4810 6RD9 4 v1-4
Structure title CryoEM structure of Polytomella F-ATP synthase, Primary rotary state 1, composite map
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 3.0 Å
Source organism Polytomella sp. Pringsheim 198.80

Sequence of
5    ​A​​V​​S​​K​​K​​E​​V​​L​​Y​​F​15   ​L​​S​​S​​K​​D​​A​​E​​S​​S​​T​25   ​A​​V​​K​​S​​Y​​L​​K​​S​​L​​Y​35   ​A​​G​​A​​Q​​V​​E​​A​​T​​E​​T​45   ​D​​A​​S​​E​​L​​I​​A​​Q​​L​​E​55   ​K​​K​​Y​​L​​S​​A​​Q​​V​​V​​E​65   ​P​​G​​V​​H​​N​​I​​A​​L​​P​​L​75   ​G​​E​​S​​G​​S​​A​​P​​V​​K​​R​85   ​Y​​A​​A​​E​​L​​F​​N​​L​​G​​A​95   ​Q​​A​​G​​F​​E​​C​​P​​F​​I​​E​105  ​V​​S​​K​​K​​F​​G​​Q​​E​​T​​A​115  ​T​​S​​E​​T​​V​​K​​D​​V​​L​​N​125  ​K​​T​​K​​S​​Y​​V​​S​​A​​D​​Y​135  ​N​​A​​A​​L​​N​​E​​V​​L​​S​​S​145  ​V​​E​​A​​E​​I​​N​​G​​P​​V​​L​155  ​F​​D​​G​​K​​T​​E​​G​​F​​K​​K​165  ​F​​A​​A​​K​​A​​K​​A​​V​​A​​V​175  ​S​​R​​G​​L​​P​​A​​D​​T​​I​​L​185  ​A​​Y​​C​​A​​G​​S​​A​​N​​E​​D​195  ​A​​A​​D​​K​​V​​S​​K​​E​​F​​F​205  ​T​​W​​F​​E​​S​​A​​Y​​T​​A​​D​215  ​A​​A​​A​​E​​V​​K​​A​​I​​E​​A​225  ​E​​A​​A​​S​​I​​L​​D​​R​​H​​L​235  ​A​​K​​P​​V​​A​​Q​​I​​R​​K​​E​245  ​Q​​A​​S​​A​​Y​​A​​S​​L​​L​​K​255  ​R​​A​​E​​T​​A​​K​​G​​A​​K​​W​265  ​A​​E​​K​​Y​​L​​E​​D​​V​​K​​A​275  ​V​​Q​​W​​F​​D​​A​​S​​V​​A​​E​285  ​A​​P​​A​​S​​G​​P​​K​​V​​A​​A​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.51 .. 1.40
0.51
1.40
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
5
ALA
0.86
2
6
VAL
0.93
3
7
SER
0.95
4
8
LYS
0.95
5
9
LYS
0.95
6
10
GLU
0.93
7
11
VAL
0.87
8
12
LEU
0.87
9
13
TYR
0.85
10
14
PHE
0.84
11
15
LEU
0.90
12
16
SER
0.96
13
17
SER
1.01
14
18
LYS
1.09
15
19
ASP
1.01
16
20
ALA
1.06
17
21
GLU
1.04
18
22
SER
1.06
19
23
SER
0.99
20
24
THR
1.00
21
25
ALA
0.99
22
26
VAL
0.90
23
27
LYS
0.96
24
28
SER
0.92
25
29
TYR
0.91
26
30
LEU
0.98
27
31
LYS
0.98
28
32
SER
0.95
29
33
LEU
0.95
30
34
TYR
0.90
31
35
ALA
0.86
32
36
GLY
0.78
Sequence of
5    ​A​​V​​S​​K​​K​​E​​V​​L​​Y​​F​15   ​L​​S​​S​​K​​D​​A​​E​​S​​S​​T​25   ​A​​V​​K​​S​​Y​​L​​K​​S​​L​​Y​35   ​A​​G​​A​​Q​​V​​E​​A​​T​​E​​T​45   ​D​​A​​S​​E​​L​​I​​A​​Q​​L​​E​55   ​K​​K​​Y​​L​​S​​A​​Q​​V​​V​​E​65   ​P​​G​​V​​H​​N​​I​​A​​L​​P​​L​75   ​G​​E​​S​​G​​S​​A​​P​​V​​K​​R​85   ​Y​​A​​A​​E​​L​​F​​N​​L​​G​​A​95   ​Q​​A​​G​​F​​E​​C​​P​​F​​I​​E​105  ​V​​S​​K​​K​​F​​G​​Q​​E​​T​​A​115  ​T​​S​​E​​T​​V​​K​​D​​V​​L​​N​125  ​K​​T​​K​​S​​Y​​V​​S​​A​​D​​Y​135  ​N​​A​​A​​L​​N​​E​​V​​L​​S​​S​145  ​V​​E​​A​​E​​I​​N​​G​​P​​V​​L​155  ​F​​D​​G​​K​​T​​E​​G​​F​​K​​K​165  ​F​​A​​A​​K​​A​​K​​A​​V​​A​​V​175  ​S​​R​​G​​L​​P​​A​​D​​T​​I​​L​185  ​A​​Y​​C​​A​​G​​S​​A​​N​​E​​D​195  ​A​​A​​D​​K​​V​​S​​K​​E​​F​​F​205  ​T​​W​​F​​E​​S​​A​​Y​​T​​A​​D​215  ​A​​A​​A​​E​​V​​K​​A​​I​​E​​A​225  ​E​​A​​A​​S​​I​​L​​D​​R​​H​​L​235  ​A​​K​​P​​V​​A​​Q​​I​​R​​K​​E​245  ​Q​​A​​S​​A​​Y​​A​​S​​L​​L​​K​255  ​R​​A​​E​​T​​A​​K​​G​​A​​K​​W​265  ​A​​E​​K​​Y​​L​​E​​D​​V​​K​​A​275  ​V​​Q​​W​​F​​D​​A​​S​​V​​A​​E​285  ​A​​P​​A​​S​​G​​P​​K​​V​​A​​A​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.04 .. 1.29
0.04
1.29
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
5
ALA
0.91
2
6
VAL
0.89
3
7
SER
0.90
4
8
LYS
0.89
5
9
LYS
0.83
6
10
GLU
0.86
7
11
VAL
0.85
8
12
LEU
0.84
9
13
TYR
0.82
10
14
PHE
0.69
11
15
LEU
0.71
12
16
SER
0.68
13
17
SER
0.69
14
18
LYS
0.67
15
19
ASP
0.61
16
20
ALA
0.60
17
21
GLU
0.60
18
22
SER
0.61
19
23
SER
0.67
20
24
THR
0.65
21
25
ALA
0.60
22
26
VAL
0.61
23
27
LYS
0.58
24
28
SER
0.62
25
29
TYR
0.55
26
30
LEU
0.56
27
31
LYS
0.59
28
32
SER
0.55
29
33
LEU
0.66
30
34
TYR
0.58
31
35
ALA
0.64
32
36
GLY
0.62
Sequence of
5    ​A​​V​​S​​K​​K​​E​​V​​L​​Y​​F​15   ​L​​S​​S​​K​​D​​A​​E​​S​​S​​T​25   ​A​​V​​K​​S​​Y​​L​​K​​S​​L​​Y​35   ​A​​G​​A​​Q​​V​​E​​A​​T​​E​​T​45   ​D​​A​​S​​E​​L​​I​​A​​Q​​L​​E​55   ​K​​K​​Y​​L​​S​​A​​Q​​V​​V​​E​65   ​P​​G​​V​​H​​N​​I​​A​​L​​P​​L​75   ​G​​E​​S​​G​​S​​A​​P​​V​​K​​R​85   ​Y​​A​​A​​E​​L​​F​​N​​L​​G​​A​95   ​Q​​A​​G​​F​​E​​C​​P​​F​​I​​E​105  ​V​​S​​K​​K​​F​​G​​Q​​E​​T​​A​115  ​T​​S​​E​​T​​V​​K​​D​​V​​L​​N​125  ​K​​T​​K​​S​​Y​​V​​S​​A​​D​​Y​135  ​N​​A​​A​​L​​N​​E​​V​​L​​S​​S​145  ​V​​E​​A​​E​​I​​N​​G​​P​​V​​L​155  ​F​​D​​G​​K​​T​​E​​G​​F​​K​​K​165  ​F​​A​​A​​K​​A​​K​​A​​V​​A​​V​175  ​S​​R​​G​​L​​P​​A​​D​​T​​I​​L​185  ​A​​Y​​C​​A​​G​​S​​A​​N​​E​​D​195  ​A​​A​​D​​K​​V​​S​​K​​E​​F​​F​205  ​T​​W​​F​​E​​S​​A​​Y​​T​​A​​D​215  ​A​​A​​A​​E​​V​​K​​A​​I​​E​​A​225  ​E​​A​​A​​S​​I​​L​​D​​R​​H​​L​235  ​A​​K​​P​​V​​A​​Q​​I​​R​​K​​E​245  ​Q​​A​​S​​A​​Y​​A​​S​​L​​L​​K​255  ​R​​A​​E​​T​​A​​K​​G​​A​​K​​W​265  ​A​​E​​K​​Y​​L​​E​​D​​V​​K​​A​275  ​V​​Q​​W​​F​​D​​A​​S​​V​​A​​E​285  ​A​​P​​A​​S​​G​​P​​K​​V​​A​​A​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.62 .. 0.53
