9873 6JQL B v1-3
9873_6jql_B_v1-3
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RCSB PDB: 6JQL
EMDB: 9873
Structure title Structure of PaaZ, a bifunctional enzyme
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 2.9 Å
Source organism Escherichia coli K-12
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Download PDB file DAQ[AA]
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Sequence of
2    ​Q​​Q​​L​​A​​S​​F​​L​​S​​G​​T​12   ​W​​Q​​S​​G​​R​​G​​R​​S​​R​​L​22   ​I​​H​​H​​A​​I​​S​​G​​E​​A​​L​32   ​W​​E​​V​​T​​S​​E​​G​​L​​D​​M​42   ​A​​A​​A​​R​​Q​​F​​A​​I​​E​​K​52   ​G​​A​​P​​A​​L​​R​​A​​M​​T​​F​62   ​I​​E​​R​​A​​A​​M​​L​​K​​A​​V​72   ​A​​K​​H​​L​​L​​S​​E​​K​​E​​R​82   ​F​​Y​​A​​L​​S​​A​​Q​​T​​G​​A​92   ​T​​R​​A​​D​​S​​W​​V​​D​​I​​E​102  ​G​​G​​I​​G​​T​​L​​F​​T​​Y​​A​112  ​S​​L​​G​​S​​R​​E​​L​​P​​D​​D​122  ​T​​L​​W​​P​​E​​D​​E​​L​​I​​P​132  ​L​​S​​K​​E​​G​​G​​F​​A​​A​​R​142  ​H​​L​​L​​T​​S​​K​​S​​G​​V​​A​152  ​V​​H​​I​​N​​A​​F​​N​​F​​P​​C​162  ​W​​G​​M​​L​​E​​K​​L​​A​​P​​T​172  ​W​​L​​G​​G​​M​​P​​A​​I​​I​​K​182  ​P​​A​​T​​A​​T​​A​​Q​​L​​T​​Q​192  ​A​​M​​V​​K​​S​​I​​V​​D​​S​​G​202  ​L​​V​​P​​E​​G​​A​​I​​S​​L​​I​212  ​C​​G​​S​​A​​G​​D​​L​​L​​D​​H​222  ​L​​D​​S​​Q​​D​​V​​V​​T​​F​​T​232  ​G​​S​​A​​A​​T​​G​​Q​​M​​L​​R​242  ​V​​Q​​P​​N​​I​​V​​A​​K​​S​​I​252  ​P​​F​​T​​M​​E​​A​​D​​S​​L​​N​262  ​C​​C​​V​​L​​G​​E​​D​​V​​T​​P​272  ​D​​Q​​P​​E​​F​​A​​L​​F​​I​​R​282  ​E​​V​​V​​R​​E​​M​​T​​T​​K​​A​292  ​G​​Q​​K​​C​​T​​A​​I​​R​​R​​I​302  ​I​​V​​P​​Q​​A​​L​​V​​N​​A​​V​312  ​S​​D​​A​​L​​V​​A​​R​​L​​Q​​K​322  ​V​​V​​V​​G​​D​​P​​A​​Q​​E​​G​332  ​V​​K​​M​​G​​A​​L​​V​​N​​A​​E​342  ​Q​​R​​A​​D​​V​​Q​​E​​K​​V​​N​352  ​I​​L​​L​​A​​A​​G​​C​​E​​I​​R​362  ​L​​G​​G​​Q​​A​​D​​L​​S​​A​​A​372  ​G​​A​​F​​F​​P​​P​​T​​L​​L​​Y​382  ​C​​P​​Q​​P​​D​​E​​T​​P​​A​​V​392  ​H​​A​​T​​E​​A​​F​​G​​P​​V​​A​402  ​T​​L​​M​​P​​A​​Q​​N​​Q​​R​​H​412  ​A​​L​​Q​​L​​A​​C​​A​​G​​G​​G​422  ​S​​L​​A​​G​​T​​L​​V​​T​​A​​D​432  ​P​​Q​​I​​A​​R​​Q​​F​​I​​A​​D​442  ​A​​A​​R​​T​​H​​G​​R​​I​​Q​​I​452  ​L​​N​​E​​E​​S​​A​​K​​E​​S​​T​462  ​G​​H​​G​​S​​P​​L​​P​​Q​​L​​V​472  ​H​​G​​G​​P​​G​​R​​A​​G​​G​​G​482  ​E​​E​​L​​G​​G​​L​​R​​A​​V​​K​492  ​H​​Y​​M​​Q​​R​​T​​A​​V​​Q​​G​502  ​S​​P​​T​​M​​L​​A​​A​​I​​S​​K​512  ​Q​​W​​V​​R​​G​​A​​K​​V​​E​​E​522  ​D​​R​​I​​H​​P​​F​​R​​K​​Y​​F​532  ​E​​E​​L​​Q​​P​​G​​D​​S​​L​​L​542  ​T​​P​​R​​R​​T​​M​​T​​E​​A​​D​552  ​I​​V​​N​​F​​A​​C​​L​​S​​G​​D​562  ​H​​F​​Y​​A​​H​​M​​D​​K​​I​​A​572  ​A​​A​​E​​S​​I​​F​​G​​E​​R​​V​582  ​V​​H​​G​​Y​​F​​V​​L​​S​​A​​A​592  ​A​​G​​L​​F​​V​​D​​A​​G​​V​​G​602  ​P​​V​​I​​A​​N​​Y​​G​​L​​E​​S​612  ​L​​R​​F​​I​​E​​P​​V​​K​​P​​G​622  ​D​​T​​I​​Q​​V​​R​​L​​T​​C​​K​632  ​R​​K​​T​​L​​K​​K​​Q​​R​​S​​A​642  ​E​​E​​K​​P​​T​​G​​V​​V​​E​​W​652  ​A​​V​​E​​V​​F​​N​​Q​​H​​Q​​T​662  ​P​​V​​A​​L​​Y​​S​​I​​L​​T​​L​672  ​V​​A​​R​​Q​​H​​G​​D​​F​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.15 .. 1.49
0.15
1.49
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[AA]
1
2
GLN
0.83
2
3
GLN
0.91
3
4
LEU
0.96
4
5
ALA
0.96
5
6
SER
0.99
6
7
PHE
0.85
7
8
LEU
0.90
8
9
SER
0.88
9
10
GLY
0.87
10
11
THR
0.93
11
12
TRP
0.89
12
13
GLN
0.81
13
14
SER
0.78
14
15
GLY
0.80
15
16
ARG
0.82
16
17
GLY
0.78
17
18
ARG
0.71
18
19
SER
0.74
19
20
ARG
0.68
20
21
LEU
0.69
21
22
ILE
0.54
22
23
HIS
0.58
23
24
HIS
0.56
24
25
ALA
0.53
25
26
ILE
0.63
26
27
SER
0.57
27
28
GLY
0.57
28
29
GLU
0.51
29
30
ALA
0.44
30
31
LEU
0.54
31
32
TRP
0.62
32
33
GLU
0.66
3D View
Download PDB file DAQ[Cα]
Render Map
Sequence of
2    ​Q​​Q​​L​​A​​S​​F​​L​​S​​G​​T​12   ​W​​Q​​S​​G​​R​​G​​R​​S​​R​​L​22   ​I​​H​​H​​A​​I​​S​​G​​E​​A​​L​32   ​W​​E​​V​​T​​S​​E​​G​​L​​D​​M​42   ​A​​A​​A​​R​​Q​​F​​A​​I​​E​​K​52   ​G​​A​​P​​A​​L​​R​​A​​M​​T​​F​62   ​I​​E​​R​​A​​A​​M​​L​​K​​A​​V​72   ​A​​K​​H​​L​​L​​S​​E​​K​​E​​R​82   ​F​​Y​​A​​L​​S​​A​​Q​​T​​G​​A​92   ​T​​R​​A​​D​​S​​W​​V​​D​​I​​E​102  ​G​​G​​I​​G​​T​​L​​F​​T​​Y​​A​112  ​S​​L​​G​​S​​R​​E​​L​​P​​D​​D​122  ​T​​L​​W​​P​​E​​D​​E​​L​​I​​P​132  ​L​​S​​K​​E​​G​​G​​F​​A​​A​​R​142  ​H​​L​​L​​T​​S​​K​​S​​G​​V​​A​152  ​V​​H​​I​​N​​A​​F​​N​​F​​P​​C​162  ​W​​G​​M​​L​​E​​K​​L​​A​​P​​T​172  ​W​​L​​G​​G​​M​​P​​A​​I​​I​​K​182  ​P​​A​​T​​A​​T​​A​​Q​​L​​T​​Q​192  ​A​​M​​V​​K​​S​​I​​V​​D​​S​​G​202  ​L​​V​​P​​E​​G​​A​​I​​S​​L​​I​212  ​C​​G​​S​​A​​G​​D​​L​​L​​D​​H​222  ​L​​D​​S​​Q​​D​​V​​V​​T​​F​​T​232  ​G​​S​​A​​A​​T​​G​​Q​​M​​L​​R​242  ​V​​Q​​P​​N​​I​​V​​A​​K​​S​​I​252  ​P​​F​​T​​M​​E​​A​​D​​S​​L​​N​262  ​C​​C​​V​​L​​G​​E​​D​​V​​T​​P​272  ​D​​Q​​P​​E​​F​​A​​L​​F​​I​​R​282  ​E​​V​​V​​R​​E​​M​​T​​T​​K​​A​292  ​G​​Q​​K​​C​​T​​A​​I​​R​​R​​I​302  ​I​​V​​P​​Q​​A​​L​​V​​N​​A​​V​312  ​S​​D​​A​​L​​V​​A​​R​​L​​Q​​K​322  ​V​​V​​V​​G​​D​​P​​A​​Q​​E​​G​332  ​V​​K​​M​​G​​A​​L​​V​​N​​A​​E​342  ​Q​​R​​A​​D​​V​​Q​​E​​K​​V​​N​352  ​I​​L​​L​​A​​A​​G​​C​​E​​I​​R​362  ​L​​G​​G​​Q​​A​​D​​L​​S​​A​​A​372  ​G​​A​​F​​F​​P​​P​​T​​L​​L​​Y​382  ​C​​P​​Q​​P​​D​​E​​T​​P​​A​​V​392  ​H​​A​​T​​E​​A​​F​​G​​P​​V​​A​402  ​T​​L​​M​​P​​A​​Q​​N​​Q​​R​​H​412  ​A​​L​​Q​​L​​A​​C​​A​​G​​G​​G​422  ​S​​L​​A​​G​​T​​L​​V​​T​​A​​D​432  ​P​​Q​​I​​A​​R​​Q​​F​​I​​A​​D​442  ​A​​A​​R​​T​​H​​G​​R​​I​​Q​​I​452  ​L​​N​​E​​E​​S​​A​​K​​E​​S​​T​462  ​G​​H​​G​​S​​P​​L​​P​​Q​​L​​V​472  ​H​​G​​G​​P​​G​​R​​A​​G​​G​​G​482  ​E​​E​​L​​G​​G​​L​​R​​A​​V​​K​492  ​H​​Y​​M​​Q​​R​​T​​A​​V​​Q​​G​502  ​S​​P​​T​​M​​L​​A​​A​​I​​S​​K​512  ​Q​​W​​V​​R​​G​​A​​K​​V​​E​​E​522  ​D​​R​​I​​H​​P​​F​​R​​K​​Y​​F​532  ​E​​E​​L​​Q​​P​​G​​D​​S​​L​​L​542  ​T​​P​​R​​R​​T​​M​​T​​E​​A​​D​552  ​I​​V​​N​​F​​A​​C​​L​​S​​G​​D​562  ​H​​F​​Y​​A​​H​​M​​D​​K​​I​​A​572  ​A​​A​​E​​S​​I​​F​​G​​E​​R​​V​582  ​V​​H​​G​​Y​​F​​V​​L​​S​​A​​A​592  ​A​​G​​L​​F​​V​​D​​A​​G​​V​​G​602  ​P​​V​​I​​A​​N​​Y​​G​​L​​E​​S​612  ​L​​R​​F​​I​​E​​P​​V​​K​​P​​G​622  ​D​​T​​I​​Q​​V​​R​​L​​T​​C​​K​632  ​R​​K​​T​​L​​K​​K​​Q​​R​​S​​A​642  ​E​​E​​K​​P​​T​​G​​V​​V​​E​​W​652  ​A​​V​​E​​V​​F​​N​​Q​​H​​Q​​T​662  ​P​​V​​A​​L​​Y​​S​​I​​L​​T​​L​672  ​V​​A​​R​​Q​​H​​G​​D​​F​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: 0.11 .. 1.22
0.11
1.22
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[ATOM]
1
2
GLN
0.53
2
3
GLN
0.43
3
4
LEU
0.35
4
5
ALA
0.36
5
6
SER
0.31
6
7
PHE
0.36
7
8
LEU
0.32
8
9
SER
0.37
9
10
GLY
0.41
10
11
THR
0.47
11
12
TRP
0.39
12
13
GLN
0.40
13
