8014 5GAP G v1-4
Structure title Body region of the U4/U6.U5 tri-snRNP
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 3.6 Å
Source organism Saccharomyces cerevisiae

Sequence of
150  ​L​​L​​D​​L​​S​​K​​F​​K​​I​​Y​160  ​Y​​D​​N​​N​​H​​G​​Y​​E​​W​​W​170  ​D​​T​​A​​Y​​L​​D​​E​​K​​G​​E​180  ​L​​M​​E​​K​​Y​​D​​M​​N​​G​​T​190  ​S​​P​​A​​E​​E​​K​​L​​A​​E​​D​200  ​I​​D​​E​​V​​D​​D​​D​​D​​D​​D​210  ​E​​H​​P​​S​​I​​R​​Y​​V​​A​​H​220  ​P​​L​​P​​E​​K​​I​​N​​E​​A​​K​230  ​V​​S​​I​​K​​A​​Y​​L​​T​​Q​​H​240  ​E​​R​​K​​R​​L​​R​​R​​N​​R​​R​250  ​K​​M​​A​​R​​E​​A​​R​​E​​I​​K​260  ​I​​K​​L​​G​​L​​L​​P​​K​​P​​E​270  ​P​​K​​V​​K​​L​​S​​N​​M​​M​​S​280  ​V​​F​​E​​N​​D​​Q​​N​​I​​T​​D​290  ​P​​T​​A​​W​​E​​K​​V​​V​​K​​D​300  ​Q​​V​​D​​L​​R​​K​​R​​K​​H​​L​310  ​E​​E​​N​​E​​R​​R​​H​​E​​D​​A​320  ​I​​K​​R​​R​​K​​E​​A​​V​​N​​M​330  ​N​​V​​E​​K​​P​​T​​V​​Y​​H​​C​340  ​K​​V​​F​​Q​​F​​K​​N​​L​​Q​​N​350  ​P​​K​​I​​R​​F​​K​​L​​K​​M​​N​360  ​S​​K​​E​​L​​S​​L​​K​​G​​L​​C​370  ​L​​R​​I​​R​​D​​D​​G​​P​​G​​I​380  ​I​​I​​V​​V​​G​​N​​E​​K​​S​​C​390  ​K​​F​​Y​​E​​N​​L​​V​​M​​K​​R​400  ​I​​K​​W​​N​​E​​D​​F​​E​​L​​H​410  ​T​​N​​T​​G​​D​​I​​K​​M​​D​​M​420  ​H​​N​​N​​S​​I​​S​​K​​T​​W​​E​430  ​G​​Y​​L​​Q​​D​​C​​K​​F​​K​​G​440  ​W​​F​​M​​K​​V​​C​​N​​D​​Q​​D​450  ​S​​L​​L​​R​​T​​L​​G​​Q​​F​​D​460  ​S​​E​​H​​F​​Y​​S​​P​​V​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.39 .. 1.22
-0.39
1.22
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
150
LEU
-0.20
2
151
LEU
-0.26
3
152
ASP
-0.22
4
153
LEU
-0.21
5
154
SER
-0.19
6
155
LYS
-0.17
7
156
PHE
-0.05
8
157
LYS
-0.09
9
158
ILE
-0.09
10
159
TYR
-0.13
11
160
TYR
-0.28
12
161
ASP
-0.25
13
162
ASN
-0.22
14
163
ASN
-0.34
15
164
HIS
-0.39
16
165
GLY
-0.33
17
166
TYR
-0.28
18
167
GLU
-0.28
19
168
TRP
-0.27
20
169
TRP
-0.22
21
170
ASP
-0.17
22
171
THR
-0.20
23
172
ALA
-0.19
24
173
TYR
-0.14
25
174
LEU
-0.16
26
175
ASP
-0.21
27
176
GLU
-0.25
28
177
LYS
-0.28
29
178
GLY
-0.20
30
179
GLU
-0.01
31
180
LEU
-0.04
32
181
MET
-0.02
Sequence of
150  ​L​​L​​D​​L​​S​​K​​F​​K​​I​​Y​160  ​Y​​D​​N​​N​​H​​G​​Y​​E​​W​​W​170  ​D​​T​​A​​Y​​L​​D​​E​​K​​G​​E​180  ​L​​M​​E​​K​​Y​​D​​M​​N​​G​​T​190  ​S​​P​​A​​E​​E​​K​​L​​A​​E​​D​200  ​I​​D​​E​​V​​D​​D​​D​​D​​D​​D​210  ​E​​H​​P​​S​​I​​R​​Y​​V​​A​​H​220  ​P​​L​​P​​E​​K​​I​​N​​E​​A​​K​230  ​V​​S​​I​​K​​A​​Y​​L​​T​​Q​​H​240  ​E​​R​​K​​R​​L​​R​​R​​N​​R​​R​250  ​K​​M​​A​​R​​E​​A​​R​​E​​I​​K​260  ​I​​K​​L​​G​​L​​L​​P​​K​​P​​E​270  ​P​​K​​V​​K​​L​​S​​N​​M​​M​​S​280  ​V​​F​​E​​N​​D​​Q​​N​​I​​T​​D​290  ​P​​T​​A​​W​​E​​K​​V​​V​​K​​D​300  ​Q​​V​​D​​L​​R​​K​​R​​K​​H​​L​310  ​E​​E​​N​​E​​R​​R​​H​​E​​D​​A​320  ​I​​K​​R​​R​​K​​E​​A​​V​​N​​M​330  ​N​​V​​E​​K​​P​​T​​V​​Y​​H​​C​340  ​K​​V​​F​​Q​​F​​K​​N​​L​​Q​​N​350  ​P​​K​​I​​R​​F​​K​​L​​K​​M​​N​360  ​S​​K​​E​​L​​S​​L​​K​​G​​L​​C​370  ​L​​R​​I​​R​​D​​D​​G​​P​​G​​I​380  ​I​​I​​V​​V​​G​​N​​E​​K​​S​​C​390  ​K​​F​​Y​​E​​N​​L​​V​​M​​K​​R​400  ​I​​K​​W​​N​​E​​D​​F​​E​​L​​H​410  ​T​​N​​T​​G​​D​​I​​K​​M​​D​​M​420  ​H​​N​​N​​S​​I​​S​​K​​T​​W​​E​430  ​G​​Y​​L​​Q​​D​​C​​K​​F​​K​​G​440  ​W​​F​​M​​K​​V​​C​​N​​D​​Q​​D​450  ​S​​L​​L​​R​​T​​L​​G​​Q​​F​​D​460  ​S​​E​​H​​F​​Y​​S​​P​​V​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.12 .. 1.31
-0.12
1.31
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
150
LEU
0.38
2
151
LEU
0.32
3
152
ASP
0.36
4
153
LEU
0.36
5
154
SER
0.36
6
155
LYS
0.30
7
156
PHE
0.30
8
157
LYS
0.30
9
158
ILE
0.34
10
159
TYR
0.35
11
160
TYR
0.39
12
161
ASP
0.39
13
162
ASN
0.44
14
163
ASN
0.45
15
164
HIS
0.41
16
165
GLY
0.38
17
166
TYR
0.38
18
167
GLU
0.43
19
168
TRP
0.46
20
169
TRP
0.46
21
170
ASP
0.50
22
171
THR
0.52
23
172
ALA
0.56
24
173
TYR
0.58
25
174
LEU
0.62
26
175
ASP
0.62
27
176
GLU
0.65
28
177
LYS
0.60
29
178
GLY
0.58
30
179
GLU
0.57
31
180
LEU
0.57
32
181
MET
0.50
Sequence of
150  ​L​​L​​D​​L​​S​​K​​F​​K​​I​​Y​160  ​Y​​D​​N​​N​​H​​G​​Y​​E​​W​​W​170  ​D​​T​​A​​Y​​L​​D​​E​​K​​G​​E​180  ​L​​M​​E​​K​​Y​​D​​M​​N​​G​​T​190  ​S​​P​​A​​E​​E​​K​​L​​A​​E​​D​200  ​I​​D​​E​​V​​D​​D​​D​​D​​D​​D​210  ​E​​H​​P​​S​​I​​R​​Y​​V​​A​​H​220  ​P​​L​​P​​E​​K​​I​​N​​E​​A​​K​230  ​V​​S​​I​​K​​A​​Y​​L​​T​​Q​​H​240  ​E​​R​​K​​R​​L​​R​​R​​N​​R​​R​250  ​K​​M​​A​​R​​E​​A​​R​​E​​I​​K​260  ​I​​K​​L​​G​​L​​L​​P​​K​​P​​E​270  ​P​​K​​V​​K​​L​​S​​N​​M​​M​​S​280  ​V​​F​​E​​N​​D​​Q​​N​​I​​T​​D​290  ​P​​T​​A​​W​​E​​K​​V​​V​​K​​D​300  ​Q​​V​​D​​L​​R​​K​​R​​K​​H​​L​310  ​E​​E​​N​​E​​R​​R​​H​​E​​D​​A​320  ​I​​K​​R​​R​​K​​E​​A​​V​​N​​M​330  ​N​​V​​E​​K​​P​​T​​V​​Y​​H​​C​340  ​K​​V​​F​​Q​​F​​K​​N​​L​​Q​​N​350  ​P​​K​​I​​R​​F​​K​​L​​K​​M​​N​360  ​S​​K​​E​​L​​S​​L​​K​​G​​L​​C​370  ​L​​R​​I​​R​​D​​D​​G​​P​​G​​I​380  ​I​​I​​V​​V​​G​​N​​E​​K​​S​​C​390  ​K​​F​​Y​​E​​N​​L​​V​​M​​K​​R​400  ​I​​K​​W​​N​​E​​D​​F​​E​​L​​H​410  ​T​​N​​T​​G​​D​​I​​K​​M​​D​​M​420  ​H​​N​​N​​S​​I​​S​​K​​T​​W​​E​430  ​G​​Y​​L​​Q​​D​​C​​K​​F​​K​​G​440  ​W​​F​​M​​K​​V​​C​​N​​D​​Q​​D​450  ​S​​L​​L​​R​​T​​L​​G​​Q​​F​​D​460  ​S​​E​​H​​F​​Y​​S​​P​​V​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.74 .. 1.34