-0.62
0.53
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
5
ALA
0.48
2
6
VAL
0.44
3
7
SER
0.37
4
8
LYS
0.40
5
9
LYS
0.43
6
10
GLU
0.46
7
11
VAL
0.36
8
12
LEU
0.35
9
13
TYR
0.35
10
14
PHE
0.36
11
15
LEU
0.36
12
16
SER
0.35
13
17
SER
0.34
14
18
LYS
0.35
15
19
ASP
0.36
16
20
ALA
0.35
17
21
GLU
0.33
18
22
SER
0.32
19
23
SER
0.32
20
24
THR
0.32
21
25
ALA
0.27
22
26
VAL
0.27
23
27
LYS
0.18
24
28
SER
0.01
25
29
TYR
-0.11
26
30
LEU
-0.08
27
31
LYS
-0.12
28
32
SER
-0.18
29
33
LEU
-0.21
30
34
TYR
-0.25
31
35
ALA
-0.27
32
36
GLY
-0.35
Sequence of
5    ​A​​V​​S​​K​​K​​E​​V​​L​​Y​​F​15   ​L​​S​​S​​K​​D​​A​​E​​S​​S​​T​25   ​A​​V​​K​​S​​Y​​L​​K​​S​​L​​Y​35   ​A​​G​​A​​Q​​V​​E​​A​​T​​E​​T​45   ​D​​A​​S​​E​​L​​I​​A​​Q​​L​​E​55   ​K​​K​​Y​​L​​S​​A​​Q​​V​​V​​E​65   ​P​​G​​V​​H​​N​​I​​A​​L​​P​​L​75   ​G​​E​​S​​G​​S​​A​​P​​V​​K​​R​85   ​Y​​A​​A​​E​​L​​F​​N​​L​​G​​A​95   ​Q​​A​​G​​F​​E​​C​​P​​F​​I​​E​105  ​V​​S​​K​​K​​F​​G​​Q​​E​​T​​A​115  ​T​​S​​E​​T​​V​​K​​D​​V​​L​​N​125  ​K​​T​​K​​S​​Y​​V​​S​​A​​D​​Y​135  ​N​​A​​A​​L​​N​​E​​V​​L​​S​​S​145  ​V​​E​​A​​E​​I​​N​​G​​P​​V​​L​155  ​F​​D​​G​​K​​T​​E​​G​​F​​K​​K​165  ​F​​A​​A​​K​​A​​K​​A​​V​​A​​V​175  ​S​​R​​G​​L​​P​​A​​D​​T​​I​​L​185  ​A​​Y​​C​​A​​G​​S​​A​​N​​E​​D​195  ​A​​A​​D​​K​​V​​S​​K​​E​​F​​F​205  ​T​​W​​F​​E​​S​​A​​Y​​T​​A​​D​215  ​A​​A​​A​​E​​V​​K​​A​​I​​E​​A​225  ​E​​A​​A​​S​​I​​L​​D​​R​​H​​L​235  ​A​​K​​P​​V​​A​​Q​​I​​R​​K​​E​245  ​Q​​A​​S​​A​​Y​​A​​S​​L​​L​​K​255  ​R​​A​​E​​T​​A​​K​​G​​A​​K​​W​265  ​A​​E​​K​​Y​​L​​E​​D​​V​​K​​A​275  ​V​​Q​​W​​F​​D​​A​​S​​V​​A​​E​285  ​A​​P​​A​​S​​G​​P​​K​​V​​A​​A​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.57 .. 3.07
0.57
3.07
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
5
ALA
2.25
2
6
VAL
2.25
3
7
SER
2.22
4
8
LYS
2.23
5
9
LYS
2.21
6
10
GLU
2.25
7
11
VAL
2.08
8
12
LEU
2.06
9
13
TYR
2.03
10
14
PHE
1.89
11
15
LEU
1.96
12
16
SER
1.99
13
17
SER
2.04
14
18
LYS
2.11
15
19
ASP
1.97
16
20
ALA
2.01
17
21
GLU
1.98
18
22
SER
2.00
19
23
SER
1.97
20
24
THR
1.97
21
25
ALA
1.86
22
26
VAL
1.78
23
27
LYS
1.72
24
28
SER
1.55
25
29
TYR
1.35
26
30
LEU
1.45
27
31
LYS
1.44
28
32
SER
1.32
29
33
LEU
1.39
30
34
TYR
1.22
31
35
ALA
1.23
32
36
GLY
1.05