4810 6RD9 S v1-4
Structure title CryoEM structure of Polytomella F-ATP synthase, Primary rotary state 1, composite map
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 3.0 Å
Source organism Polytomella sp. Pringsheim 198.80

Sequence of
39   ​S​​N​​Q​​A​​V​​K​​Q​​R​​I​​R​49   ​A​​I​​K​​N​​I​​G​​K​​I​​T​​K​59   ​A​​M​​K​​M​​V​​A​​A​​S​​K​​M​69   ​K​​N​​A​​Q​​I​​A​​V​​E​​Q​​S​79   ​R​​G​​L​​V​​D​​P​​F​​V​​R​​L​89   ​F​​G​​D​​F​​P​​A​​V​​N​​S​​N​99   ​K​​S​​V​​V​​V​​A​​V​​T​​S​​D​109  ​K​​G​​L​​C​​G​​G​​L​​N​​S​​N​119  ​I​​T​​K​​Y​​T​​R​​A​​T​​L​​A​129  ​T​​T​​E​​S​​E​​G​​K​​D​​V​​V​139  ​V​​V​​S​​I​​G​​D​​K​​G​​R​​S​149  ​Q​​L​​T​​R​​I​​E​​S​​Q​​R​​Y​159  ​Q​​L​​A​​I​​A​​D​​T​​Y​​K​​V​169  ​R​​V​​T​​F​​G​​Q​​A​​S​​L​​I​179  ​V​​E​​E​​L​​I​​K​​H​​N​​P​​Q​189  ​S​​Y​​Q​​I​​L​​F​​N​​K​​F​​R​199  ​S​​A​​I​​S​​F​​K​​P​​T​​V​​A​209  ​T​​I​​L​​S​​P​​D​​L​​L​​E​​K​219  ​Q​​L​​E​​D​​V​​T​​G​​N​​S​​L​229  ​D​​A​​Y​​D​​I​​E​​A​​S​​H​​E​239  ​R​​S​​D​​V​​L​​R​​D​​L​​T​​E​249  ​F​​H​​L​​G​​V​​T​​L​​Y​​N​​A​259  ​M​​L​​E​​N​​N​​C​​S​​E​​H​​A​269  ​S​​R​​M​​S​​A​​M​​E​​N​​S​​T​279  ​K​​S​​A​​G​​E​​M​​L​​G​​K​​L​289  ​T​​L​​D​​Y​​N​​R​​K​​R​​Q​​A​299  ​T​​I​​T​​T​​E​​L​​I​​E​​I​​I​309  ​A​​G​​A​​S​​A​​L​​M​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.11 .. 1.37
0.11
1.37
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
39
SER
0.75
2
40
ASN
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3
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GLN
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4
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ALA
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5
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VAL
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6
44
LYS
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7
45
GLN
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8
46
ARG
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9
47
ILE
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10
48
ARG
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11
49
ALA
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50
ILE
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14
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ASN
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15
53
ILE
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16
54
GLY
0.79
17
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LYS
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18
56
ILE
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THR
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58
LYS
0.84
21
59
ALA
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22
60
MET
0.76
23
61
LYS
0.77
24
62
MET
0.81
25
63
VAL
0.88
26
64
ALA
0.89
27
65
ALA
0.86
28
66
SER
0.92
29
67
LYS
0.93
30
68
MET
0.79
31
69
LYS
0.68
32
70
ASN
0.68
Sequence of
