9696 6IOL N v1-2
Structure title Cryo-EM structure of multidrug efflux pump MexAB-OprM (60 degree state)
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 3.76 Å
Source organism Pseudomonas aeruginosa PAO1

Sequence of
12   ​T​​P​​E​​V​​G​​I​​V​​T​​L​​E​22   ​A​​Q​​T​​V​​T​​L​​N​​T​​E​​L​32   ​P​​G​​R​​T​​N​​A​​F​​R​​I​​A​42   ​E​​V​​R​​P​​Q​​V​​N​​G​​I​​I​52   ​L​​K​​R​​L​​F​​K​​E​​G​​S​​D​62   ​V​​K​​A​​G​​Q​​Q​​L​​Y​​Q​​I​72   ​D​​P​​A​​T​​Y​​E​​A​​D​​Y​​Q​82   ​S​​A​​Q​​A​​N​​L​​A​​S​​T​​Q​92   ​E​​Q​​A​​Q​​R​​Y​​K​​L​​L​​V​102  ​A​​D​​Q​​A​​V​​S​​K​​Q​​Q​​Y​112  ​A​​D​​A​​N​​A​​A​​Y​​L​​Q​​S​122  ​K​​A​​A​​V​​E​​Q​​A​​R​​I​​N​132  ​L​​R​​Y​​T​​K​​V​​L​​S​​P​​I​142  ​S​​G​​R​​I​​G​​R​​S​​A​​V​​T​152  ​E​​G​​A​​L​​V​​T​​N​​G​​Q​​A​162  ​N​​A​​M​​A​​T​​V​​Q​​Q​​L​​D​172  ​P​​I​​Y​​V​​D​​V​​T​​Q​​P​​S​182  ​T​​A​​L​​L​​R​​L​​R​​R​​E​​L​192  ​A​​S​​G​​Q​​L​​E​​R​​A​​G​​D​202  ​N​​A​​A​​K​​V​​S​​L​​K​​L​​E​212  ​D​​G​​S​​Q​​Y​​P​​L​​E​​G​​R​222  ​L​​E​​F​​S​​E​​V​​S​​V​​D​​E​232  ​G​​T​​G​​S​​V​​T​​I​​R​​A​​V​242  ​F​​P​​N​​P​​N​​N​​E​​L​​L​​P​252  ​G​​M​​F​​V​​H​​A​​Q​​L​​Q​​E​262  ​G​​V​​K​​Q​​K​​A​​I​​L​​A​​P​272  ​Q​​Q​​G​​V​​T​​R​​D​​L​​K​​G​282  ​Q​​A​​T​​A​​L​​V​​V​​N​​A​​Q​292  ​N​​K​​V​​E​​L​​R​​V​​I​​K​​A​302  ​D​​R​​V​​I​​G​​D​​K​​W​​L​​V​312  ​T​​E​​G​​L​​N​​A​​G​​D​​K​​I​322  ​I​​T​​E​​G​​L​​Q​​F​​V​​Q​​P​332  ​G​​V​​E​​V​​K​​T​​V​​P​​A​​K​342  ​N​​V​​A​​S​​A​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.14 .. 0.80
-0.14
0.80
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
12
THR
0.64
2
13
PRO
0.61
3
14
GLU
0.53
4
15
VAL
0.53
5
16
GLY
0.60
6
17
ILE
0.62
7
18
VAL
0.65
8
19
THR
0.58
9
20
LEU
0.62
10
21
GLU
0.64
11
22
ALA
0.64
12
23
GLN
0.66
13
24
THR
0.71
14
25
VAL
0.60
15
26
THR
0.61
16
27
LEU
0.60
17
28
ASN
0.56
18
29
THR
0.59
19
30
GLU
0.66
20
31
LEU
0.64
21
32
PRO
0.68
22
33
GLY
0.71
23
34
ARG
0.71
24
35
THR
0.61
25
36
ASN
0.68
26
37
ALA
0.62
27
38
PHE
0.67
28
39
ARG
0.58
29
40
ILE
0.60
30
41
ALA
0.66
31
42
GLU
0.67
32
43
VAL
0.50
Sequence of