-0.74
1.34
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
150
LEU
-0.45
2
151
LEU
-0.50
3
152
ASP
-0.52
4
153
LEU
-0.55
5
154
SER
-0.59
6
155
LYS
-0.54
7
156
PHE
-0.51
8
157
LYS
-0.51
9
158
ILE
-0.52
10
159
TYR
-0.52
11
160
TYR
-0.52
12
161
ASP
-0.53
13
162
ASN
-0.55
14
163
ASN
-0.65
15
164
HIS
-0.70
16
165
GLY
-0.74
17
166
TYR
-0.71
18
167
GLU
-0.66
19
168
TRP
-0.60
20
169
TRP
-0.55
21
170
ASP
-0.51
22
171
THR
-0.49
23
172
ALA
-0.44
24
173
TYR
-0.41
25
174
LEU
-0.43
26
175
ASP
-0.47
27
176
GLU
-0.51
28
177
LYS
-0.54
29
178
GLY
-0.49
30
179
GLU
-0.47
31
180
LEU
-0.44
32
181
MET
-0.38
Sequence of
150  ​L​​L​​D​​L​​S​​K​​F​​K​​I​​Y​160  ​Y​​D​​N​​N​​H​​G​​Y​​E​​W​​W​170  ​D​​T​​A​​Y​​L​​D​​E​​K​​G​​E​180  ​L​​M​​E​​K​​Y​​D​​M​​N​​G​​T​190  ​S​​P​​A​​E​​E​​K​​L​​A​​E​​D​200  ​I​​D​​E​​V​​D​​D​​D​​D​​D​​D​210  ​E​​H​​P​​S​​I​​R​​Y​​V​​A​​H​220  ​P​​L​​P​​E​​K​​I​​N​​E​​A​​K​230  ​V​​S​​I​​K​​A​​Y​​L​​T​​Q​​H​240  ​E​​R​​K​​R​​L​​R​​R​​N​​R​​R​250  ​K​​M​​A​​R​​E​​A​​R​​E​​I​​K​260  ​I​​K​​L​​G​​L​​L​​P​​K​​P​​E​270  ​P​​K​​V​​K​​L​​S​​N​​M​​M​​S​280  ​V​​F​​E​​N​​D​​Q​​N​​I​​T​​D​290  ​P​​T​​A​​W​​E​​K​​V​​V​​K​​D​300  ​Q​​V​​D​​L​​R​​K​​R​​K​​H​​L​310  ​E​​E​​N​​E​​R​​R​​H​​E​​D​​A​320  ​I​​K​​R​​R​​K​​E​​A​​V​​N​​M​330  ​N​​V​​E​​K​​P​​T​​V​​Y​​H​​C​340  ​K​​V​​F​​Q​​F​​K​​N​​L​​Q​​N​350  ​P​​K​​I​​R​​F​​K​​L​​K​​M​​N​360  ​S​​K​​E​​L​​S​​L​​K​​G​​L​​C​370  ​L​​R​​I​​R​​D​​D​​G​​P​​G​​I​380  ​I​​I​​V​​V​​G​​N​​E​​K​​S​​C​390  ​K​​F​​Y​​E​​N​​L​​V​​M​​K​​R​400  ​I​​K​​W​​N​​E​​D​​F​​E​​L​​H​410  ​T​​N​​T​​G​​D​​I​​K​​M​​D​​M​420  ​H​​N​​N​​S​​I​​S​​K​​T​​W​​E​430  ​G​​Y​​L​​Q​​D​​C​​K​​F​​K​​G​440  ​W​​F​​M​​K​​V​​C​​N​​D​​Q​​D​450  ​S​​L​​L​​R​​T​​L​​G​​Q​​F​​D​460  ​S​​E​​H​​F​​Y​​S​​P​​V​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.69 .. 2.85
-0.69
2.85
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
150
LEU
-0.26
2
151
LEU
-0.44
3
152
ASP
-0.38
4
153
LEU
-0.39
5
154
SER
-0.42
6
155
LYS
-0.41
7
156
PHE
-0.26
8
157
LYS
-0.30
9
158
ILE
-0.26
10
159
TYR
-0.31
11
160
TYR
-0.42
12
161
ASP
-0.39
13
162
ASN
-0.33
14
163
ASN
-0.54
15
164
HIS
-0.67
16
165
GLY
-0.69
17
166
TYR
-0.60
18
167
GLU
-0.51
19
168
TRP
-0.41
20
169
TRP
-0.31
21
170
ASP
-0.18
22
171
THR
-0.17
23
172
ALA
-0.08
24
173
TYR
0.04
25
174
LEU
0.02
26
175
ASP
-0.05
27
176
GLU
-0.10
28
177
LYS
-0.21
29
178
GLY
-0.12
30
179
GLU
0.10
31
180
LEU
0.09
32
181
MET
0.10