39   ​S​​N​​Q​​A​​V​​K​​Q​​R​​I​​R​49   ​A​​I​​K​​N​​I​​G​​K​​I​​T​​K​59   ​A​​M​​K​​M​​V​​A​​A​​S​​K​​M​69   ​K​​N​​A​​Q​​I​​A​​V​​E​​Q​​S​79   ​R​​G​​L​​V​​D​​P​​F​​V​​R​​L​89   ​F​​G​​D​​F​​P​​A​​V​​N​​S​​N​99   ​K​​S​​V​​V​​V​​A​​V​​T​​S​​D​109  ​K​​G​​L​​C​​G​​G​​L​​N​​S​​N​119  ​I​​T​​K​​Y​​T​​R​​A​​T​​L​​A​129  ​T​​T​​E​​S​​E​​G​​K​​D​​V​​V​139  ​V​​V​​S​​I​​G​​D​​K​​G​​R​​S​149  ​Q​​L​​T​​R​​I​​E​​S​​Q​​R​​Y​159  ​Q​​L​​A​​I​​A​​D​​T​​Y​​K​​V​169  ​R​​V​​T​​F​​G​​Q​​A​​S​​L​​I​179  ​V​​E​​E​​L​​I​​K​​H​​N​​P​​Q​189  ​S​​Y​​Q​​I​​L​​F​​N​​K​​F​​R​199  ​S​​A​​I​​S​​F​​K​​P​​T​​V​​A​209  ​T​​I​​L​​S​​P​​D​​L​​L​​E​​K​219  ​Q​​L​​E​​D​​V​​T​​G​​N​​S​​L​229  ​D​​A​​Y​​D​​I​​E​​A​​S​​H​​E​239  ​R​​S​​D​​V​​L​​R​​D​​L​​T​​E​249  ​F​​H​​L​​G​​V​​T​​L​​Y​​N​​A​259  ​M​​L​​E​​N​​N​​C​​S​​E​​H​​A​269  ​S​​R​​M​​S​​A​​M​​E​​N​​S​​T​279  ​K​​S​​A​​G​​E​​M​​L​​G​​K​​L​289  ​T​​L​​D​​Y​​N​​R​​K​​R​​Q​​A​299  ​T​​I​​T​​T​​E​​L​​I​​E​​I​​I​309  ​A​​G​​A​​S​​A​​L​​M​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.12 .. 1.37
0.12
1.37
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
39
SER
0.43
2
40
ASN
0.49
3
41
GLN
0.48
4
42
ALA
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VAL
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LYS
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7
45
GLN
0.44
8
46
ARG
0.48
9
47
ILE
0.53
10
48
ARG
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11
49
ALA
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12
50
ILE
0.81
13
51
LYS
0.80
14
52
ASN
0.75
15
53
ILE
0.71
16
54
GLY
0.80
17
55
LYS
0.92
18
56
ILE
0.89
19
57
THR
0.93
20
58
LYS
0.91
21
59
ALA
0.93
22
60
MET
0.94
23
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LYS
0.99
24
62
MET
0.99
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63
VAL
1.02
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64
ALA
0.99
27
65
ALA
0.79
28
66
SER
0.79
29
67
LYS
0.76
30
68
MET
0.67
31
69
LYS
0.64
32
70
ASN
0.68
Sequence of
39   ​S​​N​​Q​​A​​V​​K​​Q​​R​​I​​R​49   ​A​​I​​K​​N​​I​​G​​K​​I​​T​​K​59   ​A​​M​​K​​M​​V​​A​​A​​S​​K​​M​69   ​K​​N​​A​​Q​​I​​A​​V​​E​​Q​​S​79   ​R​​G​​L​​V​​D​​P​​F​​V​​R​​L​89   ​F​​G​​D​​F​​P​​A​​V​​N​​S​​N​99   ​K​​S​​V​​V​​V​​A​​V​​T​​S​​D​109  ​K​​G​​L​​C​​G​​G​​L​​N​​S​​N​119  ​I​​T​​K​​Y​​T​​R​​A​​T​​L​​A​129  ​T​​T​​E​​S​​E​​G​​K​​D​​V​​V​139  ​V​​V​​S​​I​​G​​D​​K​​G​​R​​S​149  ​Q​​L​​T​​R​​I​​E​​S​​Q​​R​​Y​159  ​Q​​L​​A​​I​​A​​D​​T​​Y​​K​​V​169  ​R​​V​​T​​F​​G​​Q​​A​​S​​L​​I​179  ​V​​E​​E​​L​​I​​K​​H​​N​​P​​Q​189  ​S​​Y​​Q​​I​​L​​F​​N​​K​​F​​R​199  ​S​​A​​I​​S​​F​​K​​P​​T​​V​​A​209  ​T​​I​​L​​S​​P​​D​​L​​L​​E​​K​219  ​Q​​L​​E​​D​​V​​T​​G​​N​​S​​L​229  ​D​​A​​Y​​D​​I​​E​​A​​S​​H​​E​239  ​R​​S​​D​​V​​L​​R​​D​​L​​T​​E​249  ​F​​H​​L​​G​​V​​T​​L​​Y​​N​​A​259  ​M​​L​​E​​N​​N​​C​​S​​E​​H​​A​269  ​S​​R​​M​​S​​A​​M​​E​​N​​S​​T​279  ​K​​S​​A​​G​​E​​M​​L​​G​​K​​L​289  ​T​​L​​D​​Y​​N​​R​​K​​R​​Q​​A​299  ​T​​I​​T​​T​​E​​L​​I​​E​​I​​I​309  ​A​​G​​A​​S​​A​​L​​M​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.25 .. 1.07