14
SER
0.51
14
15
GLY
0.50
15
16
ARG
0.50
16
17
GLY
0.49
17
18
ARG
0.42
18
19
SER
0.41
19
20
ARG
0.38
20
21
LEU
0.38
21
22
ILE
0.45
22
23
HIS
0.47
23
24
HIS
0.48
24
25
ALA
0.54
25
26
ILE
0.56
26
27
SER
0.63
27
28
GLY
0.63
28
29
GLU
0.53
29
30
ALA
0.36
30
31
LEU
0.51
31
32
TRP
0.50
32
33
GLU
0.50
3D View
Download PDB file DAQ[SS]
Download Secondary Structure Prediction file
Render Map
Converting to mmCIF
SequenceNo structure available
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -1.77 .. 1.04
-1.77
1.04
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[SS]
1
2
GLN
-1.77
2
3
GLN
-1.59
3
4
LEU
-1.42
4
5
ALA
-1.31
5
6
SER
-1.19
6
7
PHE
-1.09
7
8
LEU
-0.99
8
9
SER
-0.94
9
10
GLY
-0.97
10
11
THR
-0.86
11
12
TRP
-0.64
12
13
GLN
-0.45
13
14
SER
-0.19
14
15
GLY
-0.04
15
16
ARG
0.01
16
17
GLY
0.17
17
18
ARG
0.27
18
19
SER
0.33
19
20
ARG
0.33
20
21
LEU
0.34
21
22
ILE
0.25
22
23
HIS
0.28
23
24
HIS
0.35
24
25
ALA
0.34
25
26
ILE
0.32
26
27
SER
0.30
27
28
GLY
0.31
28
29
GLU
0.39
29
30
ALA
0.34
30
31
LEU
0.29
31
32
TRP
0.28
32
33
GLU
0.24
3D View
Download PDB file DAQ[Total]
Render Map
Sequence of
2    ​Q​​Q​​L​​A​​S​​F​​L​​S​​G​​T​12   ​W​​Q​​S​​G​​R​​G​​R​​S​​R​​L​22   ​I​​H​​H​​A​​I​​S​​G​​E​​A​​L​32   ​W​​E​​V​​T​​S​​E​​G​​L​​D​​M​42   ​A​​A​​A​​R​​Q​​F​​A​​I​​E​​K​52   ​G​​A​​P​​A​​L​​R​​A​​M​​T​​F​62   ​I​​E​​R​​A​​A​​M​​L​​K​​A​​V​72   ​A​​K​​H​​L​​L​​S​​E​​K​​E​​R​82   ​F​​Y​​A​​L​​S​​A​​Q​​T​​G​​A​92   ​T​​R​​A​​D​​S​​W​​V​​D​​I​​E​102  ​G​​G​​I​​G​​T​​L​​F​​T​​Y​​A​112  ​S​​L​​G​​S​​R​​E​​L​​P​​D​​D​122  ​T​​L​​W​​P​​E​​D​​E​​L​​I​​P​132  ​L​​S​​K​​E​​G​​G​​F​​A​​A​​R​142  ​H​​L​​L​​T​​S​​K​​S​​G​​V​​A​152  ​V​​H​​I​​N​​A​​F​​N​​F​​P​​C​162  ​W​​G​​M​​L​​E​​K​​L​​A​​P​​T​172  ​W​​L​​G​​G​​M​​P​​A​​I​​I​​K​182  ​P​​A​​T​​A​​T​​A​​Q​​L​​T​​Q​192  ​A​​M​​V​​K​​S​​I​​V​​D​​S​​G​202  ​L​​V​​P​​E​​G​​A​​I​​S​​L​​I​212  ​C​​G​​S​​A​​G​​D​​L​​L​​D​​H​222  ​L​​D​​S​​Q​​D​​V​​V​​T​​F​​T​232  ​G​​S​​A​​A​​T​​G​​Q​​M​​L​​R​242  ​V​​Q​​P​​N​​I​​V​​A​​K​​S​​I​252  ​P​​F​​T​​M​​E​​A​​D​​S​​L​​N​262  ​C​​C​​V​​L​​G​​E​​D​​V​​T​​P​272  ​D​​Q​​P​​E​​F​​A​​L​​F​​I​​R​282  ​E​​V​​V​​R​​E​​M​​T​​T​​K​​A​292  ​G​​Q​​K​​C​​T​​A​​I​​R​​R​​I​302  ​I​​V​​P​​Q​​A​​L​​V​​N​​A​​V​312  ​S​​D​​A​​L​​V​​A​​R​​L​​Q​​K​322  ​V​​V​​V​​G​​D​​P​​A​​Q​​E​​G​332  ​V​​K​​M​​G​​A​​L​​V​​N​​A​​E​342  ​Q​​R​​A​​D​​V​​Q​​E​​K​​V​​N​352  ​I​​L​​L​​A​​A​​G​​C​​E​​I​​R​362  ​L​​G​​G​​Q​​A​​D​​L​​S​​A​​A​372  ​G​​A​​F​​F​​P​​P​​T​​L​​L​​Y​382  ​C​​P​​Q​​P​​D​​E​​T​​P​​A​​V​392  ​H​​A​​T​​E​​A​​F​​G​​P​​V​​A​402  ​T​​L​​M​​P​​A​​Q​​N​​Q​​R​​H​412  ​A​​L​​Q​​L​​A​​C​​A​​G​​G​​G​422  ​S​​L​​A​​G​​T​​L​​V​​T​​A​​D​432  ​P​​Q​​I​​A​​R​​Q​​F​​I​​A​​D​442  ​A​​A​​R​​T​​H​​G​​R​​I​​Q​​I​452  ​L​​N​​E​​E​​S​​A​​K​​E​​S​​T​462  ​G​​H​​G​​S​​P​​L​​P​​Q​​L​​V​472  ​H​​G​​G​​P​​G​​R​​A​​G​​G​​G​482  ​E​​E​​L​​G​​G​​L​​R​​A​​V​​K​492  ​H​​Y​​M​​Q​​R​​T​​A​​V​​Q​​G​502  ​S​​P​​T​​M​​L​​A​​A​​I​​S​​K​512  ​Q​​W​​V​​R​​G​​A​​K​​V​​E​​E​522  ​D​​R​​I​​H​​P​​F​​R​​K​​Y​​F​532  ​E​​E​​L​​Q​​P​​G​​D​​S​​L​​L​542  ​T​​P​​R​​R​​T​​M​​T​​E​​A​​D​552  ​I​​V​​N​​F​​A​​C​​L​​S​​G​​D​562  ​H​​F​​Y​​A​​H​​M​​D​​K​​I​​A​572  ​A​​A​​E​​S​​I​​F​​G​​E​​R​​V​582  ​V​​H​​G​​Y​​F​​V​​L​​S​​A​​A​592  ​A​​G​​L​​F​​V​​D​​A​​G​​V​​G​602  ​P​​V​​I​​A​​N​​Y​​G​​L​​E​​S​612  ​L​​R​​F​​I​​E​​P​​V​​K​​P​​G​622  ​D​​T​​I​​Q​​V​​R​​L​​T​​C​​K​632  ​R​​K​​T​​L​​K​​K​​Q​​R​​S​​A​642  ​E​​E​​K​​P​​T​​G​​V​​V​​E​​W​652  ​A​​V​​E​​V​​F​​N​​Q​​H​​Q​​T​662  ​P​​V​​A​​L​​Y​​S​​I​​L​​T​​L​672  ​V​​A​​R​​Q​​H​​G​​D​​F​
colorbar

DAQ Score Table

Score range in the table: -0.41 .. 3.23
-0.41
3.23
#
Residue identifier
Residue name
DAQscore[Total]
1
2
GLN
-0.41
2
3
GLN
-0.24
3
4
LEU
-0.11
4
5
ALA
0.00
5
6
SER
0.11
6
7
PHE
0.12
7
8
LEU
0.22
8
9
SER
0.31
9
10
GLY
0.31
10
11
THR
0.54
11
12
TRP
0.65
12
13
GLN
0.76
13
14
SER
1.11
14
15
GLY
1.26
15
16
ARG
1.33
16
17
GLY
1.44
17
18
ARG
1.41
18
19
SER
1.48
19
20
ARG
1.40
20
21
LEU
1.41
21
22
ILE
1.24
22
23
HIS
1.33
23
24
HIS
1.39
24
25
ALA
1.41
25
26
ILE
1.52
26
27
SER
1.51
27
28
GLY
1.51
28
29
GLU
1.44
29
30
ALA
1.15
30
31
LEU
1.34
31
32
TRP
1.41
32
33
GLU
1.40