12   ​T​​P​​E​​V​​G​​I​​V​​T​​L​​E​22   ​A​​Q​​T​​V​​T​​L​​N​​T​​E​​L​32   ​P​​G​​R​​T​​N​​A​​F​​R​​I​​A​42   ​E​​V​​R​​P​​Q​​V​​N​​G​​I​​I​52   ​L​​K​​R​​L​​F​​K​​E​​G​​S​​D​62   ​V​​K​​A​​G​​Q​​Q​​L​​Y​​Q​​I​72   ​D​​P​​A​​T​​Y​​E​​A​​D​​Y​​Q​82   ​S​​A​​Q​​A​​N​​L​​A​​S​​T​​Q​92   ​E​​Q​​A​​Q​​R​​Y​​K​​L​​L​​V​102  ​A​​D​​Q​​A​​V​​S​​K​​Q​​Q​​Y​112  ​A​​D​​A​​N​​A​​A​​Y​​L​​Q​​S​122  ​K​​A​​A​​V​​E​​Q​​A​​R​​I​​N​132  ​L​​R​​Y​​T​​K​​V​​L​​S​​P​​I​142  ​S​​G​​R​​I​​G​​R​​S​​A​​V​​T​152  ​E​​G​​A​​L​​V​​T​​N​​G​​Q​​A​162  ​N​​A​​M​​A​​T​​V​​Q​​Q​​L​​D​172  ​P​​I​​Y​​V​​D​​V​​T​​Q​​P​​S​182  ​T​​A​​L​​L​​R​​L​​R​​R​​E​​L​192  ​A​​S​​G​​Q​​L​​E​​R​​A​​G​​D​202  ​N​​A​​A​​K​​V​​S​​L​​K​​L​​E​212  ​D​​G​​S​​Q​​Y​​P​​L​​E​​G​​R​222  ​L​​E​​F​​S​​E​​V​​S​​V​​D​​E​232  ​G​​T​​G​​S​​V​​T​​I​​R​​A​​V​242  ​F​​P​​N​​P​​N​​N​​E​​L​​L​​P​252  ​G​​M​​F​​V​​H​​A​​Q​​L​​Q​​E​262  ​G​​V​​K​​Q​​K​​A​​I​​L​​A​​P​272  ​Q​​Q​​G​​V​​T​​R​​D​​L​​K​​G​282  ​Q​​A​​T​​A​​L​​V​​V​​N​​A​​Q​292  ​N​​K​​V​​E​​L​​R​​V​​I​​K​​A​302  ​D​​R​​V​​I​​G​​D​​K​​W​​L​​V​312  ​T​​E​​G​​L​​N​​A​​G​​D​​K​​I​322  ​I​​T​​E​​G​​L​​Q​​F​​V​​Q​​P​332  ​G​​V​​E​​V​​K​​T​​V​​P​​A​​K​342  ​N​​V​​A​​S​​A​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.44 .. 0.93
-0.44
0.93
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
12
THR
0.77
2
13
PRO
0.80
3
14
GLU
0.72
4
15
VAL
0.77
5
16
GLY
0.73
6
17
ILE
0.74
7
18
VAL
0.78
8
19
THR
0.75
9
20
LEU
0.79
10
21
GLU
0.84
11
22
ALA
0.93
12
23
GLN
0.89
13
24
THR
0.83
14
25
VAL
0.86
15
26
THR
0.85
16
27
LEU
0.85
17
28
ASN
0.83
18
29
THR
0.82
19
30
GLU
0.85
20
31
LEU
0.77
21
32
PRO
0.70
22
33
GLY
0.72
23
34
ARG
0.70
24
35
THR
0.67
25
36
ASN
0.53
26
37
ALA
0.46
27
38
PHE
0.44
28
39
ARG
0.36
29
40
ILE
0.27
30
41
ALA
0.19
31
42
GLU
0.26
32
43
VAL
0.20
Sequence of
12   ​T​​P​​E​​V​​G​​I​​V​​T​​L​​E​22   ​A​​Q​​T​​V​​T​​L​​N​​T​​E​​L​32   ​P​​G​​R​​T​​N​​A​​F​​R​​I​​A​42   ​E​​V​​R​​P​​Q​​V​​N​​G​​I​​I​52   ​L​​K​​R​​L​​F​​K​​E​​G​​S​​D​62   ​V​​K​​A​​G​​Q​​Q​​L​​Y​​Q​​I​72   ​D​​P​​A​​T​​Y​​E​​A​​D​​Y​​Q​82   ​S​​A​​Q​​A​​N​​L​​A​​S​​T​​Q​92   ​E​​Q​​A​​Q​​R​​Y​​K​​L​​L​​V​102  ​A​​D​​Q​​A​​V​​S​​K​​Q​​Q​​Y​112  ​A​​D​​A​​N​​A​​A​​Y​​L​​Q​​S​122  ​K​​A​​A​​V​​E​​Q​​A​​R​​I​​N​132  ​L​​R​​Y​​T​​K​​V​​L​​S​​P​​I​142  ​S​​G​​R​​I​​G​​R​​S​​A​​V​​T​152  ​E​​G​​A​​L​​V​​T​​N​​G​​Q​​A​162  ​N​​A​​M​​A​​T​​V​​Q​​Q​​L​​D​172  ​P​​I​​Y​​V​​D​​V​​T​​Q​​P​​S​182  ​T​​A​​L​​L​​R​​L​​R​​R​​E​​L​192  ​A​​S​​G​​Q​​L​​E​​R​​A​​G​​D​202  ​N​​A​​A​​K​​V​​S​​L​​K​​L​​E​212  ​D​​G​​S​​Q​​Y​​P​​L​​E​​G​​R​222  ​L​​E​​F​​S​​E​​V​​S​​V​​D​​E​232  ​G​​T​​G​​S​​V​​T​​I​​R​​A​​V​242  ​F​​P​​N​​P​​N​​N​​E​​L​​L​​P​252  ​G​​M​​F​​V​​H​​A​​Q​​L​​Q​​E​262  ​G​​V​​K​​Q​​K​​A​​I​​L​​A​​P​272  ​Q​​Q​​G​​V​​T​​R​​D​​L​​K​​G​282  ​Q​​A​​T​​A​​L​​V​​V​​N​​A​​Q​292  ​N​​K​​V​​E​​L​​R​​V​​I​​K​​A​302  ​D​​R​​V​​I​​G​​D​​K​​W​​L​​V​312  ​T​​E​​G​​L​​N​​A​​G​​D​​K​​I​322  ​I​​T​​E​​G​​L​​Q​​F​​V​​Q​​P​332  ​G​​V​​E​​V​​K​​T​​V​​P​​A​​K​342  ​N​​V​​A​​S​​A​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.56 .. 0.51
-0.56
0.51
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
12
THR
0.32
2
13
PRO
0.32
3
14
GLU
0.28
4
15
VAL
0.27
5
16
GLY
0.30
6
17
ILE
0.29
7
18
VAL
0.30
8
19
THR
0.33
9
20
LEU
0.36
10
21
GLU
0.38
11
22
ALA
0.40
12
23
GLN
0.42
13
24
THR
0.43
14
25
VAL
0.43
15
26
THR
0.42
16
27
LEU
0.40
17
28
ASN
0.43
18
29
THR
0.41
19
30
GLU
0.42
20
31
LEU
0.44
21
32
PRO
0.42
22
33
GLY
0.44
23
34
ARG
0.44
24
35
THR
0.42
25
36
ASN
0.41
26
37
ALA
0.39
27
38
PHE
0.35
28
39
ARG
0.30
29
40
ILE
0.25
30
41
ALA
0.24
31
42
GLU
0.26
32
43
VAL
0.23
SequenceNo structure available
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.97 .. 1.98
-0.97
1.98
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
12
THR
1.73
2
13
PRO
1.74
3
14
GLU
1.53
4
15
VAL
1.57
5
16
GLY
1.63
6
17
ILE
1.65
7
18
VAL
1.73
8
19
THR
1.66
9
20
LEU
1.78
10
21
GLU
1.87
11
22
ALA
1.98
12
23
GLN
1.97
13
24
THR
1.97
14
25
VAL
1.89
15
26
THR
1.88
16
27
LEU
1.85
17
28
ASN
1.82
18
29
THR
1.82
19
30
GLU
1.94
20
31
LEU
1.85
21
32
PRO
1.81
22
33
GLY
1.87
23
34
ARG
1.84
24
35
THR
1.71
25
36
ASN
1.62
26
37
ALA
1.47
27
38
PHE
1.45
28
39
ARG
1.24
29
40
ILE
1.12
30
41
ALA
1.09
31
42
GLU
1.20
32
43
VAL
0.93