-0.25
1.07
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
39
SER
0.29
2
40
ASN
0.32
3
41
GLN
0.34
4
42
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5
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VAL
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7
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8
46
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9
47
ILE
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48
ARG
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11
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50
ILE
0.49
13
51
LYS
0.51
14
52
ASN
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15
53
ILE
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GLY
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LYS
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ILE
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19
57
THR
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20
58
LYS
0.58
21
59
ALA
0.58
22
60
MET
0.58
23
61
LYS
0.57
24
62
MET
0.59
25
63
VAL
0.59
26
64
ALA
0.59
27
65
ALA
0.58
28
66
SER
0.58
29
67
LYS
0.58
30
68
MET
0.48
31
69
LYS
0.44
32
70
ASN
0.42
Sequence of
39   ​S​​N​​Q​​A​​V​​K​​Q​​R​​I​​R​49   ​A​​I​​K​​N​​I​​G​​K​​I​​T​​K​59   ​A​​M​​K​​M​​V​​A​​A​​S​​K​​M​69   ​K​​N​​A​​Q​​I​​A​​V​​E​​Q​​S​79   ​R​​G​​L​​V​​D​​P​​F​​V​​R​​L​89   ​F​​G​​D​​F​​P​​A​​V​​N​​S​​N​99   ​K​​S​​V​​V​​V​​A​​V​​T​​S​​D​109  ​K​​G​​L​​C​​G​​G​​L​​N​​S​​N​119  ​I​​T​​K​​Y​​T​​R​​A​​T​​L​​A​129  ​T​​T​​E​​S​​E​​G​​K​​D​​V​​V​139  ​V​​V​​S​​I​​G​​D​​K​​G​​R​​S​149  ​Q​​L​​T​​R​​I​​E​​S​​Q​​R​​Y​159  ​Q​​L​​A​​I​​A​​D​​T​​Y​​K​​V​169  ​R​​V​​T​​F​​G​​Q​​A​​S​​L​​I​179  ​V​​E​​E​​L​​I​​K​​H​​N​​P​​Q​189  ​S​​Y​​Q​​I​​L​​F​​N​​K​​F​​R​199  ​S​​A​​I​​S​​F​​K​​P​​T​​V​​A​209  ​T​​I​​L​​S​​P​​D​​L​​L​​E​​K​219  ​Q​​L​​E​​D​​V​​T​​G​​N​​S​​L​229  ​D​​A​​Y​​D​​I​​E​​A​​S​​H​​E​239  ​R​​S​​D​​V​​L​​R​​D​​L​​T​​E​249  ​F​​H​​L​​G​​V​​T​​L​​Y​​N​​A​259  ​M​​L​​E​​N​​N​​C​​S​​E​​H​​A​269  ​S​​R​​M​​S​​A​​M​​E​​N​​S​​T​279  ​K​​S​​A​​G​​E​​M​​L​​G​​K​​L​289  ​T​​L​​D​​Y​​N​​R​​K​​R​​Q​​A​299  ​T​​I​​T​​T​​E​​L​​I​​E​​I​​I​309  ​A​​G​​A​​S​​A​​L​​M​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.39 .. 3.23
0.39
3.23
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
39
SER
1.46
2
40
ASN
1.64
3
41
GLN
1.71
4
42
ALA
1.68
5
43
VAL
1.70
6
44
LYS
1.52
7
45
GLN
1.43
8
46
ARG
1.44
9
47
ILE
1.46
10
48
ARG
1.54
11
49
ALA
1.88
12
50
ILE
2.08
13
51
LYS
2.14
14
52
ASN
2.15
15
53
ILE
2.03
16
54
GLY
2.16
17
55
LYS
2.35
18
56
ILE
2.35
19
57
THR
2.32
20
58
LYS
2.33
21
59
ALA
2.33
22
60
MET
2.27
23
61
LYS
2.33
24
62
MET
2.39
25
63
VAL
2.50
26
64
ALA
2.47
27
65
ALA
2.23
28
66
SER
2.29
29
67
LYS
2.27
30
68
MET
1.94
31
69
LYS
1.76
32
70
ASN
1.77