​R​620  ​M​​I​​D​​A​​Y​​S​​H​​L​​E​​T​630  ​F​​Y​​T​​D​​E​​K​​E​​K​​K​​F​640  ​A​​V​​L​​N​​D​​E​​T​​D​​E​​F​676  ​L​​M​​N​​L​​F​​F​​D​​N​​K​​K​686  ​M​​L​​K​​K​​L​​A​​E​​N​​P​​K​699  ​E​​K​​L​​I​​K​​L​​R​​N​​T​​I​709  ​L​​E​​Q​​F​​T​​R​​S​​S​​R​​G​722  ​I​​I​​F​​T​​K​​T​​R​​Q​​S​​T​732  ​Y​​A​​L​​S​​Q​​W​​I​​M​​E​​N​742  ​A​​K​​V​​K​​A​​H​​H​​L​​I​​G​757  ​A​​G​​H​​S​​S​​E​​V​​K​​P​​M​767  ​T​​Q​​T​​E​​Q​​K​​E​​V​​I​​S​777  ​K​​F​​R​​T​​I​​N​​L​​L​​I​​A​789  ​T​​T​​V​​A​​G​​L​​D​​I​​K​​E​801  ​C​​N​​I​​V​​I​​R​​Y​​G​​L​​V​811  ​T​​N​​E​​I​​A​​M​​V​​Q​​A​​R​821  ​G​​R​​A​​R​​A​​D​​E​​S​​T​​Y​831  ​V​​L​​V​​T​​S​​S​​G​​V​​T​​E​843  ​R​​E​​I​​V​​N​​D​​F​​R​​E​​K​853  ​M​​M​​Y​​K​​A​​I​​N​​R​​V​​Q​863  ​N​​M​​K​​P​​E​​E​​Y​​A​​H​​K​873  ​I​​L​​E​​L​​Q​​V​​Q​​S​​I​​L​883  ​E​​K​​K​​M​​K​​V​​K​​R​​S​​I​893  ​A​​K​​Q​​Y​​N​​D​​N​​P​​S​​L​903  ​I​​T​​L​​L​​C​​K​​N​​C​​S​​M​913  ​L​​V​​C​​S​​G​​E​​N​​I​​H​​V​923  ​I​​E​​K​​M​​H​​H​​V​​N​​M​​T​933  ​P​​E​​F​​K​​G​​L​​Y​​I​​V​​R​943  ​E​​N​​K​​T​​N​​G​​E​​I​​I​​C​963  ​K​​C​​G​​Q​​A​​W​​G​​T​​M​​M​973  ​V​​H​​K​​G​​L​​D​​L​​P​​C​​L​983  ​K​​I​​R​​N​​F​​V​​V​​N​​F​​S​996  ​P​​K​​K​​Q​​Y​​K​​K​​W​​V​​E​1006 ​L​​P​​I​​R​​F​​P​​D​​L​​D​​Y​1016 ​S​​E​​Y​​C​​L​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -1.33 .. 0.97
-1.33
0.97
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
310
ARG
0.46
2
311
PRO
0.43
3
312
TYR
0.34
4
313
GLN
0.33
5
314
MET
0.36
6
315
GLU
0.39
7
316
VAL
0.40
8
317
ALA
0.47
9
318
GLN
0.54
10
319
PRO
0.61
11
320
ALA
0.68
12
321
LEU
0.68
13
322
ASP
0.69
14
323
GLY
0.69
15
324
LYS
0.68
16
325
ASN
0.67
17
326
ILE
0.66
18
327
ILE
0.63
19
328
ILE
0.63
20
329
CYS
0.65
21
330
LEU
0.68
22
331
PRO
0.75
23
332
THR
0.78
24
333
GLY
0.78
25
334
SER
0.77
26
335
GLY
0.78
27
336
LYS
0.74
28
337
THR
0.67
29
338
ARG
0.61
30
339
VAL
0.56
31
340
ALA
0.58
32
341
VAL
0.58
SequenceNo structure available
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -1.14 .. 2.48
-1.14
2.48
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
310
ARG
1.61
2
311
PRO
1.63
3
312
TYR
1.49
4
313
GLN
1.52
5
314
MET
1.48
6
315
GLU
1.60
7
316
VAL
1.62
8
317
ALA
1.69
9
318
GLN
1.87
10
319
PRO
2.01
11
320
ALA
2.04
12
321
LEU
2.03
13
322
ASP
2.15
14
323
GLY
2.17
15
324
LYS
2.19
16
325
ASN
2.11
17
326
ILE
2.10
18
327
ILE
1.90
19
328
ILE
1.94
20
329
CYS
1.96
21
330
LEU
1.98
22
331
PRO
2.08
23
332
THR
2.15
24
333
GLY
2.32
25
334
SER
2.28
26
335
GLY
2.25
27
336
LYS
2.24
28
337
THR
2.05
29
338
ARG
1.92
30
339
VAL
1.89
31
340
ALA
1.95
32
341
VAL
1.80