7935 6DJB F v1-3
7935_6djb_F_v1-3
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RCSB PDB: 6DJB
EMDB: 7935
Structure title Structure of human Volume Regulated Anion Channel composed of SWELL1 (LRRC8A)
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 4.4 Å
Source organism Homo sapiens
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Download PDB file DAQ[AA]
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Converting to mmCIF
SequenceNo structure available
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.07 .. 1.40
-0.07
1.40
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
15
PRO
0.03
2
16
ALA
0.05
3
17
TYR
0.09
4
18
ARG
0.16
5
19
ILE
0.18
6
20
LEU
0.14
7
21
LYS
0.26
8
22
PRO
0.30
9
23
TRP
0.32
10
24
TRP
0.35
11
25
ASP
0.39
12
26
VAL
0.45
13
27
PHE
0.50
14
28
THR
0.55
15
29
ASP
0.62
16
30
TYR
0.76
17
31
ILE
0.84
18
32
SER
0.93
19
33
ILE
1.04
20
34
VAL
1.01
21
35
MET
1.04
22
36
LEU
1.08
23
37
MET
0.94
24
38
ILE
0.91
25
39
ALA
0.96
26
40
VAL
0.86
27
41
PHE
0.79
28
42
GLY
0.83
29
43
GLY
0.79
30
44
THR
0.82
31
45
LEU
0.80
32
46
GLN
0.67
3D View
Download PDB file DAQ[Cα]
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Sequence of
15   ​P​​A​​Y​​R​​I​​L​​K​​P​​W​​W​25   ​D​​V​​F​​T​​D​​Y​​I​​S​​I​​V​35   ​M​​L​​M​​I​​A​​V​​F​​G​​G​​T​45   ​L​​Q​​V​​T​​Q​​D​​K​​M​​I​​C​55   ​L​​P​​C​​K​​W​​V​​T​​K​​D​​S​65   ​C​​N​​D​​S​​P​​T​​G​​I​​K​​Y​100  ​D​​L​​D​​R​​H​​Q​​Y​​N​​Y​​V​110  ​D​​A​​V​​C​​Y​​E​​N​​R​​L​​H​120  ​W​​F​​A​​K​​Y​​F​​P​​Y​​L​​V​130  ​L​​L​​H​​T​​L​​I​​F​​L​​A​​C​140  ​S​​N​​F​​W​​F​​K​​F​​P​​R​​T​150  ​S​​S​​K​​L​​E​​H​​F​​V​​S​​I​160  ​L​​L​​K​​C​​F​​D​​S​​P​​W​​T​170  ​T​​R​​A​​L​​S​​E​​R​​T​​K​​S​218  ​R​​I​​E​​Q​​G​​I​​V​​D​​R​​S​228  ​E​​T​​G​​V​​L​​D​​K​​K​​E​​G​238  ​E​​Q​​A​​K​​A​​L​​F​​E​​K​​V​248  ​K​​K​​F​​R​​T​​H​​V​​E​​E​​G​258  ​D​​I​​V​​Y​​R​​L​​Y​​M​​R​​Q​268  ​T​​I​​I​​K​​V​​I​​K​​F​​I​​L​278  ​I​​I​​C​​Y​​T​​V​​Y​​Y​​V​​H​288  ​N​​I​​K​​F​​D​​V​​D​​C​​T​​V​298  ​D​​I​​E​​S​​L​​T​​G​​Y​​R​​T​308  ​Y​​R​​C​​A​​H​​P​​L​​A​​T​​L​318  ​F​​K​​I​​L​​A​​S​​F​​Y​​I​​S​328  ​L​​V​​I​​F​​Y​​G​​L​​I​​C​​M​338  ​Y​​T​​L​​W​​W​​M​​L​​R​​R​​S​348  ​L​​K​​K​​Y​​S​​F​​E​​S​​I​​R​358  ​E​​E​​S​​S​​Y​​S​​D​​I​​P​​D​368  ​V​​K​​N​​D​​F​​A​​F​​M​​L​​H​378  ​L​​I​​D​​Q​​Y​​D​​P​​L​​Y​​S​388  ​K​​R​​F​​A​​V​​F​​L​​S​​E​​V​398  ​S​​E​​N​​K​​L​​R​​Q​​L​​N​​L​408  ​N​​N​​E​​W​​T​​L​​D​​K​​L​​R​418  ​Q​​R​​L​​T​​K​​N​​A​​Q​​D​​K​428  ​L​​E​​L​​H​​L​​F​​M​​L​​S​​G​438  ​I​​P​​D​​T​​V​​F​​D​​L​​V​​E​448  ​L​​E​​V​​L​​K​​L​​E​​L​​I​​P​458  ​D​​V​​T​​I​​P​​P​​S​​I​​A​​Q​468  ​L​​T​​G​​L​​K​​E​​L​​W​​L​​Y​478  ​H​​T​​A​​A​​K​​I​​E​​A​​P​​A​488  ​L​​A​​F​​L​​R​​E​​N​​L​​R​​A​498  ​L​​H​​I​​K​​F​​T​​D​​I​​K​​E​508  ​I​​P​​L​​W​​I​​Y​​S​​L​​K​​T​518  ​L​​E​​E​​L​​H​​L​​T​​G​​N​​L​528  ​S​​A​​E​​N​​N​​R​​Y​​I​​V​​I​538  ​D​​G​​L​​R​​E​​L​​K​​R​​L​​K​548  ​V​​L​​R​​L​​K​​S​​N​​L​​S​​K​558  ​L​​P​​Q​​V​​V​​T​​D​​V​​G​​V​568  ​H​​L​​Q​​K​​L​​S​​I​​N​​N​​E​578  ​G​​T​​K​​L​​I​​V​​L​​N​​S​​L​588  ​K​​K​​M​​A​​N​​L​​T​​E​​L​​E​598  ​L​​I​​R​​C​​D​​L​​E​​R​​I​​P​608  ​H​​S​​I​​F​​S​​L​​H​​N​​L​​Q​618  ​E​​I​​D​​L​​K​​D​​N​​N​​L​​K​628  ​T​​I​​E​​E​​I​​I​​S​​F​​Q​​H​638  ​L​​H​​R​​L​​T​​C​​L​​K​​L​​W​648  ​Y​​N​​H​​I​​A​​Y​​I​​P​​I​​Q​658  ​I​​G​​N​​L​​T​​N​​L​​E​​R​​L​668  ​Y​​L​​N​​R​​N​​K​​I​​E​​K​​I​678  ​P​​T​​Q​​L​​F​​Y​​C​​R​​K​​L​688  ​R​​Y​​L​​D​​L​​S​​H​​N​​N​​L​698  ​T​​F​​L​​P​​A​​D​​I​​G​​L​​L​708  ​Q​​N​​L​​Q​​N​​L​​A​​I​​T​​A​718  ​N​​R​​I​​E​​T​​L​​P​​P​​E​​L​728  ​F​​Q​​C​​R​​K​​L​​R​​A​​L​​H​738  ​L​​G​​N​​N​​V​​L​​Q​​S​​L​​P​748  ​S​​R​​V​​G​​E​​L​​T​​N​​L​​T​758  ​Q​​I​​E​​L​​R​​G​​N​​R​​L​​E​768  ​C​​L​​P​​V​​E​​L​​G​​E​​C​​P​778  ​L​​L​​K​​R​​S​​G​​L​​V​​V​​E​788  ​E​​D​​L​​F​​N​​T​​L​​P​​P​​E​798  ​V​​K​​E​​R​​L​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.03 .. 1.17
-0.03
1.17
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
15
PRO
0.39
2
16
ALA
0.29
3
17
TYR
0.39
4
18
ARG
0.30
5
19
ILE
0.17
6
20
LEU
0.28
7
21
LYS
0.36
8
22
PRO
0.42
9
23
TRP
0.39
10
24
TRP
0.45
11
25
ASP
0.47
12
26
VAL
0.49
13
27
PHE
0.54
14
28
THR
0.60
15
29
ASP
0.67
16
30
TYR
0.66
17
31
ILE
0.68
18
32
SER
0.75
19
33
ILE
0.81
20
34
VAL
0.75
21
35
MET
0.82
22
36
LEU
0.76
23
37
MET
0.60
24
38
ILE
0.64
25
39
ALA
0.61
26
40
VAL
0.56
27
41
PHE
0.46
28
42
GLY
0.54
29
43
GLY
0.46
30
44
THR
0.45
31
45
LEU
0.43
32
46
GLN
0.41
3D View
Download PDB file DAQ[SS]
Download Secondary Structure Prediction file
Render Map
SequenceNo structure available
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -2.62 .. 0.94
-2.62
0.94
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
15
PRO
-0.19
2
16
ALA
-0.10
3
17
TYR
-0.02
4
18
ARG
0.05
5
19
ILE
0.12
6
20
LEU
0.17
7
21
LYS
0.22
8
22
PRO
0.26
9
23
TRP
0.30
10
24
TRP
0.34
11
25
ASP
0.39
12
26
VAL
0.45
13
27
PHE
0.52
14
28
THR
0.63
15
29
ASP
0.69
16
30
TYR
0.77
17
31
ILE
0.83
18
32
SER
0.83
19
33
ILE
0.76
20
34
VAL
0.70
21
35
MET
0.54
22
36
LEU
0.35
23
37
MET
0.22
24
38
ILE
0.08
25
39
ALA
-0.08
26
40
VAL
-0.14
27
41
PHE
-0.19
28
42
GLY
-0.29
29
43
GLY
-0.33
30
44
THR
-0.41
31
45
LEU
-0.47
32
46
GLN
-0.51
3D View
Download PDB file DAQ[Total]
Render Map
SequenceNo structure available
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -2.39 .. 3.36
-2.39
3.36
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
15
PRO
0.23
2
16
ALA
0.24
3
17
TYR
0.46
4
18
ARG
0.51
5
19
ILE
0.47
6
20
LEU
0.59
7
21
LYS
0.83
8
22
PRO
0.99
9
23
TRP
1.02
10
24
TRP
1.14
11
25
ASP
1.24
12
26
VAL
1.39
13
27
PHE
1.57
14
28
THR
1.78
15
29
ASP
1.98
16
30
TYR
2.18
17
31
ILE
2.35
18
32
SER
2.50
19
33
ILE
2.61
20
34
VAL
2.46
21
35
MET
2.40
22
36
LEU
2.19
23
37
MET
1.76
24
38
ILE
1.63
25
39
ALA
1.49
26
40
VAL
1.28
27
41
PHE
1.06
28
42
GLY
1.08
29
43
GLY
0.92
30
44
THR
0.86
31
45
LEU
0.76
32
46
GLN
0.58